fehler bei der strukturdarstellung

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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shai-hulud
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fehler bei der strukturdarstellung

#1 Ungelesener Beitrag von shai-hulud » 21.05.2003 15:46

hiho!
habe mich heut nacht angemeldet, bin eurem team beigetreten und habe das proggi ein paar stunden laufen lassen
hatte das prog so optimiert wie im forum beschrieben, sah zwar nur einen schwarzen screen, aber lt. dfp-stats sind es 23,751 strukturen geworden, scheint also zu funzen
dann sah ich dies
'You may also view the following structures, if you have installed Cn3D on your machine: '
hab das prog installiert und die beiden dateien geladen, bekomme aber beim öffnen eine fehlermeldung ;(
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Michael H.W. Weber
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#2 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 21.05.2003 17:08

Cn3D ist vom Chef des DF-Projekts programmiert und ein allgemeiner Proteinstruktur-"Viewer". Warum dieser hier nicht läuft kann ich Dir leider auch nicht sagen, da ich ihn noch nie benutzt habe. Ich würde Dir allerdings empfehlen, erst mal den DF-Client richtig zu konfigurieren, damit Du z.B. keinen schwarzen Schirm mehr siehst. Besorg Dir dazu am besten bitte dfGUI - falls Du ein Windoof OS laufen hast.

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#3 Ungelesener Beitrag von shai-hulud » 21.05.2003 19:35

hab gui installiert und am laufen
sind die werte ok, wie kann ich ihn optimieren ?


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#4 Ungelesener Beitrag von Pascal » 21.05.2003 19:42

shai-hulud hat geschrieben:hab gui installiert und am laufen
sind die werte ok, wie kann ich ihn optimieren ?
..
Also seit ewigen Zeit gibt's meine Optimierung des Clients hier im DF-Forum.

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#5 Ungelesener Beitrag von shai-hulud » 21.05.2003 19:59

ich habe deine optimierung des clients auch genutzt (siehe 1. post) und die foldit.bat geändert, es steht aber nix darüber wie man den gui optimiert ...
also was ist sinnvoll zu aktivieren und was weniger (bei dfgui config)
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#6 Ungelesener Beitrag von Pascal » 21.05.2003 20:07

shai-hulud hat geschrieben:ich habe deine optimierung des clients auch genutzt (siehe 1. post) und die foldit.bat geändert, es steht aber nix darüber wie man den gui optimiert ...
also was ist sinnvoll zu aktivieren und was weniger (bei dfgui config)
Die dfGUI bedient sich der Parameter der foldit(.bat). :wink:

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#7 Ungelesener Beitrag von shai-hulud » 21.05.2003 20:27

hab dann noch paar fragen zu den dfp-stats

Total structures generated so far:
6,905,572,628
Goal number of structures:
10,000,000,000
heißt für mich, das ziel ist beim unteren wert erreicht ...
warum hat dann das erste team in der liste 12,911,119,864 structures ?
und was sagt dieser wert aus:
Best RMS in Å ?
er steht nicht im verhältnis zur menge der strukturen, einige user haben weniger, aber dafür bei diesem wert ein besseres ergebnis ...
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#8 Ungelesener Beitrag von Pascal » 21.05.2003 20:35

Nach jeweils 10 Milliarden Strukturen erfolgt ein Wechsel zu einem neuen Protein. Die berechneten Strukturen jedes Mitglieds/Teams werden aufaddiert.

Näheres hierzu in der Projektbeschreibung bzw hier im Forum.

Der RMS soll möglichst niedrig sein - wird zufällig berechnet, daher kann er bei weniger erzeugten Strukturen auch einmal niedriger ausfallen. Nach einem Proteinwechsel wird dieser in der pers. Statistik auf 100 (99,99999) zurückgesetzt.

Lies dich bitte mal ein wenig durch unser Forum - es stehen sehr viele Infos zum Projekt drin. Danke. ;)

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#9 Ungelesener Beitrag von shai-hulud » 21.05.2003 20:47

wär es dann nicht vorteilhaft, in jedem projekt-forum ganz oben einen festen faq-thread einzurichten, in dem das alles erläutert wird ?
es werden immer wieder neue user kommen, die gern mitmachen würden, aber aufgrund der masse von neuem die auf sie einstürzt, dann doch die finger davon lassen ...
es hat auch nicht jeder user gleich viel pc-wissen ...
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#10 Ungelesener Beitrag von Pascal » 21.05.2003 20:53

shai-hulud hat geschrieben:wär es dann nicht vorteilhaft, in jedem projekt-forum ganz oben einen festen faq-thread einzurichten, in dem das alles erläutert wird ?
..
Wer die Zeit findet, kann das gerne machen. Übrigens - die Anleitung liegt in der Bibliothek. :wink:

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#11 Ungelesener Beitrag von vfrey » 21.05.2003 20:58

Pascal hat geschrieben:Wer die Zeit findet, kann das gerne machen.
Über das Thema hatten wir erst vor ein paar Tagen im Chat gesprochen. Jetzt ist nur die Frage: Wer hat das Wissen und wann die Zeit und Lust, zu den entsprechenden Projekten einen FAQ-Thread einzurichten...??? :evil2:

Freiwillige vor... :smoking:
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#12 Ungelesener Beitrag von shai-hulud » 21.05.2003 21:32

hab nach über einer stunde stats-studium festgestellt das ich bei größte änderungen / teilnehmer an pos 1 stehe :smoking:
wer sind diese 'Ars Technica Team Stir Fry', aliens ???
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