Genome@home Ergebnisse...

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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Michael H.W. Weber
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Genome@home Ergebnisse...

#1 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 23.03.2008 08:48

...wo sind sie verblieben? Gibt es nicht Online-DBs, die Backups solcher Webinhalte archivieren? Bei Lifemapper hatten wir ja auch mal das Problem - wobei dort bis heute die Daten nicht verfügbar sind.

Michael.
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Dennis Kautz
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Re: Genome@home Ergebnisse...

#2 Ungelesener Beitrag von Dennis Kautz » 23.03.2008 12:44

Michael H.W. Weber hat geschrieben:Bei Lifemapper hatten wir ja auch mal das Problem - wobei dort bis heute die Daten nicht verfügbar sind.
Was ist denn damit?

http://www.lifemapper.org/speciesPage.psp

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Michael H.W. Weber
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#3 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 23.03.2008 18:57

Tut bei mir nicht. Auch wenn die Karte neu ist. Aber mir ging's ja um GAH.

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Velociraptor
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#4 Ungelesener Beitrag von Velociraptor » 23.03.2008 22:38

www.archive.org meinst du vlt sowas =?
There is no place like 127.0.0.1
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#5 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 24.03.2008 11:14

Ja - genau. Leider sind auch in diesem Archiv die Ergebnisse nicht abrufbar. :roll:

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#6 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 27.03.2008 08:02

Hier mal die vollständige Liste aller Proteinvorlagen, für die bei GAH Ersatzsequenzen berechnet wurden. Ich habe sie aus dem oben angegebenen Webarchiv geholt und schreibe es mal hier hin, bevor auch diese Information noch flöten geht:

Code: Alles auswählen

pdb1mof,pdb1hoe,pdb1ctx,pdb3tlh,pdb1fca,pdb1efn,pdb1byp,pdb1ubi,pdb2ci2,pdb1ag6,
pdb1etl,pdb7msi,pdb4ovo,pdb1ail,pdb1cnr,pdb1cm2,pdb2plh,pdb1etm,pdb1nyf,pdb1awj,
pdb1pht,pdb1gzi,pdb1etn,pdb1abo,pdb1coi,pdb1gfc,pdb7pti,pdb1b5m,pdb1upj,pdb5icb,
pdb1neb,pdb1abq,pdb1beo,pdb1mho,pdb1enh,pdb4pcy,pdb1fxd,pdb1es1,pdb1dxs,pdb1tuc,
pdb1bq8,pdb1avz,pdb1hhp,pdb1qkw,pdb1griA,pdb1bq9,pdb1ubq,pdb1dlb,pdb1qkx,pdb1griB,
pdb1bmg,pdb1ajj,pdb1irn,pdb1bk2,pdb1piq,pdb2era,pdb1enm,pdb1who,pdb1iro,pdb1pch,
pdb1ehd,pdb1r69,pdb1whp,pdb2gn5,pdb1blu,pdb1yhb,pdb2msi,pdb1srl,pdb1bti,pdb2psr,
pdb1hpi,pdb9pti,pdb4rxn,pdb1rop,pdb1c75,pdb3phv,pdb1ppt,pdb1mjc,pdb1frd,pdb6pcy,
pdb1awx,pdb1ab1,pdb1cbn,pdb1b7d,pdb2ptk,pdb1akg,pdb1hip,pdb1chz,pdb1nlo,pdb1f94,
pdb1nlp,pdb1dsl,pdb3hvp,pdb1fb7,pdb2sam,pdb2erl,pdb1opd,pdb1sem,pdb1qr8,pdb1kp6,
pdb1fdn,pdb351c,pdb1pi2,pdb4msi,pdb1ayi,pdb1qr9,pdb1ypa,pdb1b6w,pdb1hpt,pdb1krn,
pdb1be7,pdb1rpo,pdb1ypb,pdb4pti,pdb1fsc,pdb1ypc,pdb1cka,pdb1fyn,pdb1en2,pdb1ckb,
pdb1rh4,pdb1a32,pdb1tif,pdb2knt,pdb1tig,pdb1igd,pdb1prm,pdb2sn3,pdb1ifp,pdb1ntn,
pdb1pef,pdb1xy2,pdb1qoc,pdb1bt0,pdb1pdr,pdb1azg,pdb1qod,pdb1pkr,pdb6msi,pdb1szt,
pdb3ovo,pdb1qoe,pdb1g2b,pdb1pks,pdb8rxn,pdb1snb,pdb1b7v,pdb2hts,pdb1hcw,pdb1c26,
pdb1b0y,pdb1ejg,pdb4icb,pdb1ops,pdb1eis,pdb1cyi,pdb1ame,pdb1bm8,pdb3pcy,pdb1cyj,
pdb1pen,pdb1bhp,pdb1eps,pdb1a43,pdb2ctx,pdb1qm7,pdb1gvp,pdb1nag,pdb1crn,pdb1cqy,
pdb1ad5,pdb1vie,pdb2abl,pdb1fmk,pdb1cxy,pdb1orc,pdb1dtx,pdb1rb9,pdb1vif,pdb1hyp,
pdb1cyo,pdb5hck,pdb1cei,pdb1utg,pdb1bpi,pdb1ptf,pdb1qt9,pdb1msi,pdb1cc5,pdb8pti,
pdb1qwe,pdb1pk4,pdb2fxb,pdb6icb,pdb1df4,pdb1qwf,pdb1pga,pdb1cc7,pdb1dur,pdb1shf,
pdb1df5,pdb1box,pdb5pcy,pdb1gbq,pdb1d1l,pdb1pgb,pdb1cc8,pdb1shg,pdb1hta,pdb1csk,
pdb1mzl,pdb1vcc,pdb1ycs,pdb1cdz,pdb1mzm,pdb1dt4,pdb1bh0,pdb3il8,pdb1bcg,pdb1dol,
pdb1vqa,pdb1ae3,pdb3ebx,pdb1pnd,pdb1vqb,pdb1lck,pdb1edn,pdb1vqc,pdb1f0m,pdb1vqd,
pdb1hsq,pdb1csp,pdb1iuz,pdb1vqe,pdb1ctf,pdb1csq,pdb3msi,pdb1rzl,pdb1bpt,pdb1ptq,
pdb1vqf,pdb5rxn,pdb1gcn,pdb1not,pdb1ptr,pdb1vqg,pdb1az5,pdb1rlq,pdb1pnj,pdb1vqh,
pdb4fxc,pdb1aum,pdb7pcy,pdb3gbq,pdb1vqi,pdb1ctj,pdb1vqj,pdb1sn1,pdb2cbp,pdb2ygs,
pdb1knt,pdb5ebx,pdb1nxb,pdb1gkh,pdb1ptx,pdb1eyt,pdb1sn4,pdb1brf,pdb1c6r,pdb1aoj,
pdb1fan,pdb1qke,pdb2hpr,pdb2fdn,pdb451c,pdb1eq7,pdb1gri,pdb5msi,pdb1a7w,pdb2hck,
pdb2ovo,pdb2acy,pdb7rxn,pdb1poh,pdb1a68,pdb1nps,pdb1caa,pdb1aho,pdb5pti,pdb1a8o,
pdb1sip,pdb1bxu,pdb1bb9,pdb1aie,pdb3icb,pdb1bdo,pdb1bxv,pdb1fas,pdb1a70,pdb1coa,
pdb1pgx,pdb2pcy,pdb1cad,pdb1esr,pdb1awd,pdb1nkd,pdb2igd
Wenn man in die PDB Datenbank geht, kann man jeden dieser Codes (ohne das vorangestellte pdb) dort in der Suchleiste eingeben (Beispiel: 1mof) und erhält dann alle Strukturinformationen zum betreffenden Protein.

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Dennis Kautz
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#7 Ungelesener Beitrag von Dennis Kautz » 27.03.2008 12:59

Wo könnte das denn im Wiki hinpassen? Wenn wir das nur in den GAH-Beitrag schreiben, findet es kaum einer...

Basler

Re: Genome@home Ergebnisse...

#8 Ungelesener Beitrag von Basler » 09.07.2008 17:00

Sagt mal, kann es sein, dass seit ein paar Tagen mal wieder G@H-WUs bei F@H laufen? Da waren welche, die waren in weniger als 3 Stunden auf einem meiner Kerne (2,2 Ghz) dann mal durch..
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