Predictor@home - Neuigkeiten & Wissenschaft

[Michael H.W. Weber]

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6/15/04 -   	 We are currently working on:

    * MFold 3.07 with checkpoints for long workunits.
    * Fixing the errors reported by the great P@H testers!

A looser homogeneous redundancy has been installed. The scheduler checks the kind of OS (Linux, Windows, or Darwin) and the kind of architecture vendor (AMD, Intel and Mac hosts) but does not check aspects like the edition or CPU speed.

A lower memory bound (50MB) has been set up. The previous was 100MB. 

Version 3.07 ist in der Entwicklung und soll "checkpoints" für lange WUs bekommen. Ich leite daraus mal ab, daß es bislang kein Checkpointing gibt - habe es aber nicht überprüft. Auch soll wohl der RAM-Anspruch des Projekts, der jetzt bei 100 MB liegt, auf 50 MB gesenkt werden.

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6/15/04 -   	 We are currently working on:

    * Building homology model templates for targets t0203 and t0204
    * Evaluation of mfold results for targets t0197 and t0198
    * Removal of init.chain tangles

The two latest targets both appear to be enzymes involved in the metabolic pathway of the model plant Arabidopsis thaliana. These targets are the largest we've seen yet at 382 and 351 amino acids in length. Target t0204 will be modeled off a Nucleotide transferase template and t0203 may require a combination of multiple templates

Zwei neue CASP6 Zielproteine wurden ausgegeben, die höchstwahrscheinlich Metabolismusenzyme aus der Kresse darstellen. Die Tatsache, daß P@H unter anderem auch "homology modelling" einsetzt, erlaubt auch die Strukturvorhersage von großen Proteinen - man beachte, daß es sich hier um Proteine mit 382 bzw. 351 Aminosäuren handelt. Wer schon mal bei DF oder FAH mitgerechnet hat, weiß, daß mit diesen Größen dort nicht gerechnet werden kann.

Michael.

[nico]

Version 3.07 ist in der Entwicklung und soll "checkpoints" für lange WUs bekommen. Ich leite daraus mal ab, daß es bislang kein Checkpointing gibt - habe es aber nicht überprüft.

Ja, wenn man den Rechner neustarten muss fängt er mit der WU leider wieder von vorn an - habe dadruch jetzt 2h verloren - naja dafür ist es alpha.

[laguna]

3.07 ist verfügbar!
Habe es heute morgen installiert.
Ob es schon mit Checkpoints arbeitet weiß ich allerdings nicht.

[Bananeweizen]

3.07 ist verfügbar!

Ich vermute mal, du meinst BOINC 3.07. Denn beim Predictor@home-Core bin ich immer noch auf 3.06, obwohl der ja automatisch aktualisiert wird.

Ciao, Michael.

[M. Franckenstein]

3.07 ist verfügbar!

Ich vermute mal, du meinst BOINC 3.07. Denn beim Predictor@home-Core bin ich immer noch auf 3.06, obwohl der ja automatisch aktualisiert wird.

Ciao, Michael.

kann ich bestätigen ...

JE1SUS

[laguna]

3.07 ist verfügbar!

Ich vermute mal, du meinst BOINC 3.07. Denn beim Predictor@home-Core bin ich immer noch auf 3.06, obwohl der ja automatisch aktualisiert wird.

Ciao, Michael.

Ja habe ich verwechselt.
Ist aber auch blöd, da steht beim Downloadlink von Predictor Version 3.07.
Es ist aber die 3.07 von Boinc.
Verwirrend, Verwirrend, Verwirrend.

[Sascha_Luehrs]

Hi, wollt nur eben sagen, ok, würdet ihr auch so merken, P@h ist offenbar gerade mal etwas down:

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<snip>
Predictor@home - 2004-06-23 18:00:59 - Started upload of t0199C_1_590_1_0
Predictor@home - 2004-06-23 18:00:59 - Started upload of t0198D_1_1868_1_0
Predictor@home - 2004-06-23 18:01:02 - Scheduler RPC to http://predictor.scripps.edu/predictor_cgi/cgi succeeded
Predictor@home - 2004-06-23 18:01:02 - Message from server: Project is temporarily shut down for maintenance
--- - 2004-06-23 18:01:02 - General prefs: from Predictor@home (last modified 2004-06-14 23:40:33)
--- - 2004-06-23 18:01:02 - General prefs: using your defaults
Predictor@home - 2004-06-23 18:01:05 - Finished upload of t0198D_1_1868_1_0
Predictor@home - 2004-06-23 18:01:05 - Approximate throughput 2101.251908 bytes/sec
Predictor@home - 2004-06-23 18:01:05 - Started upload of t0207C_1_1889_0_0
<snip>

Was mir außerdem aufgefallen ist, vorgestern hatten wir noch 10.400 Punkte mehr als die Boinc-IRCs, gestern abend warens nur noch 8000, und jetzt gerade sinds wieder 8900 Punkte mehr. Das ist sicher jetzt auch nicht dramatisch und muss auch nix heißen, aber im "Recent Average Credit" haben wir doch die ganze Zeit mehr als die Boinc-IRCs / produzieren mehr als die. Also würd ich denken, daß der Abstand zwischen uns und den Boinc-IRCs eigentlich doch wohl eher wachsen müsste, stattdessen nimmt er ab?!? Velleicht liegt's aber auch daran, daß das RKN-Team früher (oder später?) mit P@h angefangen hat als die, und der kurzfristige Durchschnitt sich daher bei denen anders rechnet als bei uns. Das würde ich eigentlich sogar fast vermuten, da auch im "Reverse Average Credit" der Abstand zwischen uns und denen in den letzten Tagen geschrumpft ist.

Und was mir noch aufgefallen ist: Beim Rechnen von P@h wird mein Computer bei weitem nicht so heiß, wie wenn er F@h rechnet. Daher würd ich vermuten, daß er bei P@h auch weniger Strom verbraucht als bei F@h (?) Oder zumindest scheint das für meinen Athlon XP zu gelten (vielleicht wegen 3DNow oder so), mag sein, daß das bei Intel anders ist.

So. Jetzt hab ich aber genug gesabbelt. tschau

[Sebastian]

Zur Zeit trennen uns und Boinc-IRC gerade noch 8.000 Punkte und das wird auch noch weiter schrumpfen, da bin ich mir sicher.

An diese Rechenkapazitäten speziell von Usern wie "Mark2112" und "Rinoh Software" kommen wir nicht ran. Ich werde in den nächsten Tagen noch zwei Rechner hinzubekommen, aber das wird es vermutlich auch nicht rausreißen.

[Sebastianus]

Hallo erstmal! Hab mich mal entschlossen hier bei euch mit einzusteigen, nachdem ich rund 1,5 Jahre oder so bei Seit@home für mich alleine gerechnet habe. Nun aber erstrangig alles, was mehr "Sinn" macht als Seti! Aber nun zu Predictor!

Ich hab auch mal nun insgesamt 3 Rechner am laufen - nen P4 2,6 - nen AthlonXP 1,0 und 900 - mal gucken ob es etwas hilft! Sollte den Schnitt um vielleicht 100 oder so heben! Mal gucken was meine Statistk dazu sagt?!? Wir werden sehen!

[stoffi]

Grüß dich und happy crunching

[Sascha_Luehrs]

Hallo erstmal! Hab mich mal entschlossen hier bei euch mit einzusteigen, nachdem ich rund 1,5 Jahre oder so bei Seit@home für mich alleine gerechnet habe.

Herzlich willkommen bei uns

[Michael H.W. Weber]

Jawoll! Dann erst mal viel Spaß in unserem Team!

Michael.