Dicke WUs, was sind die rechenintensivsten?

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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Michael H.W. Weber
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#25 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 29.03.2004 10:45

Leute - ich habe das doch nun wirklich deutlich erklärt. :help: Das Points/Zeit-Verhältnis sagt überhaupt nichts aus. Grund: Die Zeitmessung, die ihr für die GROMACS WUs vornehmt, basiert auf aktivierten Optimierungen. Genau das aber ist unzulässig. Fazit: Wenn ihr auf euren 3DNow! oder SSE-Maschinen für GROMACS eine Dauer von 4 Stunden ermittelt, ist die REFERENZDAUER deutlich länger. Somit sind eure Points/Zeit-Verhältnisse zu hoch angesetzt (für GROMACS).

Michael.
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MaFi

#26 Ungelesener Beitrag von MaFi » 29.03.2004 10:53

ich glaube, wir reden aneinender vorbei.
wenn ich nun mal einen rechner habe, der die SSE optimierungen unterstützt, ist dann auf meiner maschine - mit SSE - das credits/zeit verhältniss besser. folglich rechne ich lieber gromacs wus. sonst nichts. :D

markus

Gast

#27 Ungelesener Beitrag von Gast » 29.03.2004 13:43

Keller hat geschrieben:Das kann nicht sein ... Starte den Client mal mit -forcesse und überprüfe, ob in der FAHLOG etwas von "Extra SSE boost" steht. Der 3200+ müsste WESENTLICH schneller sein !
hehe, hast recht- das Projekt wird jetzt fast doppelt so schnell berechnet. Warum nicht gleich so ? Davor stand immer "Extra 3DNow boost OK", jetzt steht nur noch "Extra SSE boost OK." - ist aber wirklich einiges schneller :D :good:

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GD69DN
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#28 Ungelesener Beitrag von GD69DN » 29.03.2004 19:01

MaFi hat geschrieben:ich glaube, wir reden aneinender vorbei.
wenn ich nun mal einen rechner habe, der die SSE optimierungen unterstützt, ist dann auf meiner maschine - mit SSE - das credits/zeit verhältniss besser. folglich rechne ich lieber gromacs wus. sonst nichts. :D

markus
Eben, was interessiert es mich wie lange der Rechner ohne Optimierung rechnen würde? ;)
Mich interessiert nur die reale zur Berechnung gebrauchte Zeit. Selbstverständlich ist dabei die Optimierung eingeschaltet sofern sie unterstützt wird. :P

Habe übrigens heute Mittag festgestellt, dass der 1800er XP im Betrieb ohne "prefered project" lief. :oops:
Wie kann ich denn jetzt feststellen, ob der G@H WUs berechnet hat? Die Einstellungen waren natürlich Team 3 von F@H. :roll:
Die "Optimierung" per -advmethods und -forcesse muss ich auch noch einstellen. Geht das auch bei der GUI-Version unter Windows per entsprechender Einstellung bei Start?

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#29 Ungelesener Beitrag von Zahmekoses » 29.03.2004 19:06

GD69DN hat geschrieben:Wie kann ich denn jetzt feststellen, ob der G@H WUs berechnet hat? Die Einstellungen waren natürlich Team 3 von F@H.
ist egal. die G@H WUs werden dem F@H Team nr. 3 zugeordnet ;) (da es G@H selbst nicht mehr gibt sind diese G@H WUs nun diese "F@HWUs ohne Deadline" [nach keller haben diese wohl doch irgendwo ne deadline etc. pp.])

ciao
Zahme
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#30 Ungelesener Beitrag von GD69DN » 29.03.2004 19:24

Naja, eigentlich wollte ich ja wissen, wo ich denn nachschauen kann, ob er G@H WUs berechnet hat oder nicht. ;)
In der Userstatistik http://gah.stanford.edu/userstats.txt tauche ich jedenfalls unter meinen F@H Namen nicht auf. :roll:
Kann natürlich auch sein, dass der nur seit der Umstellung vom 3.24er auf den 4er Client kein "prefered project" mehr hatte und keine einzige Genome WU berechnet hat. :P

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#31 Ungelesener Beitrag von Zahmekoses » 29.03.2004 19:52

du musst auch in den F@H stats schauen und nicht in die G@H stats.

G@H selbst wurde als Projekt beendet (!) [siehe hier im Forum], die Punkte werden in F@H angerechnet und preference gah = andere F@H Wus als bei preference fah.

Wie du genau feststellen willst, welche WUs er berechnet hat: bei den F@H stats für einen selbst gab es ne schöne auflistung der berechneten WUs, jedoch wie du dort rausfinden willst, welche von welcher Preference abstammen *schulterzuck*

ciao
Zahme
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#32 Ungelesener Beitrag von Patrick Keller » 29.03.2004 19:58

Momentan istdas Feature NOCH offline, soll aber noch bis morgen kommen ! Die Projekte mit den Nummern 110x (x ist eine Zahl von 0-9) sind die Projekte ohne Deadline, nur so als kleine Info ;)

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#33 Ungelesener Beitrag von GD69DN » 31.03.2004 22:15

So, gerade habe ich auch so eine "Monster-WU" vom Projekt 858 bekommen. :oops:
[21:01:56] - Preparing to get new work unit...
[21:01:56] + Attempting to get work packet
[21:01:56] - Connecting to assignment server
[21:01:58] - Successful: assigned to (171.67.89.150).
[21:01:58] + News From Folding@Home: Welcome to Folding@Home
[21:01:58] Loaded queue successfully.
[21:02:05] + Closed connections
[21:02:05]
[21:02:05] + Processing work unit
[21:02:05] Core required: FahCore_78.exe
[21:02:05] Core found.
[21:02:05] Working on Unit 09 [March 31 21:02:05]
[21:02:05] + Working ...
[21:02:05]
[21:02:05] *------------------------------*
[21:02:05] Folding@home Gromacs Core
[21:02:05] Version 1.56 (February 2, 2004)
[21:02:05]
[21:02:05] Preparing to commence simulation
[21:02:05] - Assembly optimizations manually forced on.
[21:02:05] - Not checking prior termination.
[21:02:05] - Expanded 388595 -> 1861229 (decompressed 478.9 percent)
[21:02:05] - Starting from initial work packet
[21:02:05]
[21:02:05] Project: 858 (Run 59, Clone 28, Gen 3)
[21:02:05]
[21:02:05] Assembly optimizations on if available.
[21:02:05] Entering M.D.

Gromacs is Copyright (c) 1991-2003, University of Groningen, The Netherlands
This inclusion of Gromacs code in the Folding@Home Core is under
a special license (see http://folding.stanford.edu/gromacs.html)
specially granted to Stanford by the copyright holders. If you
are interested in using Gromacs, visit www.gromacs.org where
you can download a free version of Gromacs under
the terms of the GNU General Public License (GPL) as published
by the Free Software Foundation; either version 2 of the License,
or (at your option) any later version.

[21:02:11] Protein: p858_p53dimer858
[21:02:11]
[21:02:11] Writing local files
[21:02:11] Extra SSE boost OK.
[21:02:11] Writing local files
[21:02:13] Completed 0 out of 2500000 steps (0%)
Mal schauen wie lange der Rechner braucht bis ich die 160 credits dafür gutgeschrieben bekomme. ;) :roll:

Pascal

#34 Ungelesener Beitrag von Pascal » 31.03.2004 22:24

GD69DN hat geschrieben:So, gerade habe ich auch so eine "Monster-WU" vom Projekt 858 bekommen. :oops:
[..
Mal schauen wie lange der Rechner braucht bis ich die 160 credits dafür gutgeschrieben bekomme. ;) :roll:
genau soo eine hab ich gerade vorhin abgeliefert. Hätte auf meinem 1400er Thunderbird sicher 5-7 Tage bei 24/7-Betrieb gebraucht. Meine Rechner sind aber nachts aus, daher hab ich länger daran geknabbert. ;)

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VadderSchlumpf
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#35 Ungelesener Beitrag von VadderSchlumpf » 01.04.2004 14:01

hab auch gerade die zweite davon, dauern auf meinem athlon mit 1500 mhz ca. 61 h

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#36 Ungelesener Beitrag von GD69DN » 01.04.2004 20:53

Ich habe den Rechner ausnahmsweise mal über Nacht laufen lassen und ihn erst heute morgen um kurz vor 7 wieder ausgeschaltet. Ich wollte einfach mal wissen was er in der Zeit etwa schafft. Als ich das letzte mal gestern abend auf den Monitor geschaut habe, waren es nämlich immer noch 0%. ;)
Bis zu dem Zeitpunkt des Runterfahrens heute morgen hatte er etwas über 20% der WU berechnet.

Derzeitiger Stand sind 29%, etwas mehr als 1,5 Stunden für 5%.

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