Find-A-Drug endet am 16. Dezember

[Torsten]

Nun, da das Ende von FAD feststeht, muß ich mir leider langsam Gedanken darüber machen, mit welchem Projekt ich weiter machen soll. Vor meiner FAD-Zeit war ich bei SETI aktiv und spiele gegenwärtig mit dem Gedanken auch wieder dorthin zurück zu kehren.

Wohin verschlägt es die anderen, derzeit aktiven FAD-Cruncher? Würde mich nur mal so als kleinen "Denk-Anstoss" interessieren. Ich meine, ich hatte mir ja beim Wechsel von SETI zu FAD schon etwas gedacht, finde im Moment aber kein medizinisches mehr, das mich so anspricht, wie es FAD getan hat ...

Gruß
Torsten

[vfrey]

naja, als biologische Projekte würden sich schon Rosetta, in Kürze SIMAP oder auch World Community Grid anbieten. Ich persönlich werde versuchen, mich weitestgehend an BOINC-Projekte zu halten, da die Plattform im Großen und Ganzen ordentlich läuft und somit auch den Verwaltungsaufwand in Grenzen hält.

[yoyo]

Ich geh zu Einstein, zumindest bis Ende des Jahres.
yoyo

[Torsten]

naja, als biologische Projekte würden sich schon Rosetta, in Kürze SIMAP oder auch World Community Grid anbieten.

Ja, SIMAP scheint recht interessant zu sein, steht leider noch kein definitiver Start-Termin fest und da ich möglichst "nahtlos" wechseln wollte ...

Die anderen beiden. Naja, WCG scheidet bei mir aus, weil es sich da ja technisch gesehen um den UD-Client handeln soll, mit dem ich schon schlechte Erfahrungen gesammelt habe. Und Rosetta, wenn ich die Beschreibung hier auf der Seite richtig verstanden habe geht es dabei in erster Linie darum die Rosetta-Software bzw. Algorithmen zu verbessern (lasse mich aber gerne korrigieren ), glaube nicht daß mir das wirklich zusagen würde ....

Aber was meint ihr zu Folding@home?

Gruß
Torsten

[scsimodo]

Und Rosetta, wenn ich die Beschreibung hier auf der Seite richtig verstanden habe geht es dabei in erster Linie darum die Rosetta-Software bzw. Algorithmen zu verbessern (lasse mich aber gerne korrigieren ), glaube nicht daß mir das wirklich zusagen würde ....

Stimmt schon, bei Rosetta geht es um die Optimierung der Algorithmen um möglichst genaue Vorhersagen zu treffen. Diese Software wird von anderen Projekten und Institutionen dann benutzt um reale Vorhersagen zu berechnen. (soweit habe ich das zumindest verstanden). Ich glaube mich auch zu erinnern, dass es bereits ein oder mehrere DC-Projekte gibt, die die Rosetta-Software verwenden (Folding@home??)

So gesehen machts Du bei Rosetta "Grundlagenforschung", die aber anderen Projekten zugute kommt. Ich finde das schon wichtig, ohne gute Software taugen auch die Projekte, die Rosetta verwenden, nichts. Was ich an Rosetta allerdings klasse finde ist, dass sich die Projektverantwortlichen um Ihre Cruncher kümmern. Die reagieren schnell auf Probleme und die haben sich den Gag mit der "protein lottery" einfallen lassen. In unregelmäßigen Abständen werden die besten Vorhersagen in die Gallerie gestellt. Nette Idee finde ich...

Du könntest auch mal bei Predictor@home vorbeischauen, die berechnen AFAIK "echte" Proteine.

scsimodo

[Dennis Kautz]

Das World Community Grid benutzt soviel ich weiß, den Rosetta-Algorithmus... zusätzlich zum bisherigen UD-Client, der dir ja nicht so zugesagt hat, gibt es jetzt zumindest für Linux einen BOINC-Client... ich denk mal, dass es langfristig auch einen für Windows geben wird...

[Michael H.W. Weber]

Ich glaube mich auch zu erinnern, dass es bereits ein oder mehrere DC-Projekte gibt, die die Rosetta-Software verwenden (Folding@home??)

Nein, Folding@home benutzt nicht Rosetta sondern GROMACS (www.gromacs.org).

Michael.

[Patrick Keller]

Für die, die an medizinischen Projekten interessiert sind:
F@H treibt auch in diesem Gebiet Forschung, sogar ne ganze Menge
Eine kleine Übersicht über die Krankheiten mit denen FAH sich beschäftigt gibts hier: http://folding.stanford.edu/FAQ-diseases.html

Besonders hervorzuheben ist, dass es da auch schon ne Menge Publikationen gab ... Anders als bei Projekten wie Communitx TSC oder D2OL wo man davon noch nichts gesehen hat ...

Folding@Home nutzt im Moment mehrere Molecular Modelling Programme. Unter anderem Amber, Gromacs, Tinker (wird allerdings bald eingestellt) und QMD.

Die unterscheiden sich alle in den verschiedenen Berechnungen, die sie durchführen können und werden so ausgeteilt, dass der Rechner auch die größtmögliche Effizienz hat. (Zum Beispiel benötigt QMD mehr als 200MB Ram und die WUs werden dann nicht an Maschinen verteilt die weniger als 1GB haben)

[vfrey]

Ja, SIMAP scheint recht interessant zu sein, steht leider noch kein definitiver Start-Termin fest und da ich möglichst "nahtlos" wechseln wollte ...

ich habe das dumpfe Gefühl, dass es da bald losgehen könnte...zum erstenmal seit langer Zeit basteln die wieder an ihrer BOINC-Seite herum, das ist doch vielversprechend...

[scsimodo]

ich habe das dumpfe Gefühl, dass es da bald losgehen könnte...zum erstenmal seit langer Zeit basteln die wieder an ihrer BOINC-Seite herum, das ist doch vielversprechend...

Äh, wo denn? Ich sehe da immer noch die Ankündigung, dass es irgendwann mal losgehen soll


scsimodo

[Torsten]

ich habe das dumpfe Gefühl, dass es da bald losgehen könnte...zum erstenmal seit langer Zeit basteln die wieder an ihrer BOINC-Seite herum, das ist doch vielversprechend...

Ok, ich lasse mich gerne überraschen, warten wir es ab

Gruß
Torsten

[vfrey]

Äh, wo denn? Ich sehe da immer noch die Ankündigung, dass es irgendwann mal losgehen soll

die Seite, wo Du Dich in Deinen Account einloggen kannst, ist seit Ewigkeiten erstmals wieder aufrufbar. Um mal halblang zu machen: ein Login ist mir nicht möglich, da SIMAP meinen Accountkey nicht kennt - ich nehme mal an, die Datenbank ist hier noch nicht dahintergeschaltet.