Rosetta-News

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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cappy
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Re: Rosetta-News

#241 Ungelesener Beitrag von cappy » 30.04.2009 21:05

es gibt eine neue Minirosetta version 1.64
We've got a new minirosetta version, with some infrastructure changes and a new protocol for using experimental data from NMR.
google übersetzung
Wir haben eine neue Version minirosetta, mit einigen Änderungen der Infrastruktur und ein neues Protokoll für die Verwendung von experimentellen Daten ausm NMR.
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cappy
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Re: Rosetta-News

#242 Ungelesener Beitrag von cappy » 04.05.2009 12:34

ein neuer beitrag aus dem journal
We just found a source of flu surface protein closely related to that on the strain making headlines in the last few days, and are starting to design tight binding inhibitors that target a site where the flu virus can't change. We will keep you posted as these design work units are sent out on rosetta@home. Fortunately, it seems that there may have been a bit of a false alarm with the flu in this case, but it is a good test case for us as we ultimately aim, with your help, to be able to design blockers to new pathogens within a relatively short time.
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Michael H.W. Weber
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Re: Rosetta-News

#243 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 04.05.2009 17:42

...in Kürze mit Würze: Doc Baker & Kollegen machen sich an das Schweinegrippevirus ran. :evil2: Will heißen, sie haben sich ein Oberflächenprotein des Viruspartikels geschnappt und basteln an Inhibitoren herum.

Michael.
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cappy
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Re: Rosetta-News

#244 Ungelesener Beitrag von cappy » 04.05.2009 18:04

die version 1.65 ist raus hier das changelog
1.65 was released. This is a high-priority patch that should fix a problem with the uploads.
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scsimodo
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Re: Rosetta-News

#245 Ungelesener Beitrag von scsimodo » 04.05.2009 21:23

Michael H.W. Weber hat geschrieben:...in Kürze mit Würze: Doc Baker & Kollegen machen sich an das Schweinegrippevirus ran. :evil2: Will heißen, sie haben sich ein Oberflächenprotein des Viruspartikels geschnappt und basteln an Inhibitoren herum.
Ich frag jetzt mal bewusst ketzerisch: Ist das wieder so eine "hysterische" oder "populäre" Aktion? Wieviel Opfer hat denn diese "Mördergrippe" schon gefordert? 100? 200? 500? 1000?. Jede "normale" Wintergrippe kostet allein in Deutschland bis zu 2000 (oder sogar noch mehr) Menschen das Leben. Infizierte im zweistelligen Bereich? Was haben wir gelacht. Jeder Infizierte (zumindest in Deutschland) hatte keine ernsthaften oder lebensbedrohlichen Krankheitssymptome.In Kanada hat ein Bauer seine Schweine angesteckt, die Meldung geht um die Welt, die Schweine interessiert das nicht die Bohne, die leben immer noch und sind gesund. Diejenigen, die hier die wirkliche Panik machen sind wohl die Ärzte und Pharmafirmen. Ist ja schliesslich Rezession. :)

Bin ich nur abgestumpft und erkenne den Ernst der Lage nicht? Oder sehe ich das richtig so? Und ja, ich habe "The Stand" gelesen, manchmal komme ich mir aber vor, als würde "Captain Tripps" direkt vor meiner Haustür stehen und ich bin verdammt, wenn ich nicht sofort nen Mundschutz anlege, "Hosianna" singe, mir ne tote Katze über den Buckel hänge und meine Lidl leerkaufe, um das alles in meinem keller zu bunkern.

Medikamente können nichts, was 10 gut gemischte Cuba Libre nicht auch könnten :)
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Re: Rosetta-News

#246 Ungelesener Beitrag von Dennis Kautz » 04.05.2009 21:31

Das Problem mit der Schweinegrippe ist, dass der Virus wohl hochflexibel ist. Im Moment ist er relativ harmlos, verbreitet sich aber schnell. Bei der Vogelgrippe war's umgekehrt. Das Risiko, dass der Erreger mutiert und aggressiver wird, ist aber wegen seiner Flexibilität ziemlich hoch. Und in einem solchen Fall halte ich es für sinnvoll, lieber einmal übervorsichtig zu sein, als zu sorglos.

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Re: Rosetta-News

#247 Ungelesener Beitrag von vfrey » 04.05.2009 21:33

scsimodo hat geschrieben:Ich frag jetzt mal bewusst ketzerisch: Ist das wieder so eine "hysterische" oder "populäre" Aktion?
gute Frage. David Baker hat offenbar genauso wie Vijay Pande generell eine Idee von guter PR. Das fehlt den Kollegen von POEM leider völlig...
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Re: Rosetta-News

#248 Ungelesener Beitrag von scsimodo » 04.05.2009 21:52

frost hat geschrieben:Und in einem solchen Fall halte ich es für sinnvoll, lieber einmal übervorsichtig zu sein, als zu sorglos.
Ja schon, aber... Sowas haben wir jedes Jahr, und zwar in wesentlich schlimmerer "Qualität". Eine Wintergrippe ist ein Desaster im Vergleich zur Schweine-/Mexico-Grippe. Warum schiebt da keiner Panik? Dieser Virus kann sich auch von heute auf morgen verselbständigen. Das kann theoretisch jeder Virus. Nur jetzt wird wieder eine Panik gemacht, dass es nicht mehr lustig ist:

http://www.spiegel.de/panorama/0,1518,622731,00.html

Wenn das Ding wirklich gefährlich wäre nimmt es doch inzwischen keiner mehr ernst. Man kann es schliesslich übertreiben
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Re: Rosetta-News

#249 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 05.05.2009 10:19

Ich wäre da mal vorsichtig, ob da nicht noch was nachkommt und bin froh, daß schnell gewarnt wurde. Hätte alles auch anders kommen können und kann es auch noch...

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Re: Rosetta-News

#250 Ungelesener Beitrag von X1900AIW » 05.05.2009 12:20

Gesterm kam im Fernsehen Das Imperium der Viren Teil 1, der Vergleich mit der Spanischen Grippe im 1. Weltkrieg hat mich doch erschreckt, bei Entdeckung starben nur wenige Menschen, zwei Jahre später waren es dann (die im Text genannten) 50 Millionen (hab irgendwie 25 in Erinnerung), die Viren-Experten meinten, das Virus "nehme Anlauf", damals wie heute. :o

Andererseits haben ja Vertreter dieser amerikanischen Eingreiftruppe gesagt, niemand wisse wann und wo mit einer Pandemie zu rechnen sei, aber das eine kommt, wird eben erwartet. Schlimm heute in der Zeitung über das Töten von Schweinen zu lesen, das die christliche Minderheit trifft, wieder ein irrationaler Glaubenskrieg mehr auf dem Rücken der Ratlosigkeit.
Zusammenkommen ist ein Beginn, Zusammenbleiben ist ein Fortschritt, Zusammenarbeiten ist ein Erfolg.
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Re: Rosetta-News

#251 Ungelesener Beitrag von cappy » 09.05.2009 20:08

die minirosetta version 1.67 ist raus hier das changelog
Version 1.67 has a nifty new threading mode built in. And corrects some of the validator problems people have reported in prior releases.
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Re: Rosetta-News

#252 Ungelesener Beitrag von cappy » 20.05.2009 04:37

eine news also nicht wundern heute ;)
Outage Notice: the project will be down for maintenance starting at around 11:00AM PST tomorrow the 20th. It may take a few hours. We will be replacing some memory for our database server and doing a full backup of the database.
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