Distributed Folding - Probleme und Komprimierung

[Bananeweizen]

@Bananeweizen: sag mal, hast Du Deinen 1.2 GHz Athlon übertaktet? Ich komme mit meinem 1.1 GHz Athlon (FSB-100) pro Tag auf gerade mal 28800 Strukturen.

Minimal. Er läuft mit 1218 MHz.

Seit 11.02. gibt es eine neue Version, falls noch nicht jeder das Update hat.

Ciao, Michael.

[Michael H.W. Weber]

Tja, das habe ich bereits getan. Naja, dabeisein ist alles!

Noch ein Tipp für Norton Antivirus-Besitzer: schaltet - wenn ihr es verantworten könnt - das Hintergrundscannen beim Rechnen ab - es verlangsamt merklich die Systemleistung.

Michael.

[GrafZahl]

Aber viel wichtiger: Expandiert die Datenbank, wenn ihr DistributedFolding rechnet.

Da habe ich auf unserem Linux-Gateway (SuSE 7.2) Probleme gehabt. Ohne Dekompression hatte ich keine Probleme mit dem Client. Wenn ich jedoch mit der expandierten Datenbank arbeiten wollte, dann kam eine Fehlermeldung (die ich jetzt aber nicht im Kopf habe). Schade eigentlich...

Graf Zahl: das läuft bei mir auch mit der entpackten Datenbank (auch Suse 7.2, Kernel 2.4.17, Intel-Client, Athlon)

Ach ja, ich hatte bei einem Test ohne den Datenbank-Trick die Intel- und die gcc-Version verglichen, Intel war da etwa 15% schneller

[huraxprax]

Hallo,
Ich lasse jetzt auch distributedfoldilg (zu lang der name ) auf meinem Rechner daheim laufen. Ich hab aber noch ein paar kleine Probleme mit dem Client, mal seheh ob der auch für die anderen Rechner geeignet ist.
Ich hab jetzt einen eigenen User angelegt, vorher auf kontakt@rechenkraft.de
cu, Benno

[d00pie]

ich krieg das mit dem expandieren der datenbank nich gebacken: hab es jetzt auf 2 comps probiert (beide win2k) aber obwohl über 200 MB für das temp verzeichnis zu verfügung stehen,kommt immer der fehler, das entweder der dateiname falsch ist oder zu wenig speicherplatz da ist.... hab die protein.trj auch schon umbenannt und so,hat aber alles nix geholfen !

[S_Garbe]

@d00pie - expanddb -i protein

das .trj muß unbedingt weggelassen werden, das hängt er nämlich selber an

Gruß Stefan

PS: auf einem meiner Rechner läuft das Programm mit expandierter Datenbank nicht

[d00pie]

@S_Garbe: jepp,genau so hab ich es auch gemacht... (hab auch das .trj weggelassen!) ging trotzdem nicht

[vfrey]

Es gibt jetzt eine Yahoo-Group zum Projekt. Vielleicht können sie Dir da weiterhelfen...

http://groups.yahoo.com/group/distributedfolding/

[d00pie]

hab da zwar nix gefunden,aber wenn ich meinen neuen comp hoffentlich am montag bekomme wirds sicherlich funzen

[Zeuge]

Wir sind bereits das größte Team (13 Mitglieder) in DF
Lediglich Ars Technika ist mit 11 Usern vertreten.
Der Rest der Teams besteht meistens aus 1 User maximal 6 User.

Den 10 Platz haben wir morgen inne wollte ich grad sagen aber huch: Kansas hat 10 User

Also doch nicht so leicht das ganze

Zeuge

[Michael H.W. Weber]

PS: Es gibt jetzt Teamstatistiken.

Jawoll, und zwar für Rechenkraft.de unter: http://www.distributedfolding.org/teampages/team42.html
Ich bin überrascht wie schnell die reagieren. Ich habe erst vorgestern per Email vorgeschlagen, solch eine klickbare Statistik zu erstellen - heute morgen erhielt ich eine Antwortmail mit dem schlichten Text "Done.", hehehehe...
Wenn jetzt bloß deren Website noch etwas fixer wäre...
Was die komprimierte/unkomprimierte Bibliothek betrifft - haben bislang keine weitere Messungen gemacht. Probiert das für euer System mal selbst aus. Bei uns ist es auch mit separat gemessenen Clients so, daß die unkomprimierte Variante schneller läuft. Mit dem Speicher spiele ich die Tage nochmal herum. Ich habe aber inzwischen auch den Eindruck, daß die Vergleichbarkeit zweier Clients problematisch ist. Manchmal hängt z.B. der eine bei 45/54 Aminosäuren für 1-2 Minuten herum, während der andere munter weiterrechnet, obwohl er aus dem duplizierten Verzeichnis hervorging. Vermutlich kapiere ich einfach zuwenig von den Details der Rechnungen.

Michael.

[Zeuge]

Mein Textclient ist heute Nachmittag als ich mal nachgeschaut habe nicht mehr gelaufen (Fenster war nicht mehr da). Es gibt keinen Eintrag im Ereignisprotokoll.
In der Errorlog stand: FATAL ERROR: [003.001] {foldtrajlite.c, line 3436} Unable to fetch Biostruc

Es ist nicht ersichtlich seit wann der Client nicht mehr rechnet.
Die Folditxx.lock musste ich manuell löschen um wieder starten zu können.

War es nicht so, dass der Client selbstständig nach einer neuen Version sucht oder muß ich mir den aktuellsten selbst wieder holen. Versionsnummern scheint es ja keine zu geben oder?

Schluchz wieviel Punkte sind da wohl verloren gegangen?

Zeuge