CASP7 - noch wer ???

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Bommer · #1 Ungelesener Beitrag von **Bommer** » 27.05.2006 18:00

Hallo

Welcher Projektbetreiber ausser Rosetta@home nimmt eigentlich noch an CASP7 teil ???

Beim letzten mal wars auch noch DISTRIBUTEDFOLDING.ORG dabei, aber die machen ja momentan nichts mehr.

Hat wer Infos ???

Gruss Bommer

#2 Ungelesener Beitrag von **Michael H.W. Weber** » 28.05.2006 13:25

Meines Wissens ist diesmal außer Rosetta@home kein weiteres dc Projekt dabei. Letztes mal (CASP6) war Predictor@home dabei.

Michael.

Bommer · #3 Ungelesener Beitrag von **Bommer** » 28.05.2006 15:22

Hallo

Na, dann wird ja der Rosetta-Algorythmus der Beste sein mit dem besten Ergebnis. Wenns ja keine Alternativen gibt.

Oder was sonst zählt bei CASP 7 ????

Gruss Bommer

Hermes · #4 Ungelesener Beitrag von **Hermes** » 28.05.2006 23:34

Bommer hat geschrieben:Hallo

Na, dann wird ja der Rosetta-Algorythmus der Beste sein mit dem besten Ergebnis. Wenns ja keine Alternativen gibt.

Genauso, wie DF damals CASP5 "gewonnen" hat.

Bommer hat geschrieben:Oder was sonst zählt bei CASP 7 ????

CASP ist kein Wettbewerb nur für Distributed Computing Projekte, sondern ganz allgemein für Proteinstrukturvorhersage-Methoden. Und ich vermute mal ganz stark, dass wie in den letzten Jahren kleinere Gruppen von Biochemikern mit Hilfe von Voodoo

(Ich meine damit biochemische Intuition) und ein wenig Computerunterstützung gewinnen werden.

#5 Ungelesener Beitrag von **Michael H.W. Weber** » 29.05.2006 17:10

An dem Wettbewerb nimmt so ziemlich jede Arbeitsgruppe teil, die in Sachen Proteinstrukturvorhersage was auf sich hält. Distributed Computing Projekte sind als Teilnehmer eher eine Randerscheinung. Wollen mal sehen, mit welchem Erfolg es diesmal ablaufen wird.

Michael.

tralala · #6 Ungelesener Beitrag von **tralala** » 01.06.2006 10:15

Der Unterschied diesmal ist, dass Dr. Baker mit Rosetta in den vergangenen Wettbewerben immer ganz oben stand, obwohl ihm kein DC-Projekt zur Verfügung stand. Diesmal hat er zusätzlich zum besten Algorithmus auch noch 35 Tflops im Rücken. Es ist erklärtes Ziel von Rosetta@home CASP7 zu gewinnen. Härtester Konkurrent ist ein russischer Prof, der CASP6 knapp vor Rosetta gewonnen hat - was er diesmal ausrichten kann wird sich zeigen.

#7 Ungelesener Beitrag von **yoyo** » 01.06.2006 12:39

Wo findet man denn diese Informationen?

tralala · #8 Ungelesener Beitrag von **tralala** » 01.06.2006 13:31

yoyo hat geschrieben:Wo findet man denn diese Informationen?

Hier beschreibt Dr. Baker die Performance von Rosetta in früheren CASP-Wettbewerben.

Einen interessanten Artikel über CASP4, in dem Dr. Baker mit Rosetta alles abgeräumt hat, findet man hier.

Einen Vergleich zwischen Rosetta und Predictor für CASP 6 findet man hier. Die blauen Graphen sind der Durchschnitt aller Vorhersagen, die roten Querbalken die Ergebnisse von Predictor und die orangenen Dreiecke die Vorhersagen von Rosetta. In Casp6 war nur ein Team besser als Rosetta.

CASP veröffentlicht keine Ranglisten, wer am besten angeschnitten hat, aber man kann das selbst aus den Ergebnissen zusammensuchen. Man kann aber mit Sicherheit sagen, das Dr. Baker mit Rosetta über die vergangenen Wettbewerbe die beste mittlere Performance hatte.