SIMAP@HOME

[Der Diplomat]

Tatsächlich hat SIMAP 2 Terraflops zur Verfügung (ca. 10.000 PCs) verglichen mit den zur Zeit ~38 Terraflops von Rosetta.

Quelle: http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/laborjournal.pdf

[scsimodo]

Tatsächlich hat SIMAP 2 Terraflops zur Verfügung (ca. 10.000 PCs) verglichen mit den zur Zeit ~38 Terraflops von Rosetta.

Na ja, zu Zeiten, als SIMAP noch voll gelaufen ist waren es dann doch eher 5-8 TFLOPS. Immer noch wenig im Vergleich zu Rosetta & Co. aber doch schon ne ganze Menge. Für 5 TFLOPS müssen andere Wissenschaftler lange für betteln, bis sie diese Power bekommen...

[Uwe Sänger Herzke]

15. Januar 2007
Neue Workunits: die Berechnung von ca. 150.000 neuen Workunits für die HMMER-Applikation aktualisiert die Domänen in SIMAP auf den Stand von InterPro 14.0. Die Workunits enthalten Modelle aus den InterPro-Datenbanken PFAM, PIR, Superfamily, SMART und TIGRFAM.

Es gibt frische WUs Leute, schnappt sie euch!


Und aus dem Forum dort:

Nein, natuerlich halten wir keine WUs zurueck. Aber die WUs muessen ins boinc System reingeladen werden und das dauert doch seine Zeit. Datenbankserver und Fileserver schaffen so ca. 1000 neue WUs pro 10 Minuten. Wenn nach einiger Zeit jeder ausreichend WUs im Cache hat, haben wir ausreichend unsent WUs.

Beste Gruesse
Thomas

[laguna]

Hat SIMAP eigentlich inzwischen das Problem mit den langsamer rechnenden AMD CPUs in den Griff bekommen?

[scsimodo]

Hat SIMAP eigentlich inzwischen das Problem mit den langsamer rechnenden AMD CPUs in den Griff bekommen?

Anscheinend nicht, meine AMDs schnecken hier noch rum. Meine OSX-Kiste dagegen rennt wie die Hölle, ca. doppelt so schnell wie mein Athlon XP 2600.

[laguna]

Hat SIMAP eigentlich inzwischen das Problem mit den langsamer rechnenden AMD CPUs in den Griff bekommen?

Anscheinend nicht, meine AMDs schnecken hier noch rum. Meine OSX-Kiste dagegen rennt wie die Hölle, ca. doppelt so schnell wie mein Athlon XP 2600.

Gut, dann bleiben die AMDs bei anderen Projekten

[Digger T. Rock]

Wie, was?
Rechnet ein Intel schneller?
Ich habe einen Sempron 3100+ und brauche für eine hmmer WU 01:52h, in welcher Zeit schafft das ein vergleichbarer Intel?

[laguna]

Unter Windows ja. Unter Linux macht es keinen Unterschied.

[scsimodo]

Wie, was?
Rechnet ein Intel schneller?
Ich habe einen Sempron 3100+ und brauche für eine hmmer WU 01:52h, in welcher Zeit schafft das ein vergleichbarer Intel?

Ich kann Dir nur die Zeiten eines Core Duo 1,67GHz anbieten, allerdings unter OSX. Da brauche ich ca. 1h05 bis 1h10 je Core. Wobei da einiges auf die Optimierungen zurückzuführen sein dürfte. Trotzdem kein schlechter Wert, finde ich.

Laut den Top-Computer-Stats bei SIMAP liegt eine 3GHz P4-CPU irgendwo bei 4300-4500 Sek/WU

[oe-floppy]

Mein Core 2 Duo (2,4 GHz) braucht unter Windows 56 min bis 1 Stunde. Ein paar Ausreißer sind auch dabei mit nur 7 min.

[Digger T. Rock]

Vieleicht sollten wir wieder wie früher die Durchschnittszeiten einer WU zu den Projekten angeben. Das würde dann auf den ersten Blick auch zeigen wie lange man rechnen müßte für eine WU.

[Der Diplomat]

Guter Vorschlag.

Lässt sich das im Wiki realisieren?

Eine ultra-genaue Angabe ist nicht notwendig. Ein ungefährer Wert würde ja ausreichen. Eventuell (aber das setzt dann wohl einige Programmierung oder das Suchen nach einem fertigen PHP-Modul voraus) wäre es auch möglich, dass jeder seine Werte auf einer Seite eingibt und fürs Wiki ein Durchschnittswert angezeigt wird...