Aktuelles von Rosetta@home

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
Nachricht
Autor
arminius

Aktuelles von Rosetta@home

#1 Ungelesener Beitrag von arminius » 15.02.2006 18:30

David Baker hat in seinem Post vom gestrigen Tag eine neue Version angekündigt. http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum ... hp?id=1084 Aufgrund des "max. time" Fehlers wurden die WUs verkleinert, was aber nun zu erheblichem traffic geführt hat und somit den web server zu stark in Anspruch nimmt. Zukünftig wird der user selbst in der Lage sein, die Laufzeit der WUs zu beeinflussen. Default-Einstellung wird 8 Stunden sein. Interessant ist dies u.a. auch für Modem-User. Außerdem wird, bis auf einige Ausnahmen, das Ablaufdatum auf 2 Wochen verlängert. Weitere Informationen folgen wohl noch diese Woche.
a.

scsimodo
Vereinsmitglied
Vereinsmitglied
Beiträge: 1856
Registriert: 30.09.2005 19:33
Wohnort: Puchheim

Re: Aktuelles von Rosetta@home

#2 Ungelesener Beitrag von scsimodo » 16.02.2006 09:29

arminius hat geschrieben:David Baker hat in seinem Post vom gestrigen Tag eine neue Version angekündigt. http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum ... hp?id=1084 Aufgrund des "max. time" Fehlers wurden die WUs verkleinert, was aber nun zu erheblichem traffic geführt hat und somit den web server zu stark in Anspruch nimmt. Zukünftig wird der user selbst in der Lage sein, die Laufzeit der WUs zu beeinflussen. Default-Einstellung wird 8 Stunden sein. Interessant ist dies u.a. auch für Modem-User. Außerdem wird, bis auf einige Ausnahmen, das Ablaufdatum auf 2 Wochen verlängert. Weitere Informationen folgen wohl noch diese Woche.
a.
Inwischen gibt es auch ein Rosetta-Alpha-Projekt, das hat wohl schon das angegebene Feature.

http://ralph.bakerlab.org/

Wer von den üblichen Verdächtigen eröffnet ein RKN-Team :D
Ich habe viel Geld für Alkohol, Weiber und schnelle Autos ausgegeben.
Den Rest hab’ ich einfach nur verprasst.

(George Best, britische Fußball-Legende)

Benutzeravatar
Michael H.W. Weber
Vereinsvorstand
Vereinsvorstand
Beiträge: 23154
Registriert: 07.01.2002 01:00
Wohnort: Marpurk

#3 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 16.02.2006 14:09

Fördern, kooperieren und konstruieren statt fordern, konkurrieren und konsumieren.

Bild Bild

arminius

#4 Ungelesener Beitrag von arminius » 16.02.2006 17:51

Hat bei mir heute morgen zwischen Zähne putzen und anziehen leider nur für den eigenen Acc gereicht. Nun hab ich zwar AccNo 103 aber noch keine WU gesehen :cry2:
a.

Benutzeravatar
Michael H.W. Weber
Vereinsvorstand
Vereinsvorstand
Beiträge: 23154
Registriert: 07.01.2002 01:00
Wohnort: Marpurk

#5 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 17.02.2006 11:00

Ich habe seit Anmeldung auch noch keine bekommen.

Michael.
Fördern, kooperieren und konstruieren statt fordern, konkurrieren und konsumieren.

Bild Bild

arminius

#6 Ungelesener Beitrag von arminius » 17.02.2006 18:39

Hab die erste WU nun durchgerechnet. Anscheinend fehlerfrei. Hatte die Einstellung auf 8h vorgenommen und nach 7:56 h war es dann auch geschehen.
a.

Benutzeravatar
Thorm[bd]
Meister-Lektor für wissenschaftliche Bücher
Meister-Lektor für wissenschaftliche Bücher
Beiträge: 582
Registriert: 11.09.2002 13:22
Wohnort: Hamburg

#7 Ungelesener Beitrag von Thorm[bd] » 18.02.2006 14:30

Da ich nicht wusste, wo ich die Frage hinpacken sollte, poste ich mal hier.

Gibt es bei Rosetta eigentlich auch "Monster-WU's"? Mein PC (AMD 2000+) rechnet jetzt seid 1h30 und der Fortschritt steht immer noch auf einem Prozent. Laut Schätzung braucht die WU 147 Stunden bis sie fertig ist und es schaukelt sich minütlich weiter hoch. :o

Die WU heisst

PRODUCTION_ABINITIO_INCREASECYCLES50_1npsA_312_445_0

Grüße
Thorm
Von allen Dingen die mir verloren gegangen,
hab ich an meisten an meinem Verstand gehangen.

Bild

scsimodo
Vereinsmitglied
Vereinsmitglied
Beiträge: 1856
Registriert: 30.09.2005 19:33
Wohnort: Puchheim

#8 Ungelesener Beitrag von scsimodo » 18.02.2006 14:41

Thorm[bd] hat geschrieben:Da ich nicht wusste, wo ich die Frage hinpacken sollte, poste ich mal hier.

Gibt es bei Rosetta eigentlich auch "Monster-WU's"? Mein PC (AMD 2000+) rechnet jetzt seid 1h30 und der Fortschritt steht immer noch auf einem Prozent. Laut Schätzung braucht die WU 147 Stunden bis sie fertig ist und es schaukelt sich minütlich weiter hoch. :o

Die WU heisst

PRODUCTION_ABINITIO_INCREASECYCLES50_1npsA_312_445_0

Grüße
Thorm
Schau mal in der Grafik nach, ob sich noch was tut. Wenn nicht, dann hängt die WU wohl. Poste auch gleich mal wieviel steps die schon gemacht hat, damit ich weiss, was mich erwartet. Hab' mir auch so ein Teil "eingefangen" :D Will ja nicht hoffen, dass die pro Struktur 50 mal soviel steps macht wie normal, ansonsten bringe ich das Ding in hundert Jahren nicht fertig...

[EDIT] Meine WU hat eine Deadline von 7 Tagen, so wild kann es also nicht werden.
Ich habe viel Geld für Alkohol, Weiber und schnelle Autos ausgegeben.
Den Rest hab’ ich einfach nur verprasst.

(George Best, britische Fußball-Legende)

Benutzeravatar
Thorm[bd]
Meister-Lektor für wissenschaftliche Bücher
Meister-Lektor für wissenschaftliche Bücher
Beiträge: 582
Registriert: 11.09.2002 13:22
Wohnort: Hamburg

#9 Ungelesener Beitrag von Thorm[bd] » 18.02.2006 14:48

Oh, gerade hat sie einen Satz auf 25% gemacht, das ist ja sehr merkwürdig. Ich hoffe mal mit der WU ist alles in Ordnung.
Von allen Dingen die mir verloren gegangen,
hab ich an meisten an meinem Verstand gehangen.

Bild

scsimodo
Vereinsmitglied
Vereinsmitglied
Beiträge: 1856
Registriert: 30.09.2005 19:33
Wohnort: Puchheim

#10 Ungelesener Beitrag von scsimodo » 18.02.2006 14:55

Thorm[bd] hat geschrieben:Oh, gerade hat sie einen Satz auf 25% gemacht, das ist ja sehr merkwürdig. Ich hoffe mal mit der WU ist alles in Ordnung.
Nach 1,5 Stunden? Meine Fresse, da muss ich meinen Laptop aber lange laufen lassen.
Bei mir treten aber auch andere Probleme auf, in speziellen Ghost WUs, WUs, die einfach nicht weiterkommen, dann solche Monster-WUs wie jetzt, "no work from project", etc. pp.

Keine guten Vorzeichen für eine Taskforce, besonders weil ich über's WE an die meisten Rechner nicht rankomme.
Ich habe viel Geld für Alkohol, Weiber und schnelle Autos ausgegeben.
Den Rest hab’ ich einfach nur verprasst.

(George Best, britische Fußball-Legende)

arminius

#11 Ungelesener Beitrag von arminius » 18.02.2006 15:01

Monster-WUs sind mir bei Rosetta noch nie untergekommen. Es gibt jedoch einen bekannten "1% bug". Hier wird auch beschrieben, wie man am besten damit umgeht: http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum ... php?id=899
a.

Gast

#12 Ungelesener Beitrag von Gast » 18.02.2006 15:22

arminius hat geschrieben:Monster-WUs sind mir bei Rosetta noch nie untergekommen. Es gibt jedoch einen bekannten "1% bug". Hier wird auch beschrieben, wie man am besten damit umgeht: http://boinc.bakerlab.org/rosetta/forum ... php?id=899
a.
Nö, fällt meine WU nicht drunter, die werkelt ja fleißig. Die "richtigen" 1%-WUs machen rein gar nichts mehr, solche hatte ich auch schon ein paar.

Schätze die macht statt der 34.000 steps 50 mal soviel, also 1,7 Mio. Bei 1,3 Mio bin ich schon, werde hier das Ergebnis posten, wenn es soweit ist. Ist trotzdem suboptimal, wenn die WU nur alle 1 oder mehr Stunden gesichert wird. Kommt auf non-24x7 Maschinen nicht so gut...

Zurück zu „Protein- und Nukleinsäureforschung“