Mal ne Frage zu FAH !

[Bommer]

Hallo

Lasse seit ein paar Tagen mal wieder FAH laufen. Dort bekam ich einen GB Gromacs Core Version 1.86.

Wenn ich den Client starte kommt nach ein paar Zeilen

GB activated
EXTRA SSE boost OK....

Nun meine Frage. Was wird bei GB aktiviert ???

Danke Bommer

[dhh]

Also im Folding@Home Forum steht dazu:

As you may have seen, there is a new core, FahCore_7a.exe. It is a variant on the main Gromacs core Core_78, differing in its incorporation of a fast, "implicit solvent" model (as used in Core_65). It complements Core_78 nicely, increasing the spectrum of tools available.

Also soweit ich es verstehe wird bei GB im Gegensatz zu SSE nicht etwas in der CPU sondern ein bestimmtes Rechenverfahren aktiviert. Eine kurze Beschreibung des (eines ähnlichen?) Verfahrens habe ich hier gefunden.

Grüße Dietmar

[Michael H.W. Weber]

Richtig. So wie ich es verstehe, geht es um die Art und Weise, wie das Lösungsmittel (hier wohl Wasser) in den Berechnungen berücksichtigt wird. Früher wurde für Berechnungen angenommen, das Protein befände sich im Vakuum - schlicht um den Rechenaufwand so gering wie nur möglich zu halten. Das ist hier nicht mehr der Fall und eine Berücksichtigung des Lösungsmittels dürfte zu genaueren, möglicherweise auch anderen Ergebnissen führen.

Michael.