GAH: Checksum's don't match

[willmannand]

Hallo zusammen,

ich lasse GAH 4.00 Pre1 unter Linux laufen. Mittlerweile hatte hatte ich zweimal denselben Fehler: nachdem ich mehrere Sequenzen berechnet hatte, hatte ich meinen Rechner runtergefahren und davor GAH mit Strg+C beendet. Nach dem Hochfahren danach (ein paar Stunden später) startete ich GAH und der Client fing mit der Berechnung der Sequenz 1 der gleichen WU an. Die bereits berechneten Sequenzen wurden verworfen. Als Fehlermeldung gab der Client aus:
Checking frame files
- Error: Checksums don't match (work/rotamers.lib)
Starting from initial work packet

Die WU wurde dananach von Anfang an komplett durchgerechnet, daher gehe ich davon aus, daß die WU nicht defekt war. Ich lasse den Rechner meistens rund um die Uhr rechnen, so daß es kein großer Zeitverlust für mich war und es mich nicht großartig belastet hat, was die Statistik angeht. Ich würde mich freuen, wenn ich erfahre, wie ich dieses "Problem umgehen kann oder daß es sich vielleicht um einen seltenes Phänomen handelt, daß nicht erklärt werden kann. Falls ich einen Beitrag mit demselben Inhalt übersehen habe, gebt mir bitte Bescheid, damit ich nicht zuviel Leute mit diesem Problem belästige.

[Michael H.W. Weber]

Für dieses Problem habe ich leider keine Erklärung. Es kommt auch nur ganz selten vor - ich hatte es z.B. in einigen Jahren nicht ein einziges Mal erlebt. Vermutlich ist doch irgendwie beim Beenden des Clients etwas nicht sauber gespeichert worden.
Entschuldige bitte, daß ich nicht mehr weiß. Wenn der Client einen Fehlercode ausgibt, kannst Du gerne diesen Teil des "logs" hier noch einmal posten.

Michael.

[willmannand]

Hier ist der Ausschnitt der Log-Datei:

[13:41:46] [SPG] Designing protein sequence 15 of 30
[13:48:30] [SPG] 10.0 %
[13:54:51] [SPG] 20.0 %
[14:01:01] [SPG] 30.0 %
[14:07:08] [SPG] 40.0 %
[14:13:07] [SPG] 50.0 %
[14:18:57] [SPG] 60.0 %
[14:24:44] [SPG] 70.0 %
[14:30:21] [SPG] 80.0 %
[14:36:39] [SPG] 90.0 %
[14:42:34] [SPG] 100.0 %
[14:42:35] [SPG] Writing current.xyz
[14:42:35] [SPG] Sequence 15 completed:
[14:42:35] ZTRQGYKLWSGYAFKVMLRTFKASEVVEEAKKMESGGQAVSKQESRRQVE . . .
[14:42:35] Iterations: 300 of 600
[14:42:36] Finished
[14:42:38] [SPG] seed: 2112
[14:42:38] [SPG] Designing protein sequence 16 of 30
[14:44:44]
[14:44:44] Folding@Home2 Protein Design Core Shutdown: INTERRUPTED
[14:44:44]
[14:44:44] Folding@Home2 Protein Design Core Shutdown: INTERRUPTED
[14:44:44] CoreStatus = 66 (102)
[14:44:44] + Shutdown requested by user. Exiting.
Folding@home Client Shutdown.


--- Opening Log file [December 10 17:38:39]


# Linux Console Edition #######################################################
###############################################################################

Folding@home Client Version 4.00-Prerelease1

http://folding.stanford.edu

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[17:38:39] - Ask before connecting: No
[17:38:39] - Genome@Home mode
[17:38:39] - User name: willmannand (Team 1737048435)
[17:38:39] - User ID = 693CCF152BE68AC2
[17:38:39] - Machine ID: 1
[17:38:39]
[17:38:40] Loaded queue successfully.
[17:38:40] + Benchmarking ...
[17:38:49]
[17:38:49] + Processing work unit
[17:38:49] Core required: FahCore_ca.exe
[17:38:49] Core found.
[17:38:49] Working on Unit 08 [December 10 17:38:49]
[17:38:49] + Working ...
[17:38:49] Folding@home Protein Design Core Version 2.06 (Feb 25, 2003)
[17:38:49]
[17:38:49] Proj: work/wudata_08
[17:38:49] Finding work files
[17:38:49] sizeof(CORE_PACKET_HDR) = 512
[17:38:49] Checking frame files
[17:38:50] Restarting from checkpointed files.
[17:38:50]
[17:38:50] Protein: Des2/pdb1fvu.31.spa
[17:38:50] - Frames Completed: 300, Remaining: 300
[17:38:50] - Dynamic steps required: 60000
[17:38:50]
[17:38:50] Printed current.prm
[17:38:50] Writing local files:
[17:38:50] - Writing "work/wudata_08.key": (overwrite)successful.
[17:38:50] - Writing "work/wudata_08.xyz": (overwrite)successful.
[17:38:51] - Writing "work/wudata_08.prm": (overwrite)successful.
[17:38:51] Starting design engine
[17:38:51] [SPG] project name: work/wudata_08.
[17:38:51] [SPG] 2 0
[17:38:51] [SPG] Initializing protein design engine
[17:38:51] [SPG] seed = 132
[17:38:51] [SPG] Initialization complete
[17:38:51] [SPG] Writing current.pdb, chainlength = 133
[17:38:51] [SPG] Writing current.xyz
[17:38:51] [SPG] Preprocessing . . .
[17:38:52] [SPG] 133 positions in protein


--- Opening Log file [December 10 17:44:09]


# Linux Console Edition #######################################################
###############################################################################

Folding@home Client Version 4.00-Prerelease1

http://folding.stanford.edu

###############################################################################
###############################################################################



[17:44:09] - Ask before connecting: No
[17:44:09] - Genome@Home mode
[17:44:09] - User name: willmannand (Team 1737048435)
[17:44:09] - User ID = 693CCF152BE68AC2
[17:44:09] - Machine ID: 1
[17:44:09]
[17:44:09] Loaded queue successfully.
[17:44:09] + Benchmarking ...
[17:44:18]
[17:44:18] + Processing work unit
[17:44:18] Core required: FahCore_ca.exe
[17:44:18] Core found.
[17:44:18] Working on Unit 08 [December 10 17:44:18]
[17:44:18] + Working ...
[17:44:19] Folding@home Protein Design Core Version 2.06 (Feb 25, 2003)
[17:44:19]
[17:44:19] Proj: work/wudata_08
[17:44:19] Finding work files
[17:44:19] sizeof(CORE_PACKET_HDR) = 512
[17:44:19] Checking frame files
[17:44:19] - Error: Checksums don't match (work/rotamers.lib)
[17:44:19] Starting from initial work packet
[17:44:19]
[17:45:39] Updating shared core-client information
[17:45:39] - Writing "work/wudata_08.key": (overwrite)successful.
[17:45:39] Key file to update shared file: work/wudata_08.key
[17:45:39] keyfile: 0 133 200 15 2 1 0
[17:45:39] Protein: Des2/pdb1fvu.31.spa
[17:45:39] - Frames Completed: 0, Remaining: 600
[17:45:39] - Dynamic steps required: 120000
[17:45:39]
[17:45:40] Printed current.prm
[17:45:40] Writing local files:
[17:45:40] - Writing "work/wudata_08.key": (overwrite)successful.
[17:45:40] - Writing "work/wudata_08.xyz": (overwrite)successful.
[17:45:40] - Writing "work/wudata_08.prm": (overwrite)successful.
[17:45:41] Starting design engine
[17:45:41] [SPG] project name: work/wudata_08.
[17:45:41] [SPG] 1 0
[17:45:41] [SPG] Initializing protein design engine
[17:45:41] [SPG] seed = 0
[17:45:41] [SPG] Initialization complete
[17:45:41] [SPG] Writing current.pdb, chainlength = 133
[17:45:41] [SPG] Writing current.xyz
[17:45:41] [SPG] Preprocessing . . .
[17:45:41] [SPG] 133 positions in protein
[17:48:24] [SPG] Preprocessing complete
[17:48:24] Iterations: 0 of 600
[17:48:25] Finished
[17:48:25] [SPG] Native chi angles stored
[17:48:28] [SPG] Rotamers read
[17:48:28] [SPG] Starting genetic algorithm
[17:52:07] [SPG] seed: 3093129
[17:52:07] [SPG] Designing protein sequence 1 of 30

Um 17:44:19 kam die Fehlermeldung. Ich habe gerade bemerkt, daß ich den Client zwischendrin beim Preprocessing gestört habe. Kann dies den Fehler der Checksums hervorrufen?

[Patrick Keller]

Ich denke das ist die Ursache für den Fehler, schließlich wurde gerade auf die Dateien zugegriffen und du hast ihn dabei abrupt unterbrochen ...