Die Umstellung für die 2. Phase hat soeben begonnen ... Strukturen werden nicht mehr angenommen.
Mal schauen wie lange die brauchen
Umstellung auf Phase 2 hat begonnen !
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Patrick Keller
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Umstellung auf Phase 2 hat begonnen !
Zuletzt geändert von Patrick Keller am 18.06.2003 19:19, insgesamt 1-mal geändert.
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masel
Die Umstellung scheint fertig zu sein.
Das Protein besteht aus 96 Aminosäuren und etwas schneller als das letzte.
Der Parameter -s #### ist nichtmehr erlaubt.
Die Startgeneration ist 10000 Strukturen groß, die folgenden sind kleiner (50). Nach 250 Generationen fängt man wieder bei der Startgeneration an. Nur die beste Struktur der jeweiligen Generation wird behalten und hochgeladen!
Hier gleich noch eine Zusammenstellung der jetzigen Parameter:
-r # wobei t (true) dem Programm erlaubt um mehr Ram verwenden zu dürfen (bis zu 150 MB),einfach -r ist gleichbedeutend mit -r t
(Standart ist -r f (=false) also aus)
-u t nur Ergebnisse hochladen,einfach -u ist ebenfalls gleichbedeutend mit -u t
(Standart ist aus, also -u f
)
-i f kein automatischer Internetzugang (Standart ist Internetzugang also -i t, einfach -i bedeutet somit -i t)
Das gleichzeitige Verwenden der parameter -u t (=Upload true)und -i f (=Internet False) macht also wenig Sinn.
-q t keine Anzeige der Textgrafik wobei -q das gleiche ist (normal wird sie angezeigt also -q f)
-p ### wobei ### für -20 höchste bis 20 niedrigste Priorität steht
(Standart ist p 20)
-g ### wobei nach ### gerechneten Struckturen ein Update der progress.txt vorgenommen wird, bei 0 erfolgt kein Update ansonsten alle 1-100 Struckturen
(Standart ist 5)
(Standarts können auch weggelassen werden)
Das Optimum dürfte nun also
.\foldtrajlite -f protein -n native -df -r t -q t -g 0
sein, wobei man noch nach Gefallen die Priorität verändern kann.
Neu ist auch ein Benchmarkmodus der mit .\foldtrajlite -bench gestartet wird, also ohne andere Parameter. Ein Geschwindigkeitsvergleich der verschiedenen Parameter ist somit nicht möglich.
Das Protein besteht aus 96 Aminosäuren und etwas schneller als das letzte.
Der Parameter -s #### ist nichtmehr erlaubt.
Die Startgeneration ist 10000 Strukturen groß, die folgenden sind kleiner (50). Nach 250 Generationen fängt man wieder bei der Startgeneration an. Nur die beste Struktur der jeweiligen Generation wird behalten und hochgeladen!
Hier gleich noch eine Zusammenstellung der jetzigen Parameter:
-r # wobei t (true) dem Programm erlaubt um mehr Ram verwenden zu dürfen (bis zu 150 MB),einfach -r ist gleichbedeutend mit -r t
(Standart ist -r f (=false) also aus)
-u t nur Ergebnisse hochladen,einfach -u ist ebenfalls gleichbedeutend mit -u t
(Standart ist aus, also -u f
)-i f kein automatischer Internetzugang (Standart ist Internetzugang also -i t, einfach -i bedeutet somit -i t)
Das gleichzeitige Verwenden der parameter -u t (=Upload true)und -i f (=Internet False) macht also wenig Sinn.
-q t keine Anzeige der Textgrafik wobei -q das gleiche ist (normal wird sie angezeigt also -q f)
-p ### wobei ### für -20 höchste bis 20 niedrigste Priorität steht
(Standart ist p 20)
-g ### wobei nach ### gerechneten Struckturen ein Update der progress.txt vorgenommen wird, bei 0 erfolgt kein Update ansonsten alle 1-100 Struckturen
(Standart ist 5)
(Standarts können auch weggelassen werden)
Das Optimum dürfte nun also
.\foldtrajlite -f protein -n native -df -r t -q t -g 0
sein, wobei man noch nach Gefallen die Priorität verändern kann.
Neu ist auch ein Benchmarkmodus der mit .\foldtrajlite -bench gestartet wird, also ohne andere Parameter. Ein Geschwindigkeitsvergleich der verschiedenen Parameter ist somit nicht möglich.