[gah] alte WU

[henna]

Hallo,
ich habe auf einem Rechner eine alte, halb fertiggerechnete WU rumzuliegen. Da es bei GAH kein Abgebedatum gibt könnte ich diese ja fertig rechnen lassen, aber wurde diese evtl. nochmal herausgegeben, und die Berechnung würde zwar Punkte bringen aber nichts nützen??? Was passiert überhaupt mit nicht abgelieferten WUs???

henna

[VadderSchlumpf]

hallo,

deine theorie stimmt für fah aber nicht für gah, deswegen gibt es bei fah auch eine deadline. bei gah lädst du dir zwar eine art wu runter, diese wird aber nochmal zufallsmäßig 30 mal generiert (deswegen 30 sequenzen). jede wu ist damit ein unikat und die wahrscheinlichkeit, dass jemand anderes diese wu mit all diesen parametern schon gerechnet hat geht gegen 0.
also meiner meinung nach würde es immer noch was bringen, auch für das projekt (widersprich mir einer, wenn ich blödsinn schreibe )

[Patrick Keller]

Mal grundsätzlich zum Prinzip von GAH: Anhand der errechneten Werte der einzelnen WUs (die die gleichen Proteine mit anderen Startwerten berechnen (seed-Wert)) wird ein "Mittelmaß" errechnet, das ein neues Protein darstellt ...
Ich denke mal dass ausgegebene WUs, die nicht berechnet wurden, garnicht zwingend erforderlich sind, da man ja auch ohne die eine WU einen MIttelwert errechnen kann ... Aber die Abgabe der WU würde trotzdem was nützen

P.S.:(Ich warte schon darauf, dass mich MW hier verprügelt, weil ich Schrott gelabert habe )

[Michael H.W. Weber]

1. Die alte WU berechnen zu lassen macht Sinn.
2. Es ist richtig, daß bei GAH eine alternative Sequenz ermittelt wird, die aus allen eingesandten Ergebnissen entsteht ("Mittelwert"). Dennoch sind auch die Einzelsequenzen verfügbar. Auf jeden Fall kann man nicht so stehen lassen, daß eine neu eingesandte Sequenz sozusagen wertlos sei. Sie geht ja in die Endberechnung ein! Je mehr Ergebnisse vorliegen, desto aussagekräftiger sollte die Durchschnittssequenz sein und desto breiter das abgedeckte Sequenzspektrum.

Michael.

[Patrick Keller]

Auf jeden Fall kann man nicht so stehen lassen, daß eine neu eingesandte Sequenz sozusagen wertlos sei. Sie geht ja in die Endberechnung ein! Je mehr Ergebnisse vorliegen, desto aussagekräftiger sollte die Durchschnittssequenz sein und desto breiter das abgedeckte Sequenzspektrum.

Hab nie behauptet, das sie wertlos sei nur nicht zwingend erforderlich

[henna]

Danke für eure Antworten.
Dann kanns ja weitergehen.

henna