Wat'n dat für ne Sidechain?

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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Der Diplomat
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Wat'n dat für ne Sidechain?

#1 Ungelesener Beitrag von Der Diplomat » 27.01.2002 13:24

Tach zusammen,

gerade denke ich mir, ja, ja, da laufen zur Zeit wieder tausende von NativeBBA5 durch die Prozessoren und guck nach uns siehe da:
Eine "PHE SIDECHAIN - OPLSAA" hat sich auf meinem Siliziumwärmer verirrt. Bin ja gespannt, was für eine Nummer diese hat.

Gast

#2 Ungelesener Beitrag von Gast » 28.01.2002 08:41

Das gehört wohl zu den Proteinen, die huraxprax um Weihnachten exzessiv beharkt hat. OPLS ist - wenn ich mich nicht irre - ein anderes Kraftfeld, als das welches Vijay normalerweise nimmt (was das AA dahinter heißt - keine Ahnung).

Michael.

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#3 Ungelesener Beitrag von Der Diplomat » 28.01.2002 19:04

Jetzt habe ich sie:

434, 447, 448

Somit habe auch ich mit Windows 98 die Dinger bearbeitet :)

@Michael H. Weber
http://folding.stanford.edu/cgi-bin/projectpage?q=434
Unter diesem Link findet man leider keine Bezeichnung des Proteins. Da stehen nur die besten 100 Leute, die die Dinger bearbeitet haben. Es wäre doch ein Vorschlag, dass da auch die Bennenung der Sidechains drin stehen würde.
Hier steht ja nur ein allgemeiner Text:
http://folding.stanford.edu/cgi-bin/allprojects#400s

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#4 Ungelesener Beitrag von vfrey » 28.01.2002 19:21

Der Diplomat hat geschrieben: Unter diesem Link findet man leider keine Bezeichnung des Proteins. Da stehen nur die besten 100 Leute, die die Dinger bearbeitet haben. Es wäre doch ein Vorschlag, dass da auch die Bennenung der Sidechains drin stehen würde.
Hier steht ja nur ein allgemeiner Text:
http://folding.stanford.edu/cgi-bin/allprojects#400s
Das hat m. E. in erster Linie damit zu tun, dass die Stanford-Leute nach wie vor im Aktualisieren ihrer Website etwas hinterherhinken... :oops:

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#5 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 28.01.2002 22:03

Genau das: die Kids in Stanford hängen wie so oft ihrer Zeit etwas hinterher. Was die brauchen ist ein professioneller Webdesigner & -betreuer :evil2:

Michael.
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#6 Ungelesener Beitrag von vfrey » 13.02.2002 18:36

Seit heute hab' ich auch zum erstenmal WUs aus dieser Projektreihe (400 - 499, wenn ich mich nicht täusche) bekommen. Auf der Folding-Site steht dann auch was von der berühmten 18-Stunden-Deadline...

Leider bin ich momentan nicht an meinem Folding-Rechner, aber ich glaube, ein 450 MHz-Pentium mit 128 MB RAM braucht so um die 12 Stunden für so ein Ding...also doch eine recht sportliche Deadline... :o

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#7 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 13.02.2002 20:50

Keine Sorge, ich hatte das bereits vor ein paar Tagen in Stanford bemängelt. Die haben die "deadline" auch gleich mal auf 36 Std. hochgesetzt. :evil2:
Diese Projekt-WUs haben übrigens überraschender Weise nicht alle dieselbe Länge. :roll:

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Smooth

#8 Ungelesener Beitrag von Smooth » 13.02.2002 23:24

Stimmt , ich hatte vorgestern eine WU mit nur 10 Frames !
Dafür hat aber ein Frame auch Ewigkeiten gebraucht.

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#9 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 13.02.2002 23:56

Ne, diese Project 400-499 WUs haben alle nur 10 "frames", die dann aber recht lang sind.

Michael.
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#10 Ungelesener Beitrag von vfrey » 14.02.2002 18:50

So, für diese Sidechains braucht mein FAH-Rechner 12,5 Stunden und erhält dann 0,6 Punkte. Für die langen WUs wie Villin, GNRA oder so braucht er 32,5 Stunden und erhält 2 Punkte... :worry:

Die kurzen WUs sind mir trotzdem lieber... :wink:

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