Eine Ewigkeit für DC/2003 Verhältnisse

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
Nachricht
Autor
HuiBu

Eine Ewigkeit für DC/2003 Verhältnisse

#1 Ungelesener Beitrag von HuiBu » 24.06.2003 11:52

Sacht mal, kann das denn sein, laut Arachnid (Projekt Stats) eiern wir mit dem aktuellen Protein noch bis Ende des Jahres umher. Stimmt denn da noch das Verhältniss von Recheneinsatz (ein halbes Jahr DC-Power) zu Nutzen? :(

Bis dann, Huibu.

Benutzeravatar
Michael H.W. Weber
Vereinsvorstand
Vereinsvorstand
Beiträge: 23168
Registriert: 07.01.2002 01:00
Wohnort: Marpurk

Re: Eine Ewigkeit für DC/2003 Verhältnisse

#2 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 24.06.2003 12:46

HuiBu hat geschrieben:Sacht mal, kann das denn sein, laut Arachnid (Projekt Stats) eiern wir mit dem aktuellen Protein noch bis Ende des Jahres umher. Stimmt denn da noch das Verhältniss von Recheneinsatz (ein halbes Jahr DC-Power) zu Nutzen? :(
Nein, da würde es sicher nicht mehr stimmen. :attention: Ich gehe aber davon aus, daß das Protein DEUTLICH früher gewechselt wird. Der RMSD ist ja auch schon jetzt deutlich besser als viele der vorangegangenen. Ich rechne auf jeden Fall damit, daß demnächst noch einige Änderungen bei diesem Projekt kommen werden (10 Milliarden Strukturen hält meinereiner für definitiven Schwachfug).

Michael.
Fördern, kooperieren und konstruieren statt fordern, konkurrieren und konsumieren.

Bild Bild

Benutzeravatar
exec
Projekt-Fetischist
Projekt-Fetischist
Beiträge: 604
Registriert: 28.04.2002 10:55
Wohnort: München

#3 Ungelesener Beitrag von exec » 24.06.2003 15:54

Ich denke, dass 5000 Str. reichen dürften.
Bild
Aktive Projekte: Seventeen or Bust
Einstige Projekte: TSC, DF, D2OL, Seti@Home, MD@Home

Benutzeravatar
Patrick Keller
Vereinsmitglied
Vereinsmitglied
Beiträge: 1202
Registriert: 25.03.2003 15:06
Wohnort: Mainz

#4 Ungelesener Beitrag von Patrick Keller » 24.06.2003 16:02

Insgesamt 5000 Strukturen ??? das wäre aber ein bissl wenig :) Selbst 5000 Generationen dürften bereits durch sein ...
Mal ne Frage: Gibt die "Total Work done"-Strukturen oder Punkte wieder ?

Benutzeravatar
Michael H.W. Weber
Vereinsvorstand
Vereinsvorstand
Beiträge: 23168
Registriert: 07.01.2002 01:00
Wohnort: Marpurk

#5 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 24.06.2003 16:04

Keller hat geschrieben:Mal ne Frage: Gibt die "Total Work done"-Strukturen oder Punkte wieder ?
Punkte, denke ich. Daher meines Erachtens eine reichlich überflüssige Spalte in den Statistiken.

Michael.
Fördern, kooperieren und konstruieren statt fordern, konkurrieren und konsumieren.

Bild Bild

Benutzeravatar
Patrick Keller
Vereinsmitglied
Vereinsmitglied
Beiträge: 1202
Registriert: 25.03.2003 15:06
Wohnort: Mainz

#6 Ungelesener Beitrag von Patrick Keller » 24.06.2003 16:09

Naja ... nicht unnützer als die Strukturen Angabe aus Phase I.
Je mehr Punkte es gibt, desto besser werden die Ergebnisse. Je mehr Strukturen es gab, desto besser wurden die Ergebnisse.
Also ... ich schätze dann einfach mal auf 2,5 Milliarden Punkte..

Benutzeravatar
Michael H.W. Weber
Vereinsvorstand
Vereinsvorstand
Beiträge: 23168
Registriert: 07.01.2002 01:00
Wohnort: Marpurk

#7 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 24.06.2003 16:23

Kann nicht ganz folgen. Je höher die aktuelle Generationszahl ist, desto mehr Punkte gibt es. Das ist zwar wünschenswerter Weise mit niedrigerem RMSD verbunden, nicht aber notwendigerweise praktische Wirklichkeit. :attention: Mehr noch: Das ursprüngliche Ansinnen von Herrn Dr. Feldman, durch bessere Bepunktung die Leute dazu zu animieren, höhere Generationen rechnen zu lassen, ist nach meinen Abschätzungen wohl eher eine Ente. Jedenfalls habe ich nicht den Eindruck, daß die bei hoher Generation vergebenen Mehrpunkte das ständige "tigh spot"-Stocken auch nur im Ansatz aufwiegen können. :argue:

Michael.
Fördern, kooperieren und konstruieren statt fordern, konkurrieren und konsumieren.

Bild Bild

Benutzeravatar
Patrick Keller
Vereinsmitglied
Vereinsmitglied
Beiträge: 1202
Registriert: 25.03.2003 15:06
Wohnort: Mainz

#8 Ungelesener Beitrag von Patrick Keller » 24.06.2003 16:25

Ich wollte damit sagen, dass die höhere Generationenzahl genauso wenig einen besseren RMSD verspricht, wie es eine höhere Strukturenzahl tut ...
ERGO: Die Anzeige mit Punkten ist so schwachsinnig wie die mit Strukturen

Benutzeravatar
Michael H.W. Weber
Vereinsvorstand
Vereinsvorstand
Beiträge: 23168
Registriert: 07.01.2002 01:00
Wohnort: Marpurk

#9 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 24.06.2003 19:48

Keller hat geschrieben:Ich wollte damit sagen, dass die höhere Generationenzahl genauso wenig einen besseren RMSD verspricht, wie es eine höhere Strukturenzahl tut ...
Da muß ich teilweise wenigstens widersprechen. Ich habe schon den Eindruck, daß der neue Algorithmus eher zu einem niedrigeren RMSD führt, als es bei dem "Hau-Drauf-Zufallgerechne" (DF Phase I - man habe sie seelig) bislang der Fall war.
Keller hat geschrieben:ERGO: Die Anzeige mit Punkten ist so schwachsinnig wie die mit Strukturen
Meine "Schwachfug-Einschätzung" :lol: bezog sich eher auf die Tatsache, daß dort in den jetzigen Statistiken zwei identische Spalten abgebildet sind. Den Mist muß ich schließlich runterladen.

Michael.
Fördern, kooperieren und konstruieren statt fordern, konkurrieren und konsumieren.

Bild Bild

Zurück zu „Protein- und Nukleinsäureforschung“