P@H wer weiß was...???

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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arri
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#73 Ungelesener Beitrag von arri » 16.07.2004 13:57

frank hat geschrieben:Frank hält Michael den Rücken frei, damit sich nicht miese Nörgler von hinten anschleichen. ;) (...)
*Schrotfinte streichel*
du glaubst gar nicht wie lustig sich das anhört! :rofl: :funny:
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frank
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#74 Ungelesener Beitrag von frank » 16.07.2004 14:51

OK, das buche ich jetzt mal unter Stilblüte aus eigener Produktion! :lol:
frank
PS Michael: jetzt werde nur nicht nervös und mache Unsinn mit Deiner Flinte

Sascha_Luehrs

#75 Ungelesener Beitrag von Sascha_Luehrs » 16.07.2004 19:29

Ich frag mich gerade so, wie validieren die eigentlich die Ergebnisse bei CASP? Ich hab gerade auf http://predictor.scripps.edu/gallery.php gesehen, daß ja schon wieder einige neue Modelle - ich bezeichne das mal als "Modelle " - fertig sind, und laut P@h sind das ja die "top 5 predictions for each submitted target." Das ist glaube ich so (habe ich das richtig verstanden(?)), daß die CASP-Leute diese Sequenzen (T0196, T0197 usw) an die Teilnehmer ausgeben, und die sollen dann dafür Strukturvorhersagen erstellen(?)
Aber dabei können sie ja eigentlich kaum natürliche Proteine / Sequenzen nehmen, sonst könnten die Teilnehmer doch wohl schummeln, oder seh ich das falsch? Nehmen die dafür künstliche, konstruierte Sequenzen? Und wenn ja, wie wird dann am Ende des Wettbewerbs festgestellt, inwieweit die Teilnehmer mit ihren Vorhersagen richtig lagen(?) Müssen dazu die Proteine "in echt" hergestellt werden? Oder kann man das irgendwie anhand der zahlenmäßigen Werte in einer Strukturvorhersage beurteilen, "wie richtig" sie ist, d.h. wie nah sie an der Realität liegt?
Zuletzt geändert von Sascha_Luehrs am 16.07.2004 19:39, insgesamt 1-mal geändert.

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Mystwalker
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#76 Ungelesener Beitrag von Mystwalker » 16.07.2004 19:34

Ich meine irgendwo gelesen zu haben, dass die wirklichen Ergebnisse schon vorliegen, aber (noch) nicht veröffentlicht wurden. Es ist also ein Vergleich der Modelle mit der Wirklichkeit möglich.

urban

#77 Ungelesener Beitrag von urban » 16.07.2004 19:44

Mystwalker hat geschrieben:Ich meine irgendwo gelesen zu haben, dass die wirklichen Ergebnisse schon vorliegen, aber (noch) nicht veröffentlicht wurden. Es ist also ein Vergleich der Modelle mit der Wirklichkeit möglich.
Genau. Vor jedem CASP Wettbewerb fragen die Veranstalter bei den Forschern nach welche Strukturen sie denn vorausichtlich in nächster Zeit aufklären werden. Diese Ergebnisse werden dann solange zurückgehalten bis der Wettbewerb vorbei ist. Manchmal kann es auch länger dauern bis die Struktur da ist, manchmal auch zu lange :)

Urban

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Michael H.W. Weber
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#78 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 19.07.2004 09:30

Sascha_Luehrs hat geschrieben:Ich frag mich gerade so, wie validieren die eigentlich die Ergebnisse bei CASP? Ich hab gerade auf http://predictor.scripps.edu/gallery.php gesehen, daß ja schon wieder einige neue Modelle - ich bezeichne das mal als "Modelle "...
Selbst die experimentell bestimmten Proteinstrukturen sind lediglich Modelle - das aber mal nur am Rande. :lol:
Ansonsten hatten die Vorredner völlig Recht: Was bei CASP ausgegeben wird, sind Aminosäuresequenzen, deren zugehörige Proteinstrukturen dem CASP-Konsortium - und sonst niemandem - bekannt sind.

Michael.
Fördern, kooperieren und konstruieren statt fordern, konkurrieren und konsumieren.

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sonnenhexer
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#79 Ungelesener Beitrag von sonnenhexer » 21.07.2004 19:49

Bekomme seit gestern abend folgende Meldung bei P@H:

--- - 2004-07-21 20:47:18 - Fewer active results than CPUs; requesting more work
Predictor@home - 2004-07-21 20:47:18 - Requesting 87509 seconds of work
Predictor@home - 2004-07-21 20:47:18 - Sending request to scheduler: http://predictor.scripps.edu/predictor_cgi/cgi
Predictor@home - 2004-07-21 20:47:44 - Scheduler RPC to http://predictor.scripps.edu/predictor_cgi/cgi succeeded
Predictor@home - 2004-07-21 20:47:44 - Message from server: No work available (there was work but it was committed to other platforms
Predictor@home - 2004-07-21 20:47:44 - No work from project
Predictor@home - 2004-07-21 20:47:44 - Deferring communication with project for 1 minutes and 0 seconds

Sind die nun fertig? :-)
Ich glaube nicht.
Oder liegt das daran, daß ich Windows-BOINC nutze?

Gruß

Michael
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VadderSchlumpf
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#80 Ungelesener Beitrag von VadderSchlumpf » 21.07.2004 20:00

7/20/04
With the help of the boinc-dev team, we have made many changes to the web server configuration and have upgraded our boinc daemons from 3.19 to 3.20. Now (02:00 UTC) the server is up and running again. We will monitor this configuration until tomorrow and will not submit new wu's until then. The web page will stay down until tomorrow as well to make sure queries from the site do not interfere with the server too much. Thanks for your patience!
die testen gerade den server... heute nacht / morgen sollte wieder alles laufen. keine panik :D

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sonnenhexer
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#81 Ungelesener Beitrag von sonnenhexer » 21.07.2004 20:03

Ist aber ein Witz:

kaum habe ich den Post abgeschickt, zieht P@H sich neue WUs :)

Michael
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VadderSchlumpf
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#82 Ungelesener Beitrag von VadderSchlumpf » 21.07.2004 20:09

die webseite ist auch wieder erreichbar :)

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#83 Ungelesener Beitrag von sonnenhexer » 21.07.2004 20:11

Jo,

dafür zieht Seti@Home in BOINC sich keine WUs :(

*argl*

Michael
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Sascha_Luehrs

#84 Ungelesener Beitrag von Sascha_Luehrs » 21.07.2004 20:40

VadderSchlumpf hat geschrieben:die webseite ist auch wieder erreichbar :)
Ich weiss nicht, ob das mitbekommen wurde, aber für mich hört sich diese Nachricht von vorgestern, 19. Juli, danach an, dass der Server überhaupt nur deshalb weg war, weil etliche Leute ihren Client nicht upgedated hatten:

Code: Alles auswählen

7/19/04 -   	 Updates for today:

    * Today while setting the minimum version of the Boinc client required to get work, we have shot ourselves in the foot... Because so many people have not upgraded to 3.20 yet, the cgi handler (the server component that handles all requests for work) couldn't keep pace with the number of requests per second and core dumped on us several times. This was because a lot of clients asked for work, got the answer that there was no work because of the version incompatibility and asked for work again right after that. From 1 came 2, from 2 came 10 and from 10 came a 1000 and that was something the cgi handler couldn't handle and caused the downtime of the server. Because of this the only solution we saw right now was setting the minimum client version back to 3.18.
    * Therefore: PLEASE upgrade to 3.20 as soon as possible so that we can modify the minimum client version without the problems described above. 3.20 fixes a lot of problems with credits and application error handling which will make everybody happier (including us ;-).
Uaahh :devilmad: Wut! :fire: Ja, schlafen die denn da alle? Wieso updaten die denn ihren Client nicht? Das wurde doch gross angekündigt. Mannmannmann :shake:

( ;-) )
Zuletzt geändert von Sascha_Luehrs am 21.07.2004 20:41, insgesamt 1-mal geändert.

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