DistributedFolding - wir rutschen ab!

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
Nachricht
Autor
Pascal

#13 Ungelesener Beitrag von Pascal » 15.03.2002 18:59

also ich klinke mich mal wieder ein wenig bei DFP ein.

Benutzeravatar
S_Garbe
Rechenkraft.net-Sponsor
Rechenkraft.net-Sponsor
Beiträge: 1219
Registriert: 09.11.2001 01:00
Wohnort: Kohlstädt

#14 Ungelesener Beitrag von S_Garbe » 15.03.2002 19:09

@Michael - ich hab bei Genome irgendwo gelesen, das man zwar auch ohne Netz arbeiten kann (hab ich auch schon gemacht, aber das nicht über längere Zeit tun sollte da sonst zuviele ähnliche Ergebnisse anfallen oder so ähnlich
ein weiterer Negativpunkt ist die Größe der anfallenden Daten - pro Ergebnis sind das so ein halbes MB - wenn ich die Rechner so teilweise anschaue kommen da pro Tag bestimmt 4 Ergebnisse Raus - das sind im Monat dann 60 MB (wenn ich Pech habe vielleicht auch 120MB) - das dauert dann mit 1-Kanal ISDN eine Ewigkeit die Ergebnisse wegzuschicken - das kann ich mir in meiner Arbeitszeit nicht erlauben (dafür reicht auch keine Mittagspause)
- gut auf ein oder zwei Rechnern wäre es machbar wenn ich Genome irgendwie aus der Taskleiste rausbekomme - geht das irgendwie?

Gruß
Stefan

PS: schau mal wer bei GAH im Team Germany auf Platz 8 steht :wink:

Pascal

Update verfügbar

#15 Ungelesener Beitrag von Pascal » 15.03.2002 21:18

die Seite http://www.distristributedfolding.org ist momentan wegen eines Updates - neues Protein - nicht verfügbar.
Also ist die Grenze von einer Milliarde überschritten, oder sehe ich das nun falsch?

Benutzeravatar
S_Garbe
Rechenkraft.net-Sponsor
Rechenkraft.net-Sponsor
Beiträge: 1219
Registriert: 09.11.2001 01:00
Wohnort: Kohlstädt

#16 Ungelesener Beitrag von S_Garbe » 15.03.2002 21:33

ich hab gerade die Mail dazu bekommen -arbeiten jetzt meine Clients das Wochenende über umsonst? - wenn ja dann werde ich mir für die Zukunft ein anderes Projekt suchen
Gruß
Stefan

Pascal

#17 Ungelesener Beitrag von Pascal » 15.03.2002 21:42

Ich wollte grade ein paar Berechnungen abschicken, aber die kamen nicht an. Die Fehlermeldung hörte sich danach an, als läge ein Netzwerkproblem auf meiner Seite vor, ich war aber ins Netz eingewählt.
Die Seite ist wieder erreichbar :attention:
Ein Update konnte ich downloaden. Allerdings wurde mein Account nicht erkannt ('authentification failed'), somit konnte ich den Client nicht starten. :evil2:

Benutzeravatar
Michael H.W. Weber
Vereinsvorstand
Vereinsvorstand
Beiträge: 23165
Registriert: 07.01.2002 01:00
Wohnort: Marpurk

#18 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 15.03.2002 22:01

Ja. Ein neues DF-Update ist verfügbar. Der alte Client versucht nach Netzzugriff sofort zu aktualisieren und schickt dabei NICHT die erarbeiteten Ergebnisse weg. Alles für die Katz bei mir. :worry: Und dann - wie Pascal schon schrieb -"authentication failed". Klasse. :evil: Hab's Howard Feldman schon auf's Brot geschmiert. :evil2: Also möglichst hurtig alles auf den neuen Client umsatteln, sonst gibt's Probleme und wir werden Platz 10 evt. nicht halten... Ich bin schon zwecks Platzhaltens auf DF übers Wochenende umgestiegen (das neue Protein hat übrigens 36 Aminosäuren, d.h. wirft noch mehr Credits ab, da eben schneller durchgerechnet wird).

@Pascal: in der Tat - das Projekt mit der "engrailed homeodomain" ist abgeschlossen. Der RMSD wurde offenbar nicht weiter verbessert (ich hatte es vor einiger Zeit hier im Forum bereits bemängelt). Aber alle Ergebnisse haben sich um ca. RMSD=3.6 angesiedelt. Ich frage weiterhin, ob der Algorithmus hier limitiert ist.

@Stefan: Ich habe wohl bemerkt, daß Du schon bei uns unter GAH fleißig warst! :good: Weiter so! Man kann GAH (wie übrigens auch FAH) unter FireDaemon ohne Systrayicon laufen lassen. Unter www.firedaemon.com den Kram mal besorgen und testen (Anleitung auf www.folding.de.tf links auf der Mainpage [FAH als Dienst laufen lassen]). Ich habe es bislang allerdings nur auf NT4 & W2K Systemen probiert. Unter XP geht es definitiv nicht. Win98 habe ich noch nicht getestet - sehe aber keinen Grund, warum das nicht laufen sollte. Was die anfallenden Daten betrifft, da weißt Du offenbar mehr als ich - ich kann nicht auf Anhieb sagen, wie groß ein Ergebnis ist. Hast Du auf den Kisten denn nicht genug Platz? Das Wegschicken dauert in der Tat lange... Ich nehme in solchen Fällen die kompletten, komprimierten Verzeichnisse mit nach Hause und schicke den Kram gemütlich von meiner Privatkiste weg (während die Maschinen im Labor bereits wieder weiterarbeiten). :smoking:

Gruß,
Michael.
Zuletzt geändert von Michael H.W. Weber am 15.03.2002 22:24, insgesamt 1-mal geändert.
Fördern, kooperieren und konstruieren statt fordern, konkurrieren und konsumieren.

Bild Bild

Benutzeravatar
S_Garbe
Rechenkraft.net-Sponsor
Rechenkraft.net-Sponsor
Beiträge: 1219
Registriert: 09.11.2001 01:00
Wohnort: Kohlstädt

#19 Ungelesener Beitrag von S_Garbe » 15.03.2002 22:23

@Michael - mit nach Hause nehmen ist nicht - die Kisten haben keinen CD-Brenner und sind so beschissen in die Möbel eingebaut, das ich das halbe Büro zerlegen müßte um an USB oder Parallele Schnittstelle ranzukommen :worry: - und das ganze per Diskette transportieren - nein danke - dann kann ich es besser gleich wegschicken
der Plattenplatz wäre nicht das Problem - so 2-4 GB HDD sind überall frei - nur die würde ich nicht mal über DSL wegschicken wollen :wink:
aber für die zwei Rechner wo es in Frage kommt werde ich es auf jeden Fall mal probieren

leider kann ich meine DF-Rechner erst am Montag umstellen :evil: - wenn die Ergebnisse dann nicht angenommen werden, stelle ich wie schon gesagt meine Unterstützung für DF ein - vielleicht gebe ich da mal wieder GAH eine Chance - obwohl ich da eigentlich bis zum nächsten Client warten wollte - Primärclient bleibt aber erst einmal TSC

Gruß
Stefan

Benutzeravatar
Sven
Vereinsmitglied
Vereinsmitglied
Beiträge: 1310
Registriert: 19.01.2002 01:00

#20 Ungelesener Beitrag von Sven » 15.03.2002 22:26

:D Autoupdate hat gerade bei mir funktioniert. Schade um die nicht berücksichtigten Ergebnisse? Wir sind beim ersten Update der Statistiken schon wieder auf Platz neun. Ich denke da wurde schon etwas abgeliefert.

Tschüs,

Sven :smoking:

Benutzeravatar
Michael H.W. Weber
Vereinsvorstand
Vereinsvorstand
Beiträge: 23165
Registriert: 07.01.2002 01:00
Wohnort: Marpurk

#21 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 15.03.2002 22:26

Hi Stefan - verstehe. Ist in Deinem Fall sicher problematisch mit dem Datentransport. Schön, wenn wir Dich wieder verstärkt bei GAH dabeihaben!!! :good:

Michael.
Fördern, kooperieren und konstruieren statt fordern, konkurrieren und konsumieren.

Bild Bild

Benutzeravatar
Bananeweizen
Urvater
Urvater
Beiträge: 2867
Registriert: 14.06.2001 01:00
Wohnort: Kornwestheim

#22 Ungelesener Beitrag von Bananeweizen » 15.03.2002 22:48

Bei mir hat das Auto-Update auch nicht funktioniert. Nur der manuelle Download.
Und die Ergebnisse sind leider dageblieben. :(
Aber der Client rennt jetzt wie Sau, bei mir sind es 12000 Strukturen pro Stunde.

Ciao, Michael.

Benutzeravatar
S_Garbe
Rechenkraft.net-Sponsor
Rechenkraft.net-Sponsor
Beiträge: 1219
Registriert: 09.11.2001 01:00
Wohnort: Kohlstädt

#23 Ungelesener Beitrag von S_Garbe » 15.03.2002 23:18

@Bananeweizen - meine zwei PIV die ich unter anderem heute Mittag auf DF umgestellt habe machen auch je 10 000 Strukturen pro Stunde - leider mit dem alten Client - und das für rund 60 Stunden - das macht zusammen mit den anderen Clients die auch noch für DF arbeiten ca. 2Millionen Strukturen für die Mülltonne :evil: - für solche Umstellungen sollte wirklich so eine Woche vorher der neue Client zur Verfügung stehen für alle die nicht so schnell reagieren können

Benutzeravatar
Bananeweizen
Urvater
Urvater
Beiträge: 2867
Registriert: 14.06.2001 01:00
Wohnort: Kornwestheim

#24 Ungelesener Beitrag von Bananeweizen » 15.03.2002 23:38

S_Garbe hat geschrieben: ca. 2Millionen Strukturen für die Mülltonne :evil: - für solche Umstellungen sollte wirklich so eine Woche vorher der neue Client zur Verfügung stehen für alle die nicht so schnell reagieren können
Ja, das stimmt. Ich hatte eigentlich auch erwartet, daß der Server weiter die alten Ergebnisse annimmt, denn das ist ja eigentlich in jedem Projekt so üblich, sofern die verwertbar sind.

Ciao, Michael.

Zurück zu „Protein- und Nukleinsäureforschung“