Neues Projekt: Docking@Home

Nachricht

#25 Ungelesener Beitrag von **Michael H.W. Weber** » 17.09.2006 14:22

Die hat mittlerweile wohl ihre eigene AG.

Michael.

Uwe Sänger Herzke · #26 Ungelesener Beitrag von **Uwe Sänger Herzke** » 17.09.2006 16:47

Wenn mensch die beiden Teamseiten bei Docking und Predictor vergleicht, werden einige Zusammenhänge deutlich:

http://docking.utep.edu/about_team.php

http://predictor.scripps.edu/about_team.php

Uwe Sänger Herzke · #27 Ungelesener Beitrag von **Uwe Sänger Herzke** » 19.09.2006 18:11

We have finally found the cause of the problem that some users were experiencing on their Linux systems. It has to do with the stacksize setting on your machine which is for some distros (SuSE 9.3 and 10 for example) set to unlimited and for others (FCx, Ubuntu, etc) set to a limited value like 10240. Your setting can be seen by typing 'ulimit -s' in a terminal. To make the Charmm 'exit 1' errors go away, please set the stacksize to unlimited using the command 'ulimit -s unlimited'. This is not saying that Charmm will use all of your memory (it won't), but it gives us a little bit more space to do our simulations correctly and without errors. Please let us know if this does not work for you. If it does work, please add this command to your shell initialization file (.bashrc, .tcshrc, .kshrc, etc) in your home directory. Of course don't forget to resume the D@H project on your boincmgr in case you suspended it before.

Thanks, Andre

Wir haben endlich den Grund für die Probleme gefunden, die manche Benutzer unter ihren Linuxsystemen hatten. Es lag an den Einstellungen der Stackgröße auf den Maschinen, die bei manchen Distros (Suse z.B.) auf unbegrenzt gesetzt sind, während andere (FCx, Ubuntu, etc) den Wert begrenzt haben. Sie können die Einstellung sehen, wenn Sie 'ulimit -s' im Terminalfenster eingeben. Um die Charmm 'exit 1' Fehler verschwinden zu lassen, sollten Sie die Stackgröße freigeben mit dem Befehl 'ulimit -s unlimited'. Das bedeutet nicht, das Charmm allen Speicher nutzen wird (wird es nicht), aber es gibt uns ein wenig mehr Platz um unsere Simulationen korrekt und fehlerfrei durchzuführen. Bitte teilen Sie uns mit wenn es bei Ihnen nicht funktioniert. Wenn es wirkt, fügen Sie diesen befehl Ihrer Shell Initiialisierungsdatei (.bashrc, .tcshrc, .kshrc, etc) in Ihrem Homeverzeichnis zu. Natürlich dürfen Sie nicht vergessen D@H wieder im BOINC-Manager zu starten, falls Sie es suspendiert hatten.

Ich weiß nicht, ob es wirklich hilft, zumal es bei mir eh' noch keine Schwierigkeiten gab mit meinem Suse9.2, aber zumindest ist's 'nen Versuch wert.

huraxprax · #28 Ungelesener Beitrag von **huraxprax** » 19.09.2006 20:13

Es ist ja andersrum, SuSE hat keine ulimits gesetzt aber andere Distributionen deswegen gab es keine Probleme bei SuSE.

Uwe Sänger Herzke · #29 Ungelesener Beitrag von **Uwe Sänger Herzke** » 19.09.2006 20:17

huraxprax hat geschrieben:Es ist ja andersrum, SuSE hat keine ulimits gesetzt aber andere Distributionen deswegen gab es keine Probleme bei SuSE.

Jaja, schon klar, ich werd' auch nix ändern (und bin froh darüber, ich hasse das Terminalfenster).

#30 Ungelesener Beitrag von **Michael H.W. Weber** » 20.09.2006 12:27

Ob die das wohl sauber über ihren Client einstellen können?

Michael.

Uwe Sänger Herzke · #31 Ungelesener Beitrag von **Uwe Sänger Herzke** » 02.10.2006 05:24

Falls jemand Interesse an einem Einladungscode hat, ich habe gerade einen zugesandt bekommen, mit der Auflage ihn nur an Leute weiterzugeben, die a) sich bewußt sind, dass es alpha, sprich buggy, ist und b) auch wirklich rechen wollen.

Wer Lust hat soll mir 'ne pm schicken.

#32 Ungelesener Beitrag von **yoyo** » 02.10.2006 12:52

Ich habe auch einen Invitationcode erhalten. Wer bei dem Projekt mittesten möchte schickt mir am Besten eine PM oder email. Auch Mac und Linux User sind gern gesehen teilzunehmen.
yoyo

#33 Ungelesener Beitrag von **Michael H.W. Weber** » 02.10.2006 13:11

Ich muß gestehen, daß ich noch keine WU gerechnet habe.

Es kamen am Anfang einfach keine und momentan habe ich BBC CPDNet dort laufen und würde aufgrund irgendwelcher Fehler ungern meine bereits seit 15. Mai in Rechnung befindliche WU nicht geschrottet vorfinden. Es ist auch momentan mein einziger Linux-Rechner...

Michael.

#34 Ungelesener Beitrag von **frank** » 02.10.2006 14:14

Michael H.W. Weber hat geschrieben: würde [...] ungern meine bereits seit 15. Mai in Rechnung befindliche WU nicht geschrottet vorfinden.

Mit den Verneinungen ist es aber auch immer so ne Sache, nicht wahr?

Uwe Sänger Herzke · #35 Ungelesener Beitrag von **Uwe Sänger Herzke** » 02.10.2006 15:16

Michael H.W. Weber hat geschrieben:Ich muß gestehen, daß ich noch keine WU gerechnet habe. Es kamen am Anfang einfach keine und momentan habe ich BBC CPDNet dort laufen und würde aufgrund irgendwelcher Fehler ungern meine bereits seit 15. Mai in Rechnung befindliche WU nicht geschrottet vorfinden. Es ist auch momentan mein einziger Linux-Rechner...

Michael.

Ich hab' auch Linux (Suse 9.2) und zu Zeit keinerlei Probleme (die von ganz zu Anfang wurden schnell und gut gelöst).
Manche Distros sollen sich allerdings unschön verhalten.

#36 Ungelesener Beitrag von **Michael H.W. Weber** » 02.10.2006 15:52

frank hat geschrieben:
Michael H.W. Weber hat geschrieben: würde [...] ungern meine bereits seit 15. Mai in Rechnung befindliche WU nicht geschrottet vorfinden.
Mit den Verneinungen ist es aber auch immer so ne Sache, nicht wahr?

Haste Recht.

Sänger hat geschrieben:Ich hab' auch Linux (Suse 9.2) und zu Zeit keinerlei Probleme (die von ganz zu Anfang wurden schnell und gut gelöst).
Manche Distros sollen sich allerdings unschön verhalten.

Habe SUSE 10.0.

Michael.