Jetzt kommt mehr Schwung bei DF...

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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Arnim Weber

Jetzt kommt mehr Schwung bei DF...

#1 Ungelesener Beitrag von Arnim Weber » 28.07.2003 17:47

Hi Leut,
Vielleicht hab Ihr schon bemerkt, das die ursprüngliche Anzahl der zu errechnenden Strukturen von 10 Mrd. auf 1 Mrd. herabgesetzt wurde. Es zeigte sich ja schon vor dem letzten Proteinwechsel, dass diese Zahl von 10 Mrd. viel zu hoch war. Die RMSD-Werte wurden schon innerhalb kürzester Zeit auf ein Minimum herabgesetzt. Auch bei dem jetztigen Protein liegen die RMSD-Werte schon nach "nur" 2-3 Mio. bei ca. 4.35. Somit steht innerhalb von 2-3 Wochen jeweis, bei der jetzigen Rechenkraft, ein Proteinwechsel an. Die jetzige Version von DF läuft meiner Meinung nach sehr gut. Vielfach existieren noch kleinere Probleme bei unsachgemässem Einsatz der DFGUI 3.1 (wie z.B. das Setzen von Häkchen bei "refresh inactive client alter XXX minutes"). Manchaml ist vielleicht aber auch der Server mal down... who cares. Also rangefaltet und weggehauen die Kerle. Wäre doch wohl gelacht, wenn wir die Burschen nicht vor uns bekommen...
P.S. Ich freu mich immer sehr, wenn DFler wie "Rechtskonsulter" und "r00t" nach einem gelungenen Wochenende so 350-600.000 Points einsacken... auch wenn es zu meinem Pech ist und ich sie wohl so nie einholen werde :angel2:

Wie auch immer: Meine neue Freundin, habe ich auch schon für das Projekt gewinnen können (Sonst wär sie auch nicht meine neue Freundin :evil2: ). Sie hat jetzt Ihren Rechner auch draufgesetzt. Auch wenns nur ein fieser Celeron 533 ist.

Also Jungs .... :snipersmile:

Arnim Weber

#2 Ungelesener Beitrag von Arnim Weber » 28.07.2003 18:01

http://www.statsman.org/distfoldingstats/index.html

Das macht doch Hoffnung denke ich!!! :smoking:

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Re: Jetzt kommt mehr Schwung bei DF...

#3 Ungelesener Beitrag von Rechtsconsulter » 29.07.2003 12:35

Arnim Weber hat geschrieben: P.S. Ich freu mich immer sehr, wenn DFler wie "Rechtskonsulter" und "r00t" nach einem gelungenen Wochenende so 350-600.000 Points einsacken... auch wenn es zu meinem Pech ist und ich sie wohl so nie einholen werde :angel2:
Ich freu mich auch - und mein Stromversorger erst einmal... :batangel:
Da die CPU-Preise gerade einmal wieder recht akzeptabel sind, werde ich wohl mal meine beiden verbliebenen Durons gegen weniger stromfressende Athlon XPs tauschen, auch wenn es keinen Geschwindigkeitsunterschied bei DF machen wird. Duron 1300 rechnet manchmal mehr aus als ein Athlon XP 2000+.

Tschau RC
Wenn alle Stricke reißen - dann hänge ich mich auf!

Gast

#4 Ungelesener Beitrag von Gast » 29.07.2003 19:15

Das kann ich mir keum vorstellen :o

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#5 Ungelesener Beitrag von Rechtsconsulter » 29.07.2003 21:11

Was meinst du wie ich regelmäßig staune. Ich habe zwei XPs, zwei Durons und einen Pentium 4. Den P4 kannste gleich vergessen für DF... :(
Übers Wochenende hatte der Duron 1300 so um die 160 Generationen gerechnet, der XP 2000+ 220 und der 1900+ nur 88. Von gestern auf heute kamen 91 Generationen vom Duron 1300, währed beide XPs im Anfang der 80er waren. Mein Duron 1200 ist Server und hat nicht so viel CPU-Kapazität für DF frei, daher kann ich den nicht mit vergleichen, obwohl er auch reichlich Ergebnisse liefert.

Tschau RC
Wenn alle Stricke reißen - dann hänge ich mich auf!

Pascal

#6 Ungelesener Beitrag von Pascal » 29.07.2003 21:17

Wie schon mehrfach berichtet, kann man seit Beginn der Phase II jegliche Benchmarks vergessen.

Das liegt am genetischen Algorithmus, welcher gelegentlich in sogenannte Tight-Spots zwischendurch mal ein wenig Zeit (und Rechenkraft) investiert. Das ist für die Senkung des RMSD (und damit für das Ziel des Projekts) erforderlich, macht aber jegliche zeitliche Abschätzung zunichte.

Sollte nicht demotivierend wirken, mit Power kann man den Faktor Zufall zum Faktor Sicherheit umlenken!!!

In diesem Sinne: Faltet, bis die Butze wackelt!!!! :blush: :evil2: :blush:

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#7 Ungelesener Beitrag von fw77 » 30.07.2003 10:25

Mein AMD K6 233 ist an manchen Tagen auch schneller als der gute PIII 866 Rechenknecht. Auf Dauer gesehen jedoch nur halb so schnell. Habe auch festgestellt, das der 233iger nicht so gute RMSD Werte liefert. Kann das sein? :scrambleup:

Pascal

#8 Ungelesener Beitrag von Pascal » 30.07.2003 10:27

fw77 hat geschrieben:Mein AMD K6 233 ist an manchen Tagen auch schneller als der gute PIII 866 Rechenknecht. Auf Dauer gesehen jedoch nur halb so schnell. Habe auch festgestellt, das der 233iger nicht so gute RMSD Werte liefert. Kann das sein? :scrambleup:
Der Faktor Zufall spielt immer mit.

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Re: Jetzt kommt mehr Schwung bei DF...

#9 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 31.07.2003 11:00

Arnim Weber hat geschrieben:Vielleicht hab Ihr schon bemerkt, das die ursprüngliche Anzahl der zu errechnenden Strukturen von 10 Mrd. auf 1 Mrd. herabgesetzt wurde. Es zeigte sich ja schon vor dem letzten Proteinwechsel, dass diese Zahl von 10 Mrd. viel zu hoch war.
Siehste - hab' ich doch immer gesagt, daß das bald ansteht... Machte sonst ja auch wenig Sinn, einen genetischen Algorithmus zu verwenden...

Michael.
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Pascal

Re: Jetzt kommt mehr Schwung bei DF...

#10 Ungelesener Beitrag von Pascal » 31.07.2003 11:05

Michael H.W. Weber hat geschrieben:..
Siehste - hab' ich doch immer gesagt, daß das bald ansteht... Machte sonst ja auch wenig Sinn, einen genetischen Algorithmus zu verwenden...

Michael.
Bis kurz davor war von einer Dauer von einem Monat pro Protein die Rede..

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#11 Ungelesener Beitrag von fw77 » 31.07.2003 18:55

Erst war ich nur ein bißchen verwundert daß ich ohne viel zu rechnen 2 Plätze in den Stats hochrutsche. Jetzt habe ich festgestellt, daß mindestens 3 User unser Team verlassen haben. Vor allem wundert es mich das ausgerechnet diese das Team gewechselt haben. Waren doch heut noch hier im Forum aktiv. :confused: :confused: :confused:

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#12 Ungelesener Beitrag von Patrick Keller » 31.07.2003 18:59

Nur Werbezwecke ... keine Panik !!! 8) 8) 8)
We'll be back !!!

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