Platz 8

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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Pascal

#13 Ungelesener Beitrag von Pascal » 08.04.2002 14:19

Michael H.W. Weber hat geschrieben:...

Und an die "offliner" von euch: jetzt bitte schnell ALLE Daten uploaden... bevor es zu spät ist...

Michael. :smoking:
aber wie sollen die offliner das denn mitkriegen :-? :evil2:

Was anderes: viele sagen: "schneller rechnen, schneller rechen". Aber wenn wir schneller rechnen, sind wir aber doch schon wieder fertig, und was dann? :roll:

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Michael H.W. Weber
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#14 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 08.04.2002 15:37

@Pascal: Die "offliner" haben oft zwar etliche Rechner "offline" am Rechnen, sind selbst als Admins dieser Kisten jedoch sehr wohl "online" und lesen also auch gelegentlich im Forum. :lol: Es ist jetzt übrigens 16:30 Uhr und es sind nur noch 2 Millionen Strukturen verblieben - also haben noch etliche "offliner" ihren Kram hochgeladen (oder neue DF-Freunde sind dazugestoßen). :wink: Ich muß daher korrigieren: vermutlich ist das Pojekt bereits um 17:00 beendet.
Natürlich kann ein Rechner, der schon "alles gibt" nicht noch schneller Rechnen. Aber oft nehmen die Leute bei DF den Rechner "zu früh" vom Projekt und satteln auf ein anderes um, da sie Angst haben, daß das Autoupdate nicht funktioniert. Kann ich auch nachvollziehen... Nun ja, schauen wir mal...

Michael.
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#15 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 08.04.2002 15:41

Aha! Projekt beendet!

Michael.
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Loup

#16 Ungelesener Beitrag von Loup » 08.04.2002 16:05

Und bei mir sind prompt ca. 100000 Einheiten vom alten Rechner umsonst gerechnet worden (sind bei dem ca. 2 Tage Rechenzeit :x ) und bestimmt nochmal die Haelfte auf dieser Kiste... :( Und das nur, weil ich gestern keine Lust hatte, die Daten vom alten Rechner rueberzuschieben (der hat keinen Internetanschluß, aber LAN Verbindung zu diesem hier :)) und heute wegen nem großen Download df nicht angestellt hatte. Hatte Schiß, dass der mir abbricht, wenn df mal wieder seine ganzen Einheiten, die sich angesammelt haben, ins Netz sendet. Na juchu, ist jetzt das zweite Mal, dass Tage von Rechenzeit des alten Rechners draufgehen, ich glaub, den lass ich liebe an was anderem rechen. Da beendet sich der Client eh ab und zu mal mit ner Schutzverletzung... (Und wenn er brav durchlaeuft, dann gibts mal wieder nen Protein-Wechsel :( ) Naja, is ja irgendwie meine Schuld, hatte ja noch gestern in die Statistik gesehen, und da diesen langen roten Balken gesehen... :roll:

Arnim Weber

#17 Ungelesener Beitrag von Arnim Weber » 08.04.2002 17:28

Da bin ich ja froh, dass ich meine Strukturen zufällig vorher noch hochgeladen habe. Ist doch total Arsch, dass einem die alten Strukturen nicht noch gutgeschrieben werden. :(

Pascal

#18 Ungelesener Beitrag von Pascal » 08.04.2002 18:36

Nen alten Rechner würd ich wahrscheinlich mit was unkritischem wie MUON beschäftigen :-)

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#19 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 09.04.2002 10:38

Arnim Weber hat geschrieben:Ist doch total Arsch, dass einem die alten Strukturen nicht noch gutgeschrieben werden. :(
Der Hintergrund dazu, daß die alten Strukturen nicht mehr angenommen werden, ist vermutlich folgender:
Das gesamte DF-Projekt, so wie wir es im Augenblick bearbeiten, ist in der initialen Testphase. :attention: Es geht darum, am Beispiel von 5 Proteinen erst einmal grob abschätzen (!) zu können, ob der von Howard Feldman umgesetzte Algorithmus überhaupt auch nur im Ansatz hält, was von ihm erwartet wird. Die 5 Proteine, die ausgewählt wurden, haben ganz bestimmte (Sekundär-) Strukturmerkmale. So besteht eines z.B. nur aus Betafaltblattstrukturen, ein anderes aus Alphahelices und andere wiederum haben beide Sekundärstrukturelemente gemeinsam. Auf diese Weise soll ausgetetestet & eingegrenzt werden, wo der Algorithmus Schwierigkeiten hat, um ihn dann entsprechend anpassen zu können. :wink: Da macht es keinen Sinn, wenn Leute "wie die Wilden" auf alten Proteinen herumrechnen, wo doch die erforderliche Mindeststrukturzahl - die eben zur Beurteilung der Güte des Algorithmus nötig ist - für das gerade beendete Protein bereits erreicht wurde. :roll:
Schau Dir die Teamtabellen mal an - da sind total viele, deren RMSD immer noch bei 99.99 steht. Das sind Leute, die entweder ausgestiegen sind oder deren Rechner noch immer auf dem alten Kram herumkauen.
Ich kann ja eure Frustration in dieser Sache sehr gut (!) nachvollziehen, denn auch ich habe massenhaft Ergebnisse verloren (mal ehrlich: sagen wir doch gleich "credits!") - aber im Augenblick geht es nicht unbedingt darum, DIE "non-plus-ultra-akkurate Struktur" zu erzeugen, sondern darum, eine Testphase zügig abzuschließen, um die wesentlichen Dinge in Angriff nehmen zu können. Also: nich' schnacken - Kopp in'n Nacken und rangefaltet! :lol:

Michael.
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