F@H und CASP

[VadderSchlumpf]

Hallo,

da vor kurzem hier eine Zusammenfassung über die Ergebnisse von DF und P@H bei dem letzten CASP-Wettbewerb veröffentlicht wurde, habe ich mich gefragt, warum F@H eigentlich nicht bei so einem Wettbewerb teilnimmt. F@H versucht doch, regeln für das Falten von Proteinen aufzustellen, um so zu sehen, ob ein bestimmtes Protein im Körper falsch gefaltet wird und damit Krankheitsprognosen und mögliche Lösungen zu ermöglichen.

Oder habe ich das falsch verstanden?

Danke und Gruß,
VadderSchlumpf

[Hermes]

Hallo.

Also zunächst verfolgt F@H andere (weitergehende) Ziele bei der Untersuchung von Proteinen. Man untersucht, wie die Faltung von statten geht und wie lange das dauert. Des weiteren forscht man dort an falschen Faltungen, die für Krankheiten, wie Rinderwahnsinn und anderen in Verbindung stehen.
Theoretisch könnte man auch unbekannte Proteine einfach durchrechnen und anschließend die "besten" Endstrukturen als Strukturvorhersage benutzen (also bei CASP einreichen). Jedoch schätze ich, dass die Berechnung zu lange dauern wird. Außerdem hat ja schon DF gezeigt, dass die Ermittlung der "besten" Struktur nicht so einfach ist, wie sich das vielleicht für einen Laien anhört.

Falls ich irgendwo falsch liege, möge man mich bitte korrigieren.

mfG
Stephan

[Michael H.W. Weber]

FAH würde es im vorgegebenen Zeitrahmen nicht schaffen, eine Vorraussage zu machen. Bei DF war es z.B. so, daß die etwa alle 2 Wochen (!) ein neues Protein zu rechnen hatten. FAH braucht bislang für Peptide (<50 Aminosäuren) mehrere Monate.

Michael.

[www.rekorn.de]

wenn man mit nem rechner mehrere monate bräuchte, würde ich mir eher ein drehbares plastikmodell bauen und es selber falten...