Genome: what the f***????

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vfrey · #1 Ungelesener Beitrag von **vfrey** » 29.08.2001 22:21

Heute abend war ich nicht zuhause, die letzten 10 Sequences des Genome-Design durften brav vor sich hin rechnen, meine Internet-Connection war gekappt, aber das Modem noch an. Gerade eben komme ich heim, um festzustellen, dass ich offenbar fertiggerechnet habe und auch die nächste WU schon berechne. <IMG SRC="/phpBB/images/smiles/quasi.gif" alt=""> Eigentlich habe ich mir nicht vorgestellt, dass mein PC automatisch eine Verbindung in's Internet vornimmt. Gibt es hierzu eine Voreinstellung im Client, oder haben mich die kleinen Männchen besucht? <IMG SRC="/phpBB/images/smiles/icon_confused.gif" alt="Confused">

LinuxFan · #2 Ungelesener Beitrag von **LinuxFan** » 29.08.2001 23:02

Keine Sorge <IMG SRC="/phpBB/images/smiles/icon_biggrin.gif" alt="Very Happy">

Im Gegensatz zum Folding@Home-Client bietet der Genome@Home-Client seit einiger Zeit eine Art Caching: Wenn eine WU fertig ist und keine Internet-Verbindung besteht (bzw. die Server nicht erreichbar sind <IMG SRC="/phpBB/images/smiles/icon_evil2.gif" alt="Evil HE HE">) beginnt er die gleiche WU mit anderen Werten erneut zu berechnen. (ist, soweit ich weiß, genauso sinnvoll als würde er eine neue WU ziehen)

Es gibt aber anscheinend noch ein paar Probleme: Wenn der Client eine gecachete WU hat und neu gestartet wird, kann es vorkommen, dass er die gecachete WU vergisst oder so... naja, ich weiß das auch nicht so genau, bei mir läuft zur Zeit nur Folding@Home <IMG SRC="/phpBB/images/smiles/icon_razz.gif" alt="Razz">

Also alles im grünen Bereich, rein theoretisch kann der Client Monate ohne Internetverbindung laufen...

_________________

Folding@Home Team Germany - http://www.folding.de

<font size=-1>[ Diese Nachricht wurde geändert von: LinuxFan am 30.08.2001 00:03 ]</font>

vfrey · #3 Ungelesener Beitrag von **vfrey** » 29.08.2001 23:10

Glaube ich aus mehreren Gründen nicht: die "neue" (oder auch alte) WU hat eine andere Anzahl von Aminosäuren (82 statt 71). Wenn ich nicht völlig schiefliege, hat das Protein eine andere Bezeichnung. Obwohl das Modem an war, hat der PC, als ich heimkam, das Modem nicht erkannt. <IMG SRC="/phpBB/images/smiles/icon_evil.gif" alt="Evil or Very Mad">

Vielleicht leide ich heute Abend ja unter einer leichten Form von Paranoia...ich werde mir die Sache das nächste Mal auf jeden Fall ganz genau anschauen. <IMG SRC="/phpBB/images/smiles/sleep.gif" alt="sleeping">

vfrey · #4 Ungelesener Beitrag von **vfrey** » 30.08.2001 17:50

War wohl doch Paranoia...beim nächsten Login hat der Client brav die errechneten Resultate übertragen. 'Nen Schreck hat mir das trotzdem eingejagt. <IMG SRC="/phpBB/images/smiles/icon_blush.gif" alt="blush">

Arnim Weber · #5 Ungelesener Beitrag von **Arnim Weber** » 25.01.2002 17:25

Einfach G@H mit -nonet starten

Gast · #6 Ungelesener Beitrag von **Gast** » 25.01.2002 19:05

LinuxFan hat geschrieben: Im Gegensatz zum Folding@Home-Client bietet der Genome@Home-Client seit einiger Zeit eine Art Caching: Wenn eine WU fertig ist und keine Internet-Verbindung besteht (bzw. die Server nicht erreichbar sind <IMG SRC="/phpBB/images/smiles/icon_evil2.gif" alt="Evil HE HE">) beginnt er die gleiche WU mit anderen Werten erneut zu berechnen. (ist, soweit ich weiß, genauso sinnvoll als würde er eine neue WU ziehen)

Es gibt aber anscheinend noch ein paar Probleme: Wenn der Client eine gecachete WU hat und neu gestartet wird, kann es vorkommen, dass er die gecachete WU vergisst oder so... naja, ich weiß das auch nicht so genau, bei mir läuft zur Zeit nur Folding@Home <IMG SRC="/phpBB/images/smiles/icon_razz.gif" alt="Razz">

Also alles im grünen Bereich, rein theoretisch kann der Client Monate ohne Internetverbindung laufen...

So ist es!

Wenn man länger nicht da ist, stellt man das Modem/Netzverbindung einfach ab und "vergißt" den laufenden Rechner.

Sobald das aktuelle Protein durchgerechnet ist, nimmt der Client sich entweder das noch nicht begonnene Cache-Protein vor oder - falls kein Cache-Protein gespeichert war - startet dasselbe Protein mit anderen "seed"-Werten. Dies ist in der Tat genauso gut, als wenn Du eine neue WU runterladen würdest. Im Fall von vfrey lag noch ein Protein im Cache vor, daher hatte er tatsächlich ein scheinbar "neues" Protein in der Berechnung, als er heimkam. Die Cache-Proteindateien haben übrigens die Endung .2 - mit Genome Spy kann man sich die Detailinformationen holen, was sich für ein Protein dahinter verbirgt.
Jetzt kurz zum "Verlieren" einer WU: man kann GAH auf zwei Arten laufen lassen: 1) Standard mit Netzanschluß oder 2) mit dem Parameter -nonet. Im Fall von -nonet "verliert" der Client nie eine WU. Hat man aber den Client im Standardmode laufen und bricht mit CTRL+C ab BEVOR die erste Sequenz VOLSTÄNDIG erzeugt wurde, dann connected der Client sich beim nächsten Neustart ins Netz und holt eine neu WU. Dann "verliert" er die alte aus dem Gedächtnis. Startet man aber beim nächsten mal mit -nonet - dann "verliert er sie eben nicht - wie oben gesagt.

Also alls im grünen Bereich,
Michael.