Phase III wird vorgezogen

[vfrey]

http://www.distributedfolding.org/news.html

Da das CASP5-Projekt begonnen hat, wird DF Ende nächster Woche von Phase 1b direkt zu Phase III übergehen....

[Bananeweizen]

Das heißt vor allem, daß alle Leute ohne Netzanbindung ihren Keller spätestens Mittwoch nochmal leer machen sollten. Bisher hat der Server nach einer WU-Umstellung ja auch keine alten WUs mehr angenommen. Und da wäre es doch echt schade drum.

Ciao, Michael.

[VadderSchlumpf]

Was hat es denn mit den ganzen Phasen auf sich!? Ich versteh das nicht so ganz.

By the way, ist der DF-Server gerade down? Ich glaube ich kann keine Strukturen mehr senden, auch nicht mit dem Mirror, also am Clienten kanns nicht liegen.

Der trotzdem weiterfaltende
VadderSchlumpf

[vfrey]

http://www.distributedfolding.org/science.html

Hier wird das mit den Phasen, also der ursprünglich vorgesehene Projektablauf, geschildert...

[Bananeweizen]

Was hat es denn mit den ganzen Phasen auf sich!?

http://www.distributedfolding.org/science.html

So zwei Seiten nach unten scrollen, da sind die Phasen beschrieben.

Ciao, Michael.

[VadderSchlumpf]

Hm, obwohl ich ein klein wenig Englisch kann verstehe ich den Text trotzdem noch nicht so.

Könnte mir das vielleicht nochmal jemand in eigenen Worten erklären? Wäre sehr dankbar!

Gruß,
VadderSchlumpf

[vfrey]

Phase 1a: je 1 Milliarde Strukturen für 5 kleine Proteine mit bekannter Struktur

Phase 1b: je 10 Milliarden Strukturen für 10 mittelgrosse Proteine mit bekannter Struktur (da sind wir aktuell beim ersten !)

Phase 2: je 10 Milliarden Strukturen für 10 unterschiedliche Proteine, die beim CASP4-Projekt Ende 2000 bestimmt wurden

Phase 3: je 10 Milliarden Strukturen für die Proteine, die bei CASP5 erforscht werden (Anzahl der Proteine wird leider nicht angegeben)

[VadderSchlumpf]

Ach so! ZUr Zeit wird also bei DF gar nciht erforscht, sondern es wird nur getestet, ob die Strukturen übereinstimmen. Und in der Phase 3 wird dann richtig erforscht!

Aber der Server ist glaube ich immer noch nicht up, oder stimmt was bei mir nicht?
Mein Textclient zeigt da immer so eine komische Meldung an, die dann auch gleich verschwindet. Im Error log ist auch nichts zu finden.

Wenn ich dann den Clienten neu starte, resumt er weiter...

VadderSchlumpf

[Michael H.W. Weber]

By the way, ist der DF-Server gerade down? Ich glaube ich kann keine Strukturen mehr senden, auch nicht mit dem Mirror, also am Clienten kanns nicht liegen.

Gut das ich das lese. Dasselbe hier bei mir. Wollte gerade DF ein für allemale entsorgen, nachdem mein Netz 1a funktioniert und auch die DF-Homepage okay zu sein scheint. Der Klient mosert dauernd an meinem "handle/network" herum. Ich habe es endgültig satt, daß zigtausende von Strukturen hier auf meiner Kiste abgammeln und nicht zurückgeladen werden und uns derweil solche Eintagsfliegen/Deppen wie Advertico-Aktienverklopper-grrrrr-&-böff ein- und dann auch noch überholen. Jetzt habe ich echt die endgültige Haßkappe auf! Auch die Anleitungen zum nachträglichem Upload resultieren bei mir STETS im Verlust aller Daten. Das ist doch total Arsch!

Und dann dieser übereilte Sprung zu Phase III - ebenfalls der totale Schwachsinn. Das System ist doch bestenfalls marginal besser geworden nach der ersten Phase (schaut euch mal vergleichen die RMSDs an). Mir ist schon klar, daß die mit unserer Rechenpower an dem CASP-Wettbewerb teilnehmen wollen. Allerdings haben sie sich im Zeitaufwand der Einzelphaesen wohl MASSIVST verkalkuliert.

Sorry, aber ich mußte jetzt einfach auch mal einen Ablassen.
Michael.

[Bananeweizen]

Auch die Anleitungen zum nachträglichem Upload resultieren bei mir STETS im Verlust aller Daten.

Ich kann dir anbieten, die per Mail/FTP rüberzuschicken und dann von meinem Rechner hochzuladen. Wäre doch schade drum.

Ciao, Michael.

[Michael H.W. Weber]

@Bananeweizen: Danke - ich probiere es später nochmal (vielleicht ist ja doch mit den Servern was nicht okay) ansonsten schicke Dir die letzten verbliebenen Dateien später als Email-Attachment zu.

Michael.

[S_Garbe]

schön, das ich das jetzt lese - da muß ich dringend am Montag meine restlichen Bunker leer machen
um fast 3Mio Strukturen wäre es doch wirklich schade

Gruß
Stefan