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Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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Moy
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RMS

#13 Ungelesener Beitrag von Moy » 08.01.2003 00:16

...ich stelle gerade fest, dass meine RMS (und alle anderen auch) auf 99.999001 gestellt wurden... Kann mir mal einer erklären, was es mit dieser RMS auf sich hat, bzw. für was die steht ?

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BaRu
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#14 Ungelesener Beitrag von BaRu » 08.01.2003 00:17

Neues Protein ist da ... 108
und irgendwie sehr schnell


gruss
rüdiger

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GooRoo
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#15 Ungelesener Beitrag von GooRoo » 08.01.2003 00:30

Checking for newer versions...


Downloading update, please wait...


*dumdidumdidum*

Mach hinne :multi: Hui ist das aufregend!

GooRoo
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BaRu
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#16 Ungelesener Beitrag von BaRu » 08.01.2003 00:33

also das update ging zügig...na so 4 minuten

smoc

Mirror?

#17 Ungelesener Beitrag von smoc » 08.01.2003 00:36

Hi,

gibt es schon einen Mirror? Ich kann gerne einen im DFN aufmachen, habe aber die Dateien nicht, was reichlich unpraktisch ist :-(

Hat die schon wer?

---smoc---

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vfrey
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Re: RMS

#18 Ungelesener Beitrag von vfrey » 08.01.2003 00:39

Moy hat geschrieben:...ich stelle gerade fest, dass meine RMS (und alle anderen auch) auf 99.999001 gestellt wurden... Kann mir mal einer erklären, was es mit dieser RMS auf sich hat, bzw. für was die steht ?
Das sollte lieber ein Spezialist beantworten, aber wenn gerade keiner da ist... :o

Bei DF berechnest Du die Struktur eines zu Ende gefalteten Proteins. Da (außer dem CASP5-Projekt) alle Berechnungen bereits bekannte Proteine betreffen, kann exakt angegeben werden, wie nahe Deine Berechnung der tatsächlichen Struktur ist. Je niedriger der RMS-Wert wird, umso näher bist Du dran (bei 0,00 wäre es identisch).

Sollte die Erklärung Unsinn sein, bitte ich, mich zu korrigieren... :worry:
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Moy
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Mirror !

#19 Ungelesener Beitrag von Moy » 08.01.2003 00:44

Meiner saugt jetzt schon seit 20 Mins - aber noch kein Ergebnis... Keine Ahnung, wie groß das Teil ist...
Ich bin mit 128 kBit/s drin... :worry:

Pascal

Re: Mirror !

#20 Ungelesener Beitrag von Pascal » 08.01.2003 00:45

Moy hat geschrieben:Meiner saugt jetzt schon seit 20 Mins - aber noch kein Ergebnis... Keine Ahnung, wie groß das Teil ist...
Ich bin mit 128 kBit/s drin... :worry:
Waren so etwas 3.8 MB oder? :roll:

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BaRu
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#21 Ungelesener Beitrag von BaRu » 08.01.2003 00:47

die normale hat so 6,5

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GooRoo
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#22 Ungelesener Beitrag von GooRoo » 08.01.2003 00:48

Speed ist ganz ok!

Mein leicht "FSB-korrigierter" XP1800 macht da folgendes:

------------------------------------------------------------
Distributed Folding Windows dfGUI v1.91 Benchmark

Sample Size : 5500 structures over 1658 seconds.
Protein Size: 108AA

Structures Per Second: 3.33
Structures Per Minute: 200.0
Structures Per Hour : 12000
Structures Per Day : 288000

OS : Windows 2000 MHz: 1650
CPU: AMD Athlon(tm) XP 2000+
Client Switches: -df -rt -g 100 -s 5000
------------------------------------------------------------

und steigt noch weiter.

Naja vielleicht etwas kurz für ein gescheites Benchmark, aber für den Anfang...

Fazit:

ca. 5-10% schneller als das alte 129er

Grüße
GooRoo
Zuletzt geändert von GooRoo am 08.01.2003 01:03, insgesamt 1-mal geändert.
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Pascal

#23 Ungelesener Beitrag von Pascal » 08.01.2003 00:50

GooRoo hat geschrieben:Speed ist ganz ok!
...
Fazit:

ca. 5-10% schneller als das alte 129er

Grüße
GooRoo
Kommt in etwa hin. Linux-ICC-Client auf nem 1.2er Athlon (133er FSB) macht etwa 2.9 Strukturen/s. :wink:

mwannema

#24 Ungelesener Beitrag von mwannema » 08.01.2003 08:11

moin zusammen,

ähm, frage bitte => was ist 129 oder 108 ? ... die nummer des proteins oder eine bestimmte angabe für etwas das ich nicht kenne ?

gibt es die möglichkeit die version des clients von hand zu checken ? ... habe auf automatisch gestellt und bin mir nicht sicher ob alle rechner/instanzen upgedatet wurden.

grüsse

mwannema/manuel

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