FAH/GAH Neuigkeiten

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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Michael H.W. Weber
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FAH/GAH Neuigkeiten

#1 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 26.09.2002 11:40

Also ich habe in den letzten 3 Wochen kein einziges Mal das FAH/GAH-Originalforum besucht und mußte heute feststellen, daß ich die inzwischen eingetrudelten Informationen beim besten Willen nicht mehr aufarbeiten kann. :cry2: Kein Wunder bei ca. 2-3 Bildschirmseiten neuer THREADS pro Tag. :o (ihr könnt ja selber mal errechnen, was mich heute erschlug, als ich mich wieder ins Forum getraut habe - bis zum "timeout" der "Nachrichten nach letztem Login"-Anzeige habe ich brav gelesen, dann war's vorbei und meine Seele hatte Ruh'...)

Immerhin gibt es nun die ersten Publikationen zu Genome@Home und zwar in Protein Science, welches ein recht angesehenes Magazin ist! Details findet ihr hier: http://gah.stanford.edu/new.html

Weiterhin haben einige Messungen der CPU- und MoBo-Temperaturen nun wohl wie erwartet ergeben, daß der "GROMACS core" einen höheren Stromverbrauch und also eine höhere Abwärme zur Folge hat, als die unter TINKER berechneten WUs. Das erklärt wohl auch, warum "overclocker" in FAH nun ihren Meister gefunden haben. Prime95 kann demnach ab sofort NICHT mehr als Maß aller Dinge zur Stabilitätskontrolle von übertakteten Systemen dienen und dürfte nun wohl durch FAH ersetzt werden (zumindest bei denen, die vorhaben ihre übertakteten Systeme verläßlich mit FAH zum Laufen zu bringen).

Es sind seit meiner Abwesenheit einige neue FAH-Versionen ins Land gezogen, die etliche Verbesserungen haben, sodaß ich nur wärmstens empfehlen kann, mal zu aktualisieren. Auch laufen inzwischen die ersten "echten", also nicht-Test-WUs von GAH unter dem neuen FAH/GAH-Kombiklienten. Sogar das "cross-crediting" scheint nun zu funktionieren, d.h. wer bei der Installation von FAH3.xx eine FAH-Teamnummer eingetragen hat, der bekommt die "credits" stets auf dieses "Konto" überwiesen, egal, ob eine FAH oder GAH WU berechnet wurde. Letzteres läßt sich in den "preferences" einstellen und es sei nochmals darauf hingewiesen, daß eine WU des jeweils anderen Projekts immer dann geladen wird, wenn alle Server des präferierten Projekts "down" sind. Also nicht wundern, wenn mal eine GAH WU berechnet wurde, obwohl doch FAH-Vorzug eingestellt ist.

Das kontinuierliche Herunterladen des "GROMACS cores" sowie das Ausbleiben des Fortführens des Haupt-FAHlogs, welches ich u.a. bei meinen GROMACS-Betatesteraktivitäten entdeckt hatte, soll nun auch behoben sein - Gott sei es gedankt.

National Georgraphic hat den FAH-Projektleitern angeboten, ihr komplettes Fotoarchiv in den Screensaver zu integrieren. Stößt das bei euch auf Interesse? Im Augenblick scheint der Trend der zu sein, daß viele Leute es für nicht projektbezogen genug halten - auch wenn die Bildchen nett anzuschauen sind - weshalb man wohl eher Abstand halten will. Jemand hat auch vorgeschlagen, es als optionalen Download anzubieten - sozusagen als externe Erweiterung auf Wunsch.

Michael.
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Michael H.W. Weber
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#2 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 08.10.2002 16:01

Die neuste Version des FAH-Monitors EMIII v2.0 erfaßt nun auch GAH2 WUs: http://home.attbi.com/~wxdude1/emsite/download.html

GAH2 - also der neue GAH "core" im FAH3.xx Client - basiert auf einem anderen Algorithmus als der 0.99er "classical" Client und benötigt für dieselbe WU meßbar länger. Bis dies behoben ist, schlage ich auch weiterhin vor, den alten Client weiter zu benutzen.

Die Berechnung der FAH WUs auf Basis des GROMACS "cores" hat bekanntlich auf einigen System zu Instabilitäten geführt. Diese wurden bislang bei übertakteten Systemen u.a. auf eine leicht erhöhte CPU-Temperatur beim Laufenlassen dieses Clients zurückgeführt. Tatsächlich führte in den meisten Fällen eine Reduktion der überhöhten Frequenzen zu stabilen Systemen. Allerdings betrug die gemessene Temperaturerhöhung bloß ca. 1-2°C - eigentlich zuwenig, um einen Absturz des Systems zu verursachen, sofern man eine halbwegs brauchbare Kühlung im Einsatz hat. Nun stellte sich bei neuen Untersuchungen heraus, daß oft ein zu rascher RAM-Zugriff die eigentliche Ursache ist. Wer also mit GROMACS Probleme hat, sollte mal versuchen, das RAM "timing" von 2-2-2 schrittweise herabzusetzen.

Michael.
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Sascha_Luehrs

#3 Ungelesener Beitrag von Sascha_Luehrs » 08.10.2002 20:00

Michael H.W. Weber hat geschrieben:GAH2 - also der neue GAH "core" im FAH3.xx Client - basiert auf einem anderen Algorithmus als der 0.99er "classical" Client und benötigt für dieselbe WU meßbar länger. Bis dies behoben ist, schlage ich auch weiterhin vor, den alten Client weiter zu benutzen.
Wie ist das eigentlich, kann man eigentlich erwarten, daß die Ergebnisse von FAH und GAH WUs auch immer authentisch/richtig sind?
Es wurde glaube ich vor langer Zeit auf der Genome@Home-Webseite auch mal gesagt, alle G@H-Client-Versionen unter Version 2.0 (also auch g@h-Classic, was die umbenannte 0.99er-Version ist) seien als Testversionen anzusehen. Ist das nicht mehr so? Ich meine, ich glaube gelesen zu haben, das nicht mehr so ist, auf der andern Seite steht das glaube ich aber immer noch irgendwo auf der g@h-Seite *grübel*

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Michael H.W. Weber
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#4 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 08.10.2002 21:15

Sascha_Luehrs hat geschrieben:Es wurde glaube ich vor langer Zeit auf der Genome@Home-Webseite auch mal gesagt, alle G@H-Client-Versionen unter Version 2.0 (also auch g@h-Classic, was die umbenannte 0.99er-Version ist) seien als Testversionen anzusehen.
Nein, der GAH "classic" Client war niemals eine Testversion. Die Ergebnisse wurden auf der Website veröffentlicht und inzwischen ist auch das erste Manuskript eingereicht und akzeptiert worden. Das entsprechende Vorab-PDF ist von der GAH-Seite herunterladbar.
Worauf Du anspielst, sind vermutlich die Duplikate, die eine Zeit lang von einigen produziert und später "discarded" wurden.

Der "alte" Client liefert auch nach wie vor satt Ergebnisse und ich lasse ihn immer wieder laufen, da er EXTREM zuverlässig läuft.

Michael.
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Gast

#5 Ungelesener Beitrag von Gast » 08.10.2002 21:47

Michael H.W. Weber hat geschrieben:
Sascha_Luehrs hat geschrieben:Es wurde glaube ich vor langer Zeit auf der Genome@Home-Webseite auch mal gesagt, alle G@H-Client-Versionen unter Version 2.0 (also auch g@h-Classic, was die umbenannte 0.99er-Version ist) seien als Testversionen anzusehen.
Nein, der GAH "classic" Client war niemals eine Testversion.
Hmm.. also ich kann zumindest jetzt bestätigen, daß es auf der Genome@Home-Homepage offenbar nicht steht. Aber auf http://www.rechenkraft.net/project.php?id=genome , steht (Zitat): "Alle Client-Versionen kleiner als 2.0 gelten als Test-Clients."
- Ich meine, wenn Du nun sagst, daß das nicht stimmt, glaube ich Dir das natürlich sowieso. -
Ich stell das eben nur fest, daß das da steht *triumphier-ohne-wirklich-zu-wissen-warum* :D
Naja, macht ja nix :wink:
Der "alte" Client liefert auch nach wie vor satt Ergebnisse und ich lasse ihn immer wieder laufen, da er EXTREM zuverlässig läuft.
Michael.
Ich werde dann wohl wieder auf den Classic-Client zurück umsteigen.

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