Verbesserungwürdig ?

[Arnim Weber]

Sagt mal deuten die schlechten RMSD-Werte gerade bei dem zu Zeit berechneten Protein nicht auf einen "schlechten" Algorithmus hin ? Sieht so aus, als ob er eher für kleinere Proteine taugt, oder ?

[BaRu]

Schwer zu sagen, kann auch an dem Protein liegen.
Vieleicht mag es nicht so gern gefaltet werden...

Die Power Cows haben uns gnadenlos überholt
grummel....

[Sven]

Hi BaRu!

Kann es sein das Du DistributedFolding mit Folding@Home verwechselst?

Tschüs, Sven.

[BaRu]

wieso ?
ich kann dir nicht ganz folgen...

gruss
Rüdiger

[S_Garbe]

@Sven - kann eigentlich auch nicht sein, denn da sind wir grad dabei die Kraftkühe einzuholen
die einzige Stelle von der ich weiß das wir von denen überholt wurden ist D2OL

Gruß
Stefan

[BaRu]

Hm, du kannst es mir jetzt glauben oder nicht - als ich mich vor ner 1/2 std. eingeloggt habe standen wir auf 9 ! hab es grad noch mal überprüft, jetzt ist es wieder platz 8. puh, und ich dacht schon - muss wohl ein fehler in der statistik gewesen sein. weil so blind bin ich noch nicht...

rüdiger

[Gast]

Hi ihr Zwei!

Welches Projekt, welche Statistikseite dazu?

Und blind würde ich Dich ja nicht gleich nennen, aber es gibt das Problem der selektiven Wahrnehmung Und das Problem der mißverstandenen Statistik (weil man nicht in die Erläuterungen sieht, z.B. bei Den), bin ja selbst manchmal so´n Patient.

Tschüs, Sven.

[Michael H.W. Weber]

Sagt mal deuten die schlechten RMSD-Werte gerade bei dem zu Zeit berechneten Protein nicht auf einen "schlechten" Algorithmus hin ? Sieht so aus, als ob er eher für kleinere Proteine taugt, oder ?

Das hast Du korrekt beobachtet! Alle bisher untersuchten Testproteine größer als 36 Aminosäuren lieferten RMSDs um 5 - das ist nicht gerade berauschend - während die kleineren deutlich bessere RMSDs lieferten (sowas um 3). Jetzt nach dem Wochenende wird ja auf noch größere Proteine umgestellt und auch wird der Client angepaßt worden sein. Wir wollen mal sehen, wie es mit den RMSDs aussieht - ob der Trend zu noch größeren RMSDs bestehen bleibt? Wir sollten Wetten abschliessen, hehehehe... Ich tippe auf die Formel: größeres Protein, größerer RMSD - hoffe aber, daß Howard mich überrascht und das Gegenteil der Fall ist. Nicht vergessen: alles bisherige ist Testlauf!

Also: dranbleiben und ranfalten auf daß den Kühen die Milch ausgeht
Michael.

[Arnim Weber]

Die Kühe sind doch sowieso weit hinter uns. Ich verstehe also die ganze Aufregung nicht. Wir sind ein starkes Team !!!