Frage zu GAH...???

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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maxamd400
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Frage zu GAH...???

#1 Ungelesener Beitrag von maxamd400 » 05.11.2003 20:27

Moin...

Wie gesagt...ich wollte ja da ein wenig helfen...aber nun das... auszug aus der log

[18:47:48] TRFNVKEFIAYLEALALPGYKALILPQFVAMSAFAAAFLAVYVATYAAGL . . .
[18:47:48] Iterations: 580 of 600
[18:47:49] Finished
[18:47:50] [SPG] seed: 157694040
[18:47:50] [SPG] Designing protein sequence 30 of 30
[18:50:31] [SPG] 10.0
[18:53:03] [SPG] 20.0
[18:55:27] [SPG] 30.0
[18:57:53] [SPG] 40.0
[19:00:28] [SPG] 50.0
[19:02:58] [SPG] 60.0
[19:05:23] [SPG] 70.0
[19:07:43] [SPG] 80.0
[19:10:04] [SPG] 90.0
[19:12:24] [SPG] 100.0
[19:12:24] [SPG] Writing current.xyz
[19:12:25] [SPG] Sequence 30 completed:
[19:12:25] TRLNLREVIAYLLALAMPGFKNLALPEFTAMSAYAAAYLLYYAAAAAAGK . . .
[19:12:25] Iterations: 600 of 600
[19:12:26] Finished
[19:12:27] [SPG] Design complete
[19:12:27] [SPG] completed successfully
[19:12:28]
[19:12:28] Finished Work Unit
[19:12:28] work_hdr.len_arcfile: 206250
[19:12:29] Leaving Run
[19:12:34] - Writing 206762 bytes of core data to disk.
[19:12:34] end (WriteWorkResults)
[19:12:34] - Shutting down core
[19:12:34]
[19:12:34] Folding@Home2 Protein Design Core Shutdown: FINISHED_UNIT
[19:12:37] CoreStatus = 64 (100)
[19:12:37] Sending work to server


[19:12:37] + Attempting to send results
[19:12:39] Couldn't send HTTP request to server (wininet)
[19:12:39] + Could not connect to Work Server (results)
[19:12:39] - Error: Could not transmit unit 01 (completed November 5). Keeping un
it in queue.


[19:12:39] + Attempting to send results
[19:12:41] Couldn't send HTTP request to server (wininet)
[19:12:41] + Could not connect to Work Server (results)
[19:12:41] - Error: Could not transmit unit 01 (completed November 5). Keeping un
it in queue.
[19:12:41] + Attempting to get work packet
[19:12:41] - Connecting to assignment server
[19:12:42] - Successful: assigned to (171.64.122.124).
[19:12:42] + News From Folding@Home: Welcome to Folding@Home
[19:12:42] Loaded queue successfully.
[19:12:51] + Closed connections
[19:12:51]
[19:12:51] + Processing work unit
[19:12:51] Core required: FahCore_78.exe
[19:12:51] Core not found.
[19:12:51] - Core is not present or corrupted.
[19:12:51] - Attempting to download new core...
[19:12:51] + Downloading new core: FahCore_78.exe
[19:12:53] + 10240 bytes downloaded
[19:12:54] + 20480 bytes downloaded
...
...
[19:13:03] + 583680 bytes downloaded
[19:13:04] + 593920 bytes downloaded
[19:13:04] + 604055 bytes downloaded
[19:13:04] Verifying core Core_78.fah...
[19:13:04] Signature is VALID
[19:13:04] Created: Wednesday April 10, 2002 00:01:22 UTC
[19:13:04] Signed: Thursday April 3, 2003 00:01:22 UTC
[19:13:04]
[19:13:04] Trying to unzip core FahCore_78.exe
[19:13:04] Decompressed FahCore_78.exe (1728512 bytes) successfully
[19:13:04] + Core successfully engaged
[19:13:09]
[19:13:09] + Processing work unit
[19:13:09] Core required: FahCore_78.exe
[19:13:09] Core found.
[19:13:09] Working on Unit 02 [November 5 19:13:09]
[19:13:09] + Working ...
[19:13:09]
[19:13:09] *------------------------------*
[19:13:09] Folding@home Gromacs Core
[19:13:09] Version 1.53 (October 2, 2003)
[19:13:09]
[19:13:09] Preparing to commence simulation
[19:13:09] - Assembly optimizations manually forced on.
[19:13:09] - Not checking prior termination.
[19:13:09] - Go method
[19:13:10] - Expanded 350133 -> 2483227 (decompressed 709.2 percent)
[19:13:10] - Starting from initial work packet
[19:13:10]
[19:13:10] Project: 549 (Run 123, Clone 54, Gen 0)
[19:13:10]
[19:13:10] Assembly optimizations on if available.
[19:13:10] Entering M.D.
[19:13:25] Protein: p549_BBA5_pf
[19:13:25]
[19:13:25] Writing local files
[19:13:25] Extra SSE boost OK.
[19:13:29] Writing local files
[19:13:31] Completed 0 out of 500000 steps (0)
[19:20:24] Writing local files
[19:20:26] Completed 5000 out of 500000 steps (1)

ist das so richtig...???...konnte ich sie senden...???
und stimmt die team nummer noch... weil i rechen doch jetzt eins für FAH...oder doch nicht...???

Grüsse Thorsten

Pascal

Re: Frage zu GAH...???

#2 Ungelesener Beitrag von Pascal » 05.11.2003 20:35

maxamd400 hat geschrieben:..ist das so richtig...???...konnte ich sie senden...???
und stimmt die team nummer noch... weil i rechen doch jetzt eins für FAH...oder doch nicht...???

Grüsse Thorsten
Hm. Der G@H-Server war wohl nicht bereit für den Upload und den Download der WU, daher hat sich dein Client eine F@H-WU geschnappt.
Am besten nochmal alles bis auf die client.cfg und die FAH3Console.exe löschen und den Client dann nochmal starten (incl. Konfiguration)- oder einfach durchrechnen lassen. Vielleicht ist die nächste ja eine G@H-WU..

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maxamd400
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#3 Ungelesener Beitrag von maxamd400 » 05.11.2003 20:40

und kurz anhalten um die teamnummer zu ändern...ich rechne ja jetzt für ein falsches team...
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Michael H.W. Weber
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Re: Frage zu GAH...???

#4 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 06.11.2003 10:03

Pascal hat geschrieben:Am besten nochmal alles bis auf die client.cfg und die FAH3Console.exe löschen und den Client dann nochmal starten (incl. Konfiguration)...
Auf keinen Fall! :attention: Die vorangehende WU konnte nicht hochgeladen werden und befindet sich noch in der Warteschlange. ERST sämtliche Daten mit -send all hochladen, DANN Daten löschen, wie von Pascal vorgeschlagen.

Michael.
Fördern, kooperieren und konstruieren statt fordern, konkurrieren und konsumieren.

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#5 Ungelesener Beitrag von maxamd400 » 06.11.2003 12:23

Moin Michael + Pascal (alphabetisch sortiert) ;)

hab ich gemacht... mit -send all
Kurze erklärung:
Hab hier 3 verkünpfungen
1. C:\Programme\FAH3Console\FAH3.25-Console.exe -local -forceasm -verbosity 9
2. C:\Programme\FAH3Console-b\FAH3.25-Console-beta.exe -local -forceasm -verbosity 9
3. C:\Programme\FAH3Console-c\FAH3.25-Console-beta.exe -advmethods -forceasm -local

die dritte hab ich nun geändert in
C:\Programme\FAH3Console-c\FAH3.25-Console-beta.exe -local -send all

ich hab zwar nix gesehen was er gemacht hat,weil win2k das fenster gleich geschlossen hat,aber ich weiss mitlerweile,das die fertige WU angekommen ist.
Aber der hammer war...das er clienet in der verküpfung 2 auch beendete...

Ist ja nicht weiter schlimm,weil nach dem neuen starten er fast an der gleichen stelle weiter machte wie aufgehöret...
DIe version speichert selber bei jedem frame ab... somit verliert man nicht soviel zeit...
Zwischen den frames wird leider nicht gespeichert...benötigt der rechern für ein frame ca.7min u man beendet bei 5min.,benötigt er beim neustart wieder 7min...
das ist nach meiner meinung auch so,wenn er 45min für ein frame benötigt...
Auch hab ich beobachtet,das man leider den gleichen clienten nochmal starten kann,es sollte hierbei aber besser sein,das es zu einer fehlermeldung kommt, client schon gestartet...oder so...

Grüsse
Thorsten

Nachtrag:
Ich hab jetzt erstmal den bei mir 3 clienten ruhen lassen,weil ermitlerweile ja doch schon 7 frames berechnet hat...
Frage:
würde es sinn oder richtig sein...wenn ich die teamnummer von 1737048435 auf 3 ändere, ihn durchrechen lasse und dann neu configuriere...???

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Michael H.W. Weber
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#6 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 06.11.2003 17:00

Das ist ja interessant. Kannst Du das nochmal reproduzieren? Also wenn eine 3.25beta-Versionen offen ist und eine weitere mit -send all dazugestartet wird, schließen sich beide Clients? Bitte UNBEDINGT nochmal prüfen und hier melden. Das darf auf keinen Fall passieren. Wenn das reproduzierbar ist, bitte OS und CPU-Typ angeben, sowie die "logs" beider Clients hier posten. Beide Clients mit -verbosity 9 starten, damit die Fehlermeldungen maximalen Inhalt haben.

Was Deine Umkonfigurierung betrifft: Besser jetzt so zuende rechnen lassen, Ergebnisse hochladen, Client stoppen, alles bis auf das Steuerprogramm löschen und neu konfigurieren.

Michael.
Fördern, kooperieren und konstruieren statt fordern, konkurrieren und konsumieren.

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#7 Ungelesener Beitrag von maxamd400 » 06.11.2003 17:58

Hallo Michael...

nein leider nicht...Ich habe die verknüpfung wie folgt geändert...

C:\Programme\FAH3Console-c\FAH3.25-Console-beta.exe -local -forceasm -verbosity 9 -send all

aber jetzt lässt er beide weiterlaufen... er beendet keinen...
hier mal ein auszug:

[14:27:00] Completed 445000 out of 500000 steps (89)
[14:36:01] Writing local files
[14:36:01] Completed 450000 out of 500000 steps (90)
[14:38:19] ***** Got a SIGTERM signal (2) from OS

Folding@home Client Shutdown.


--- Opening Log file [November 6 14:38:27]


# Windows Console Edition ###############################

Folding@home Client Version 3.25

http://foldingathome.stanford.edu
email:help@foldingathome.stanford.edu

############################

Arguments: -local -forceasm -verbosity 9

[14:38:27] - Ask before connecting: No
[14:38:27] - Use IE connection settings: Yes
[14:38:27] - User name: maxamd400 (Team 3)
[14:38:27] - User ID = 3B045BC47BDDE01A
[14:38:27] - Machine ID: 1
[14:38:27]
[14:38:27] Loaded queue successfully.
[14:38:27] + Benchmarking ...
[14:38:29] The benchmark result is 6892
[14:38:29]
[14:38:29] + Processing work unit
[14:38:29] Core required: FahCore_78.exe
[14:38:29] Core found.
[14:38:29] - Autosending finished units...
[14:38:29] Trying to send all finished work units
[14:38:29] + Sent 0 completed units to the server
[14:38:29] - Autosend completed
[14:38:29] Working on Unit 01 [November 6 14:38:29]
[14:38:29] + Working ...
[14:38:29] - Calling 'FahCore_78.exe -dir work/ -suffix 01 -forceasm -lifeline 74
8
'

[14:38:29]
[14:38:29] *------------------------------*
[14:38:29] Folding@home Gromacs Core
[14:38:29] Version 1.51 (September 25, 2003)
[14:38:29]
[14:38:29] Preparing to commence simulation
[14:38:29] - Assembly optimizations manually forced on.
[14:38:29] - Not checking prior termination.
[14:38:29] - Go method
[14:38:30] - Expanded 545143 -> 3588917 (decompressed 658.3 percent)
[14:38:30]
[14:38:30] Project: 572 (Run 86, Clone 42, Gen 4)
[14:38:30]
[14:38:30] Assembly optimizations on if available.
[14:38:30] Entering M.D.
[14:39:26] (Starting from checkpoint)
[14:39:26] Protein: p572_L939_K12M
[14:39:26]
[14:39:26] Writing local files
[14:39:26] Completed 450000 out of 500000 steps (90)
[14:39:27] Extra SSE boost OK.
[14:48:25] Writing local files
[14:48:25] Completed 455000 out of 500000 steps (91)

Ich hab es ja sofort bemerkt...weil unten in der taskleiste gelich ein fenster mehr weg war... deswegen hab ich ihn ja auch gleich wieder gestartet...

Keine ahnung was das war... das mit dem fesnterproblem ist ja auch nicht mehr...

-------------------------------------------------------------
Das mit der anderen sache mach i dann so wie du geschrieben hast... neu konfigurieren für GAH nach berechnung...

Grüsse Thorsten

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Der Diplomat
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Nach 30% wieder bei 0 angefangen?

#8 Ungelesener Beitrag von Der Diplomat » 07.11.2003 18:54

Hallo zusammen,

habe mir mittlerweile die Consolenversion runtergeladen und die -verbosity 9 Einstellung eingestellt.

Letztens, als ich CTRL + C drückte stand die Anzeige bei 30%.
[07:41:26] [SPG] Starting genetic algorithm
[07:48:14] [SPG] seed: 5243294
[07:48:14] [SPG] Designing protein sequence 1 of 30
[08:03:27] [SPG] 10.0
[08:17:33] [SPG] 20.0
[08:31:32] [SPG] 30.0
[08:43:36] ***** Got a SIGTERM signal (2) from OS
Nun steht dort Designing protein sequence 1 of 30 und nichts drunter. Warum fängt er dann nicht wieder bei 30% an?
[17:44:02] [SPG] Starting genetic algorithm
[17:47:13] [SPG] seed: 5243294
[17:47:13] [SPG] Designing protein sequence 1 of 30

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LadySilver
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#9 Ungelesener Beitrag von LadySilver » 07.11.2003 19:10

Das ist vollkommen normal.
Der Client speichert nur die vollendeten Sequenzen, nicht die Zwischenschritte.
Bei jedem Neustart fängt er wieder bei 0% an.

z.B.: Du beendest den Client bei Sequenz 23 von 30, davon sind 40% fertig.
Beim Neustart startet er wieder mit der Berechnung von Sequenz 23 bei 0%

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#10 Ungelesener Beitrag von Der Diplomat » 08.11.2003 06:56

Hallo Leute,

habe nun das gleiche Problem wie maxamd400.
[23:41:12] - Autosending finished units...
[23:41:12] Trying to send all finished work units
[23:41:12] + Sent 0 completed units to the server
[23:41:12] - Autosend completed
[05:41:08] - Autosending finished units...
[05:41:08] Trying to send all finished work units
[05:41:08] + Sent 0 completed units to the server
[05:41:08] - Autosend completed
Was macht der Client nun? Meine CPU ist voll ausgelastet, obwohl die Meldungen nicht anzeigen, dass er solange an einer neuen WU cruncht.

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Michael H.W. Weber
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#11 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 08.11.2003 09:56

Das "autosend" stört überhaupt nicht. Der Client versucht IMMER in gewissen Zeitabständen, fertige Ergebnisse (und Teilergebnisse bei FAH) hochzuladen, um bei einem "crash" wenigstens Teilergebnisse in Stanford hinterlegt zu haben. In Deinem Fall lag kein fertiges Ergebnise vor und also wurde auch nichts hochgeladen. Ist also alles vom Feinsten. :D

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#12 Ungelesener Beitrag von Patrick Keller » 08.11.2003 10:13

Um es genau zu sagen betragen diese Zeitabstände IMMER 6 Stunden (entweder nach dem letzten Autoupdate oder nach Clientstart, wo ja auch einmal versucht wird alles hochzuschieben)
:P

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