Wechsel auf CASP5 erfolgt

Nachricht

VadderSchlumpf · #25 Ungelesener Beitrag von **VadderSchlumpf** » 30.05.2002 21:13

Hallo!

Also, ich habe jetzt mal gemessen:

Bei dem letzten Protein habe ich für 1000 Strukturen ca. 20 Minuten gebraucht. Für das neue Protein, ebenfalls für 1000 Strukturen brauch ich jetzt 1 Stunde und 8 Minuten.
Das ist 3 Mal so lang!!!

Jetzt haben wir erst recht keine Chance mehr, aufzuholen

Gruß,
VadderSchlumpf

al · #26 Ungelesener Beitrag von al » 30.05.2002 21:29

Demnach macht es nun wieder Sinn für mich zu Muon zurück zu kehren.

Machts gut, und danke für den Fisch!

P.S.:
Bis ich was besseres finde, faltet meine Linux-Büchse noch ne Runde weiter. Und mein Rechner auf der Arbeit bis Montag ebenfalls.

#27 Ungelesener Beitrag von **Michael H.W. Weber** » 30.05.2002 22:11

@VadderSchlumpf: Du hast es durchschaut - der historische 25-Strukturen-CASP5-Moment war leider ein vergänglicher und ich Idiot habe nicht mal dran gedacht, einen ScreenShot zu machen - für das Album der ewigen Rechenkraftler...

Was die Länge des Proteins betrifft: Hatte ich doch schon gepostet, daß es 182 AS lang ist und auch, daß der Rechenbedarf bei Proteinstrukturvorhersagungen nicht linear mit ihrer Größe steigt.

Was glaubt ihr wohl, weshalb ich die Büchse bis zum Anschlag am Ende aufgerissen habe, während die anderen Teams ja teilweise auch recht schöne Produktionsrückgänge aufweisen.

Hier die gute Nachricht: Allen anderen Teams geht es genauso, d.h. der Rechenaufwand steigt doch für alle proportional! Also: Nicht locker lassen und rangefaltet, daß die Bytes rechts und links nur so wegsplattern!

Michael.

VadderSchlumpf · #28 Ungelesener Beitrag von **VadderSchlumpf** » 30.05.2002 22:17

Also ich bleibe gerade jetzt weiter dabei, mehr noch, ich lasse meinen Rechner so oft es geht über Nacht laufen.

Leider hab ich nur den einen

Habe auch bis zum Proteinwechsel mitgefaltet. Andere Projekte waren als "Zwischenprojekte" nicht geeignet, weil sie zu viel CPU-Zeit für eine WU in Anspruch nehmen.

Also dann, rangefaltet!

Gruß,
VadderSchlumpf

#29 Ungelesener Beitrag von **GrafZahl** » 30.05.2002 22:52

Arrrrgh, und ich Idiot habe heute vergessen, meine Strukturen noch abzuliefern

Nun hatte ich die schon extra heute Morgen auf ZIP gespielt und mit in die Firma genommen UND - verpennt!

Velociraptor · #30 Ungelesener Beitrag von **Velociraptor** » 30.05.2002 23:25

arg dass is mir gerade fast genau so gegangen habe mir gedacht dass ich noch bis zum abend ein paar strukturen berechen jedoch wie ich online geh sehe ich

new version aviable

blödblödblöd

Abdhul · #31 Ungelesener Beitrag von **Abdhul** » 30.05.2002 23:38

Tja, hab auch grad ca. 25.000 Strukturen "verschenkt"! War leider wärend der Umstellung nicht zu Hause.
Dafür gehts jetzt mit voller Kraft voraus!

Grüße, Paul

#32 Ungelesener Beitrag von **GrafZahl** » 31.05.2002 06:43

Abdhul hat geschrieben:Tja, hab auch grad ca. 25.000 Strukturen "verschenkt"! War leider wärend der Umstellung nicht zu Hause.
Dafür gehts jetzt mit voller Kraft voraus!

Tja, es ist nur schade, daß ich jetzt wohl mehrere Tage für die verschenkten Strukturen rechnen muß.
Eigentlich sollte der Server zumindest noch einen oder zwei Tage nach einem Update Strukturen annehmen. Ansonsten geht doch bei jedem Update eine Menge Arbeit flöten.
Die Alternative wäre natürlich, einen Tag vorher jede Arbeit an dem 'alten' Projekt einzustellen

#33 Ungelesener Beitrag von **GrafZahl** » 31.05.2002 15:11

al hat geschrieben:Ich freue mich schon auf Freitag. Dann besorge ich mir nen Wagen und morgens kommt noch ein Paket und dann stelle ich daheim meinen zweiten Server um von einem P2-350 auf einen Duron-1200. Das sollten noch einige Falten mehr auf die Stirn gezaubert werden können als bisher. Zumal die Linux-Version deutlich schneller ist als die Windows-Version.

Ist das wirklich wahr, daß die Linux-Version schneller ist? Schneller als die Windows-Konsolen Version?

Xentar · #34 Ungelesener Beitrag von **Xentar** » 31.05.2002 16:16

GrafZahl hat geschrieben:
al hat geschrieben:Ich freue mich schon auf Freitag. Dann besorge ich mir nen Wagen und morgens kommt noch ein Paket und dann stelle ich daheim meinen zweiten Server um von einem P2-350 auf einen Duron-1200. Das sollten noch einige Falten mehr auf die Stirn gezaubert werden können als bisher. Zumal die Linux-Version deutlich schneller ist als die Windows-Version.
Ist das wirklich wahr, daß die Linux-Version schneller ist? Schneller als die Windows-Konsolen Version?

Also, wenn das stimmt:
Gibt es nen Emulator, mit dem man Linux Programme unter Windows laufen lassen kann?

Andersrum gibts ja schon welche.

#35 Ungelesener Beitrag von **Michael H.W. Weber** » 31.05.2002 21:07

Abdhul hat geschrieben:Tja, hab auch grad ca. 25.000 Strukturen "verschenkt"! War leider wärend der Umstellung nicht zu Hause.
Dafür gehts jetzt mit voller Kraft voraus!

Heb' den Kram auf - nach CASP geht's an der unterbrochenen Stelle weiter - dann lannst Du die noch hochladen!

Michael.

Abdhul · #36 Ungelesener Beitrag von **Abdhul** » 01.06.2002 10:10

Michael H.W. Weber hat geschrieben: Heb' den Kram auf - nach CASP geht's an der unterbrochenen Stelle weiter - dann lannst Du die noch hochladen!

Michael.

Uups, das hab ich vergessen, jetzt sind schon alle über den Jordan gegangen!

Grüße, Paul