Rosetta@home beteiligt sich an CAPRI

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#1 Ungelesener Beitrag von **yoyo** » 26.11.2006 19:22

Rosetta@home beteiligt sich an CAPRI Runde 11, eines blinden Proteinstrukturvorhersage Wettbewerbs.

http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum ... hp?id=2626

Sollten wir uns da nicht beteiligen, wo wir doch die 2 Mio bei QMC erreicht haben?

Hier die Seite des Wettbewerbs: http://capri.ebi.ac.uk/round11/round11.html

yoyo

PS: Evtl. kann jemand, der was von der Materie versteht noch den Artikel http://www.rechenkraft.net/wiki/index.php?title=CAPRI erweitern.

#2 Ungelesener Beitrag von **Michael H.W. Weber** » 26.11.2006 23:14

Hierbei geht es nicht um die Vorhersage von Proteinstrukturen, sondern um die Vorhersage von Proteinkomplexbildungen. Das bedeutet: Viele Proteine übernehmen nicht als Einzelmolekül eine Funtkion in der Zelle, sondern erst im Verbund mit einem oder mehreren anderen Proteinen. Diese Aneinanderlagerung (oder auch Komplexbildung bzw. Proteininteraktion) soll vorhergesagt werden. David Bakers Arbeitsgruppe befaßt sich bereits seit einiger Zeit auch mit solchen Fragestellungen und ich würde es schon sinnvoll finden, ihn da zu unterstützen.

Michael.

laguna · #3 Ungelesener Beitrag von **laguna** » 27.11.2006 00:45

Na da dreh ich doch mal die Prioritäten von QMC auf Rosetta...

scsimodo · #4 Ungelesener Beitrag von **scsimodo** » 27.11.2006 18:25

laguna2 hat geschrieben:Na da dreh ich doch mal die Prioritäten von QMC auf Rosetta...

Hmm, werde mal sehen, was ich machen kann. Muss noch meine WCG-WUs loswerden und dann kann ich bis Ende der Woche mitmachen. Dann habe ich Urlaub und meine Rechner @work Pause

#5 Ungelesener Beitrag von **magihatfertig** » 28.11.2006 20:06

ich wer dauch mal wieder Rosetta aufsatteln, solche Wettbewerbe find ich super interessant!

Roland Schneider · #6 Ungelesener Beitrag von **Roland Schneider** » 28.11.2006 23:06

Hab schon umgestellt, hab aber noch ein paar LHC-WU's. Dann noch nen 2ten Server, der kann auch noch kräftig mitcrunchen

scsimodo · #7 Ungelesener Beitrag von **scsimodo** » 28.11.2006 23:31

magihatfertig hat geschrieben:ich wer dauch mal wieder Rosetta aufsatteln, solche Wettbewerbe find ich super interessant!

Dann beeilt euch mal alle, Freitag kommen neue SIMAP-WUs

scsimodo · #8 Ungelesener Beitrag von **scsimodo** » 30.11.2006 23:33

Noch immer keine CAPRI-WU! Machen die da wirklich mit?

RT1984 · #9 Ungelesener Beitrag von **RT1984** » 30.11.2006 23:55

Rechne jetzt zu hundert Prozent auf Rosetta. Woran erkennt man ne Capri 11 WU? Gibt die extra credits? Eine Frage nebenbei: Wird bei Rosetta auch so viel optimiert wie bei QMC?

scsimodo · #10 Ungelesener Beitrag von **scsimodo** » 01.12.2006 00:12

RT1984 hat geschrieben:Rechne jetzt zu hundert Prozent auf Rosetta. Woran erkennt man ne Capri 11 WU? Gibt die extra credits? Eine Frage nebenbei: Wird bei Rosetta auch so viel optimiert wie bei QMC?

CAPRI-Wu erkennt man am Namen, die heissen CAPRI_*.
Soviel optimiert wie bei QMC? Creditmäßig? Nicht möglich, Rosetta vergibt server side credits. Die sind zwar gelegentlich unter aller Sau, aber im Mitel ganz anständig. 10% unter dem, was der Standard-Client beantragt. Kann mit Einstein und SETI nicht mithalten, aber das ist ja auch kein Maßstab.

Schla · #11 Ungelesener Beitrag von **Schla** » 01.12.2006 07:04

scsimodo hat geschrieben:Noch immer keine CAPRI-WU! Machen die da wirklich mit?

Ich bin mir da mittlerweile auch nicht mehr so sicher.

Aber bei den Massen an Clients die da z.Zt. mitcrunshen, ist es vielleicht auch normal. ( siehe Server-Status auf http://boinc.bakerlab.org/rosetta/ )

Gruß
Schla

RT1984 · #12 Ungelesener Beitrag von **RT1984** » 01.12.2006 08:58

Ok, das ist schon mal beruhigend, wenn da nicht optimiert werden kann. Aber wenn das so weiter geht, ist die Top 20 bald Vergangenheit für uns

Sollten wir dagegen nicht mal was unternehmen? Ungefähr so wie bei QMC?