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Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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Pascal

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#1 Ungelesener Beitrag von Pascal » 16.01.2004 08:30

DF News hat geschrieben:01/15/2004
New backend configuration
We are developing a new server configuration on the backend which will allow for more efficient result uploads and processing, and should eliminate upload timeouts and the errors associated with them, such as missing or wrong .val and .trj files. This configuration will come into effect with the next protein update, so as always please report any problems to trades@mshri.on.ca

Scoring function in development
A new scoring function is currently undergoing rigorous testing. If we find it to be more effective than the current function, it will be incorporated into the next update.
Eine neue Serverkonfiguration am Backend wird entwickelt, damit schnellere und fehlerfreiere Uploads möglich werden.
Des weiteren wird eine neue Scoring Funktion entwickelt.
Beides kommt mit dem nächsten Update.

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Michael H.W. Weber
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Re: News

#2 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 16.01.2004 12:21

Pascal hat geschrieben:
DF News hat geschrieben:Scoring function in development
A new scoring function is currently undergoing rigorous testing. If we find it to be more effective than the current function, it will be incorporated into the next update.
Des weiteren wird eine neue Scoring Funktion entwickelt.
Das allerdings lobe ich mir. Da könnte man in der Tat überlegen, ob man mal wieder etwas eifriger mitmacht.

Michael.
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Pascal

#3 Ungelesener Beitrag von Pascal » 16.01.2004 12:28

[quote"Anteraan im DF-Forum"]For reference, the scoring formula is points = INT[100*sqr(gen #)]. From that, even I can see that there are far more structures than there are points. To calculate them, I'll go for a rough estimate:

1 set of 250 gens = 264,270 points = 25,000 structures, which comes out to roughly 10.5708 points per structure

Currently, the Blueprint site is showing roughly 6,682,085,531 points, so divided by the 10.5708 points/struc, that places us in the neighborhood of 632,126,758 structures. This is assuming full sets of 250 for everything turned in, which is most certainly not the case, so that means, in reality, there will be more structures than that completed. How many more, I can't say. But yes, it's less than 6 billion, probably closer to 1 billion.[/quote]
Nur nochmal zur Info, hier der entsprechende Thread

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Michael H.W. Weber
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#4 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 16.01.2004 14:17

Ich will jawohl stark hoffen, daß mit der Scoringfunktion die Art und Weise gemeint ist, mit der der Client aus der Vielzahl generierter Strukturen die beste auswählt und nicht irgendein alberner Statistikfirlefanz. :attention: Letzteres interssiert mich nicht die Bohne. Die sollen sich um die wesentlichen Dinge kümmern - um ihr Ziel nämlich, eine akkurate Proteinstrukturvorhersage zu erreichen. Den anderen Schnickschnack können sie weglassen. Andernfalls muß ich den Client mal endgültig deinstallieren.

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Pascal

#5 Ungelesener Beitrag von Pascal » 16.01.2004 15:55

An der Stelle möchte ich noch erwähnen, daß wir bei diesem Protein bis 10 Milliarden Punkte - nicht Strukturen(!) - rechnen. ;)

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Norman
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#6 Ungelesener Beitrag von Norman » 22.01.2004 18:24

Pascal hat geschrieben:An der Stelle möchte ich noch erwähnen, daß wir bei diesem Protein bis 10 Milliarden Punkte - nicht Strukturen(!) - rechnen. ;)
die 10 Mrd. werden wir wohl auch schneller als sonst bekommen :evil2:

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