FAH-News

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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Re: FAH-News

#265 Ungelesener Beitrag von X1900AIW » 18.10.2008 20:31

Neue News vom 18.10.2008:
Update on network issues

Es wurden neue GPU-Server bereit gestellt, zudem ein (neuer ?) Link zu den GPU-Servern:
http://fah-web.stanford.edu/localinfo/contact.GPU.html

"Dear GPU,
Here is a list of your servers ..." :lol:

Die übergeordnete (alte) Server-Übersicht ist im Vergleich unübersichtlicher:
http://fah-web.stanford.edu/serverstat.html
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Michael H.W. Weber
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Re: FAH-News

#266 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 01.11.2008 17:56

Eine neue, sehr interessante FAH-Publikation: http://www.pnas.org/content/105/43/16549.abstract?etoc

Michael.
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Re: FAH-News

#267 Ungelesener Beitrag von X1900AIW » 06.11.2008 07:56

Ein neuer Core 1.19 ist - zunächst als manueller Download - für den GPU-Client bei nVidia, in der Wiki - Versions-Info sind die Änderungen bereits nachzulesen:
- NVIDIA Core 11 v1.19 available for manual download

Hinweis unten beachten, im Forum gibt es teilweise Aussagen, daß der Core 1.19 nicht unter 64Bit-Betriebssystemen läuft (Fehler lag evtl. in der Download-Datei).
  • "If you are having problems with v1.15 or v1.18, please try replacing it with this newer version." (friedrim)
  • nach nur einem Tag positivem Forum-Feedback ist bereits der Einsatz als neuer Download-Core geplant (VijayPande)
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Re: FAH-News

#268 Ungelesener Beitrag von duftkerze » 09.11.2008 13:47

also ich habe den core 13 version 1.19 unter xp64 laufen....

nur gibt es ein problem: diese version ist so krass optimiert das der lüfter bei maximum(5000upm) ist und die core temp bei 96 grad liegt.
mal sehen wie lange es die karte aushält.
der videospeicherverbrauch liegt etwa bei 105 mb.

schliesst man den gpu clienten, wird der grafikspeicher nicht freigegeben.irgendwann kommt dann das "unstable_machine",weil der videospeicher voll ist.

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Re: FAH-News

#269 Ungelesener Beitrag von X1900AIW » 12.11.2008 20:00

Zum nVidia-GPU-Client (erklärende) Statements von Mr. Pande zum Core 1.19 und den neuen, großen Workunits:
Questions regarding core_13 (und andere Threads, siehe jeweils die Posting-Quelle)

Ausschnitte (keine Chronologie):
  • "First, the NV core does really well compared to ATI for small proteins. However, we're moving to larger proteins and there NV has less of an advantage. (...) One final comment: NV core_13 and core_11 are now in sync. This project was released with core_13 as a test, but then was moved through QA and is now a production project." (Post)
  • "... for now v1.19 is much more stable than its predecessors for the bulk of donors (...)" (Post)
  • "The PPD was unnaturally high for NV for small WUs. This has been discussed in great detail in other threads. The PPD loss is mainly due to the change in project, not the change in core. The key science update has to do with computing with better precision, i.e. more accurate numerics to keep the results meaningful." (Post)
  • "Finally, we are looking into the heating issues people are seeing. It would be useful to hear what temps you're getting." (Post)
  • " ... it's worth noting that the heat problem would likely be *worse* with 1.18 than 1.19. The additional optimizations will lead to additional heat. Faster code will run hotter." (Post)
  • "Finally, just to give people some insight into our thought process: we're seeing something where the same code works well on some hardware and not at all on others (eg v1.15). We've even seen where this can be fixed by upgrading the PSU w/o changing any software at all. So, at least in that case, it was definitely a hardware issue." (Post)
  • "The temperature issue is very much on our minds. In the end, I think the only easy way to fix the temperature issue in software is to under-optimize the core (spend less time computing, eg sleep() for a little bit here and there). We're looking to see how we can do this. This would also be the equivalent to underclocking in a sense, so that may be an option for some (especially those who are already over clocked, but maybe others too)" (Post)
  • "We may release an optional binary similar to 1.18 which would allow such testing in the future." (evtl. GX2-Spezialfall, Post)
Gerade der letzte Aspekte des absichtlichen De-/Unter-Optimieren (Peiorieren ? :uhoh: ) für die Temperatur-Absenkung wäre m.E. ein bedauerlicher Schritt, doch zeigt diese Notlösung die Grenzen der Hardware (negativ) bzw. die (positive) Grenzüberschreitung der Software-Entwickung auf. Schade nur, wenn man gezwungen ist, die Leistungsfähigkeit von Standard-Hardware einzuschränken.
Crunch-as-Crunching-can verliert so seinen Leitcharakter :onfire: . In einem FAH-Forumsthread angedeutet war die Vermutung, daß die Temperatur-Probleme vornehmlich auf abweichende Hersteller-Umsetzung von Standard-/Referenz-Designs beruhen. Persönlich setzt ich drei Mal Referenz-Designs ein, trotz (hohem) Overclocking hatte ich keine ernsthaften, schon gar nicht dauerhafte Temperatur-Probleme. Mhm.

slegrand (NVIDIA Development Team Member) hat einen aufschlußreichen Kommentar zu Unterschieden von nVidia-Grafikkarten hinsichtlich ihrer FAH-Eignung und Fehlerhäufigkeiten abgegeben, das meiste bleibt (leider) ungeklärt, doch - scheint es - nicht unlösbar:
Re: Culprit found in NV core v 1.15 issues for certain hardware?
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Re: FAH-News

#270 Ungelesener Beitrag von duftkerze » 12.11.2008 20:14

d.h.das meine hardware von referenz abweicht und deshalb probleme macht mit aktuellen core ?!

egal ich crunch eh nicht mehr für fah. vielleicht später wiedermal...momentan habe ich gpugrid am laufen.da wird die graka net so heiss und ich kann sie noch ein wenig übertakten. :roll2:

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Re: FAH-News

#271 Ungelesener Beitrag von X1900AIW » 12.11.2008 21:00

Was hast du nochmal für eine Grafikkarte ? Zum Betrieb unter XP64 gibt es eigene Threads, Temperaturen um die 100 Grad hängen neben dem GPU-Chip schlicht vom Modell-Design ab, konkret am "eingespeicherten" Grenzwert der Schutzabschaltung. Manche OC-Karten weisen im Bios teilweise höhere Volt-Werte auf, was die Sache verschärft. Bläst deine Karte nicht über eine Slot-Öffnung nach draussen, wird die Umgebungs- und Innen-Temperatur entscheidend sein. Bzw. entsprechend zugeführte Kaltluft. Bei beiden HD3850 von mir (Single-Slot, Luft bleibt drin :roll: ) hatte ich die Temperaturen über die letzten Monate immer wieder dokumentiert, sie schwankten je nach Projekt, Atom-Zahl und Aussentemperatur zwischen 85 und 105 Grad GPU-Temperatur, gemessen mit Rivatuner, der Lüfter ist seit jeher auf max. 55% eingestellt, um die Lautstärke zu bändigen.

Wie viel kühler bleibt denn die Karte unter GPUgrid ? Würde mich interessieren ...
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Re: FAH-News

#272 Ungelesener Beitrag von duftkerze » 13.11.2008 17:07

ich habe ne 8800gt (g92) single slot.

bei gpugrid hat die graka bei 5000upm lüfter geschwindigkeit und standard-takt 85 grad.

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Re: FAH-News

#273 Ungelesener Beitrag von X1900AIW » 26.11.2008 00:52

Neue Workunits für den nVidia-GPU-Client:
New GPU projects 5749-5764 - Kurzinfo mit Links zu den Projekt-Details (nicht in der Projekt Summary enthalten)

Edit:
News vom 02. Dezember: Rückblick und Ausblick von Mr. Pande

Ausschnitte (als Lese-Häppchen ... Hervorhebungen von mir)
  • In the first few years, we have done a lot to build up methodology (...), especially in the last years working to bring GPU's, PS3's, and tightly coupled SMP calculations to a distributed computing platform. While all of this has been going on, (...) donors should see more results (i.e. papers) coming out in this direction soon.
  • ... our short term goals is to shore up the SMP client. (...) This effort has been going on for about a year and it's far enough along that I'm starting to talk about it publicly.
  • Longer term, with a more solid GPU2 and SMP2 clients done, we can then move on to other areas. Our goal is to be bleeding edge in the nature of our science, but get back to the simplicity and stability found in the classic client.
Ach, schöne Schlussworte zum Jahresende, oder ? :x-mas:
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Re: FAH-News

#274 Ungelesener Beitrag von Torbjörn Klatt » 08.12.2008 20:15

Folding@home Alzheimer's Simulation work published
Die FAH-Simulationen haben zu neuen Erkenntnissen über die Entstehung von Alzheimer geführt und werden nun versucht experimentell zu beweisen.
Link

/edit/
In unsere eBib und News eingebunden
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Re: FAH-News

#275 Ungelesener Beitrag von X1900AIW » 19.12.2008 22:12

Neuer GPU-Core für ATI/AMD-Grafikkarten erschienen, bereits am 15.12.2008:
New ATI core (v1.22) released - setzt Client-Version 6.23 voraus

Im selben Thread etwas Hintergrund-Information von mhouston, der Core nutzt weiterhin CAL 1.2.1, nicht Version 1.3 aus dem Dezember-Treiberpaket CCC 8.12.

Foren-Berichte sind noch unklar hinsichtlich Performance-Steigerungen/CPU-Belastung, HD4000 scheinen zu profitieren, HD3000 eher nicht. Wer eigene Erfahrungswerte hat, bitte posten.

Edit: mhouston hat zu den Unterschieden zwischen Core 1.18 und 1.22 hier Stellung genommen:
  • (...) The optimizations and tweaks to the algorithms have moved things around a little bit. Also, we have changed how we unroll the protein across the chip, perhaps not optimally for all proteins and hardware at the moment, so that has also tweaked things, but we believe that in general we are picking a much better strategy than before.
Wie ein Poster im FAH-Forum bemerkt hat, ist die Tera-FLOPS-Leistung durch den neuen Core stark angestiegen, ca. 60% nach meiner Rechnung (600>960; was in Relation zum Aufwand gewaltig wäre), siehe Client-Statistik:
http://fah-web.stanford.edu/cgi-bin/mai ... pe=osstats
Zuletzt geändert von X1900AIW am 20.12.2008 10:28, insgesamt 1-mal geändert.
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Re: FAH-News

#276 Ungelesener Beitrag von duftkerze » 19.12.2008 22:28

ich finde der aktuelle nvidia fah-core super, er nutzt nicht ein prozent cpu-auslastung.

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