Monitor für FAH: Electron Microscope III

Nachricht

#1 Ungelesener Beitrag von **Michael H.W. Weber** » 24.05.2002 20:32

Also ich habe bislang Foldmonitor zur Überwachung meiner FAH-Klienten benutzt. Dafür hatte ich auch ein "Germany"-Skin gebastelt:

Bild

Jetzt bin ich allerdings wegen diverser Streßfaktoren mit FoldMonitor auf Electron Microscope umgestiegen. Habe auch dafür eben mal ein kleines "Germany"-Logo zusammengeklickt. Wer an dem Kram interessiert ist, kann mir ja Bescheid geben.

Bild

Das Ding zeigt oben links die aus dem Web geholten Stats an, kann Klienten übers Netz überwachen und zeigt die aktuelle Konformation der berechneten WU als Grafik an - hier offensichtlich noch das entfaltete Protein. Im Gegensatz zu FoldMonitor ist die Restzeitangabe zum Abschluß der WU extrem genau - was mich zum Wechsel bewegt hat. Man kann auch verschiedene "skins" auswählen oder sich selbst einen basteln.

Gruß,
Michael.

Arnim Weber · #2 Ungelesener Beitrag von **Arnim Weber** » 24.05.2002 21:05

Habe ihn schon laufen ...

#3 Ungelesener Beitrag von **Michael H.W. Weber** » 25.05.2002 20:39

Aha - exzellent. Soeben kam für Electron Microscope III die neue Version dies "FAH-Viewers" (genauer: EM Viewer III) raus, mit dem man auch Videos/animierte GIFs der sich faltenden WUs erzeugen kann. Absolut coole Idee. Der Plunder ist hier (in der Download-Area) erhältlich:

http://home.attbi.com/~wxdude1/emsite/

Ich freue mich immer wieder zu sehen, daß FAH/GAH satt von "third party contributers" unterstützt wird.

Viel Spaß,
Michael.

LadySilver · #4 Ungelesener Beitrag von **LadySilver** » 27.05.2002 18:37

Ich hab mir gerade das Electrone Microscope III heruntergeladen und entpackt. Jetzt habe ich aber ein Problem:
Es zeigt mir zwar das Protein an, aber in den beiden Balken ist kein Fortschritt eingezeichnet. Der Client zeigt an, das er bereits 5 Frames berechnet hat, aber in EM III ist davon nichts zu sehen.
Den Pfad hab ich angegeben. Auch bei den anderen Angaben wie z.B. Time per WU oder Time remaining steht nichts.
Nur bei Time per frame steht was.
Aber es existiert keine Fortschrittsanzeige in den Balken, als hätte ich die Einheit erst gestartet. Ich habe EM III jetzt eine ganze Weile (fast 2 Std.) laufen lassen, aber nichts hat sich getan.

Weiß jemand Rat?

#5 Ungelesener Beitrag von **Michael H.W. Weber** » 28.05.2002 08:25

Du mußt oben links auf das Mikroskop klicken. Da verbergen sich die Options. Da gehst Du alles nochmal durch und machst vor allem in einem der Fenster ganz oben ein Häkchen an den zuvor konfigurierten Client, den Du überwachen willst. Ich habe ürbigens auch Probleme einen zweiten Klienten lokal zu verwalten. Das Programm geht immer auf den primär installierten und nimmt den neuen Pfad nicht an - ist aber FAH3 beta 2, sodaß das eine Ausnahme sein könnte. Mal das .doc lesen - ist separat downloadbar.

Michael.

LadySilver · #6 Ungelesener Beitrag von **LadySilver** » 28.05.2002 12:21

Michael H.W. Weber hat geschrieben:Du mußt oben links auf das Mikroskop klicken. Da verbergen sich die Options. Da gehst Du alles nochmal durch und machst vor allem in einem der Fenster ganz oben ein Häkchen an den zuvor konfigurierten Client, den Du überwachen willst. Ich habe ürbigens auch Probleme einen zweiten Klienten lokal zu verwalten. Das Programm geht immer auf den primär installierten und nimmt den neuen Pfad nicht an - ist aber FAH3 beta 2, sodaß das eine Ausnahme sein könnte. Mal das .doc lesen - ist separat downloadbar.

Michael.

Jetzt funktioniert's!
Aber erst nachdem ich sämtliche Dateien gelöscht und den FAH-Client in einem neuen Verzeichnis neu gestartet habe.

Sagt mal, bekommt ihr auch nur noch ProteinA? Ich krieg schon die letzten 2-3 WU's nichts anderes mehr!

P.S. Übrigens: Wärst du so nett und würdest mir das "Germany-Skin" mailen?

#7 Ungelesener Beitrag von **Michael H.W. Weber** » 28.05.2002 13:03

mcbSilver hat geschrieben:Sagt mal, bekommt ihr auch nur noch ProteinA? Ich krieg schon die letzten 2-3 WU's nichts anderes mehr!

P.S. Übrigens: Wärst du so nett und würdest mir das "Germany-Skin" mailen?

Ich kriege auch hauptsächlich "proteinA". Lies mal den FAH 3.0 "thread" hier über das "benchmarking"-Feature. Damit kannst Du dran regeln. Mußt aber mehrmals FAH mit etwas CPU-lastigem im Vordergurn starten und dies bei evt. mehreren WUs tun. Am sichersten dürfte sein, die "client.cfg" zu erneuern (VORHER aktuelle WU beenden und wegschicken - is klar...), damit Stanford die ID nicht klassifizieren kann.

"Skin" ist abgeschickt.

Michael.

LadySilver · #8 Ungelesener Beitrag von **LadySilver** » 28.05.2002 13:15

Danke!!

#9 Ungelesener Beitrag von **Michael H.W. Weber** » 31.05.2002 21:42

Die neuste EM III Version ist hier erhältlich:

http://home.attbi.com/~wxdude1/emsite/download.html

Jetzt bestimmt sie vorab, ob eine WU mit dem Rechner, auf dem sie gestartet wurde auch innerhalb der von Stanford gesetzten "deadlines" zurückgeliefert werden kann.

Michael.

#10 Ungelesener Beitrag von **Michael H.W. Weber** » 15.06.2002 11:09

Es gibt eine in vielerlei Hinsicht erweiterte Version von EM III:

http://home.attbi.com/~wxdude1/emsite/download.html

Michael.

ltd · #11 Ungelesener Beitrag von **ltd** » 15.06.2002 12:59

Bei der neuen Version (1.7.8 ) scheint mir etwas vorsicht geboten.

Auf meinem W2K System ist diese Version in einen Deadlock gelaufen
(96% Prozessor Auslastung

)
Die alte Version (1.7.7 ) war komplett stabil.

Lars

ltd · #12 Ungelesener Beitrag von **ltd** » 15.06.2002 19:36

Hallo Leute,

hab gerade Antwort vom Entwickler zu meinem Crash bekommen.
Er hat bis jetzt noch keinen sicheren Grund feststellen können.
Er meint aber:

You might want to disable the auto check of the version.
That's about the only thing I can think of that might cause that.

Lars