soll i nun oder soll ich nicht...fehler bei GAH

[maxamd400]

moin @all

tja... worans gelegen hat weiss ich net... nur die console3.25 eingestellt auf GAH machte folgenden fehler...

Ausszug aus der FAHlog.txt

[14:58:23] Iterations: 80 of 600
[14:58:25] Finished
[14:58:27] [SPG] seed: 55505225
[14:58:27] [SPG] Designing protein sequence 5 of 30
[15:08:21] [SPG] 10.0
[15:18:06] [SPG] 20.0
[15:27:19] [SPG] 30.0
[15:37:10] [SPG] 40.0
[15:46:56] [SPG] 50.0
[15:56:11] [SPG] 60.0
[16:04:51] [SPG] 70.0
[16:12:55] [SPG] 80.0
[16:20:58] [SPG] 90.0
[16:26:16] CoreStatus = 1 (1)
[16:26:16] Client-core communications error: ERROR 0x1
[16:26:16] Deleting current work unit & continuing...
[16:26:18] - Warning: Could not delete all work unit files (0): Core returned inv
alid code
[16:26:18] Trying to send all finished work units
[16:26:18] + Sent 0 completed units to the server
[16:26:18] + Attempting to get work packet
[16:26:18] - Connecting to assignment server
[16:26:20] - Successful: assigned to (171.64.122.125).
[16:26:20] + News From Folding@Home: Welcome to Folding@Home
[16:26:20] Loaded queue successfully.
[16:26:24] - Deadline time not received.
[16:26:24] - Receiving payload (expected size: 49622)
[16:26:26] + Received work.
[16:26:26] + Closed connections
[16:26:31]
[16:26:31] + Processing work unit
[16:26:31] Core required: FahCore_ca.exe
[16:26:31] Core found.
[16:26:31] Working on Unit 01 [November 26 16:26:31]
[16:26:31] + Working ...
[16:26:31] - Calling 'FahCore_ca.exe -dir work/ -suffix 01 -forceasm -lifeline 48
04
'

[16:26:32] Folding@home Protein Design Core Version 2.06 (Feb 25, 2003)
[16:26:32]
[16:26:32] Proj: work/wudata_01
[16:26:32] Finding work files
[16:26:32] sizeof(CORE_PACKET_HDR) = 512
[16:26:32] Checking frame files
[16:26:32] - Couldn't open work/wudata_01.chk
[16:26:32] Starting from initial work packet
[16:26:32]
[16:26:33] Updating shared core-client information
[16:26:33] - Writing "work/wudata_01.key": (overwrite)successful.
[16:26:33] Key file to update shared file: work/wudata_01.key
[16:26:33] keyfile: 0 129 200 15 2 1 0
[16:26:33] Protein: Des2/pdb1cuo.25.spa
[16:26:33] - Frames Completed: 0, Remaining: 600
[16:26:33] - Dynamic steps required: 120000
[16:26:33]
[16:26:33] Printed current.prm
[16:26:33] Writing local files:
[16:26:33] - Writing "work/wudata_01.key": (overwrite)successful.
[16:26:33] - Writing "work/wudata_01.xyz": (overwrite)successful.
[16:26:33] - Writing "work/wudata_01.prm": (overwrite)successful.
[16:26:34] Starting design engine
[16:26:34] [SPG] project name: work/wudata_01.
[16:26:34] [SPG] 1 0
[16:26:34] [SPG] Initializing protein design engine
[16:26:34] [SPG] seed = 0
[16:26:35] [SPG] Initialization complete

[16:26:35] [SPG] Writing current.pdb, chainlength = 129

[16:26:35] [SPG] Writing current.xyz

[16:26:35] [SPG] Preprocessing . . .
[16:26:36] [SPG] 129 positions in protein
[16:30:21] [SPG] Preprocessing complete
[16:30:21] Iterations: 0 of 600
[16:30:22] Finished
[16:30:23] [SPG] Native chi angles stored


tja...er aht sich ne neue geholt...kann einer sagen was los war... oder einfach so hinnehmen...will ja auch net jeden fehler hier posten... oder iss das doch besser für die entwickler...???

Grüsse
Thorsten[/b]

[Michael H.W. Weber]

Genau sagen kann ich es leider auch nicht. Sieht aber so aus, als hättest Du eine korrupte WU erhalten. Am besten das "work"-Verzeichnis komplett löschen und den Client dann nochmal starten.

Michael.

[maxamd400]

Moin Michael...

soweit so gut... hab den GAH einfach weiter laufen lassen und eben die alten dateien aus dem verzeichis WORK gelöscht...erkennbar am alten datum u zeit...

Die WU die er sich neu geholt hat...wurde ohne probleme durchgerechnet...

Mit grüssen
Thorsten

[maxamd400]

moin...

na wie soll ich den da mit user "_cha0s_" mithalten wenn ich hier gleich 2 defekte WU bekomme...

und die eine währe bald fertig gewesen...
naja...kann man nix machen... aber das sich beide fast zur gleichen zeit verabschiedet haben ist schon sehr eigenartig...
reichen 1.2 GB festenplatten platz nicht mehr aus... ???

hier mal die log vom clienten 1:

[07:02:19] Iterations: 440 of 600
[07:02:20] Finished
[07:02:23] [SPG] seed: 207289133
[07:02:23] [SPG] Designing protein sequence 23 of 30
[07:14:18] [SPG] 10.0
[07:25:45] [SPG] 20.0
[07:37:03] [SPG] 30.0
[07:48:18] [SPG] 40.0
[07:59:20] CoreStatus = 1 (1)
[07:59:20] Client-core communications error: ERROR 0x1
[07:59:20] Deleting current work unit & continuing...
[07:59:22] - Warning: Could not delete all work unit files (5): Core returned inv
alid code
[07:59:22] Trying to send all finished work units
[07:59:22] + Sent 0 completed units to the server
[07:59:22] + Attempting to get work packet
[07:59:22] - Connecting to assignment server
[07:59:22] Connecting to http://assign.stanford.edu:8080/
[07:59:22] - Couldn't send HTTP request to server
[07:59:22] + Could not connect to Assignment Server
[07:59:22] Connecting to http://assign2.stanford.edu:80/
[07:59:25] Initial: 40AB - Successful: assigned to (171.64.122.125).
[07:59:25] + News From Folding@Home: Welcome to Folding@Home
[07:59:25] Loaded queue successfully.
[07:59:25] Connecting to http://171.64.122.125:80/
[07:59:26] Initial: 0000 - Deadline time not received.
[07:59:26] - Receiving payload (expected size: 51142)
[07:59:28] + Received work.
[07:59:28] + Closed connections
[07:59:33]
[07:59:33] + Processing work unit
[07:59:33] Core required: FahCore_ca.exe
[07:59:33] Core found.
[07:59:33] Working on Unit 06 [December 11 07:59:33]
[07:59:33] + Working ...
[07:59:33] - Calling 'FahCore_ca.exe -dir work/ -suffix 06 -forceasm -lifeline 1468'
[07:59:35] CoreStatus = 63 (99)
[07:59:35] + Error starting core.
[07:59:40]
[07:59:40] + Processing work unit
[07:59:40] Core required: FahCore_ca.exe
[07:59:40] Core found.
[07:59:40] Working on Unit 06 [December 11 07:59:40]
[07:59:40] + Working ...
[07:59:40] - Calling 'FahCore_ca.exe -dir work/ -suffix 06 -forceasm -lifeline 14
68
'

[07:59:43] CoreStatus = 63 (99)
[07:59:43] + Error starting core.
[07:59:43] - Attempting to download new core...
[07:59:43] + Downloading new core: FahCore_ca.exe
[07:59:43] Downloading core (/~pande/Win32/x86//Core_ca.fah from www.stanford.edu
)
[07:59:48] Initial: AFDE + 10240 bytes downloaded
[07:59:48] Initial: 621E + 20480 bytes downloaded
...
...
[08:00:17] Initial: 5E46 + 480026 bytes downloaded
[08:00:18] Verifying core Core_ca.fah...
[08:00:18] Signature is VALID
[08:00:18] Created: Wednesday April 10, 2002 00:01:22 UTC
[08:00:18] Signed: Monday March 3, 2003 00:18:15 UTC
[08:00:18]
[08:00:18] Trying to unzip core FahCore_ca.exe
[08:00:18] Decompressed FahCore_ca.exe (1466368 bytes) successfully
[08:00:18] + Core successfully engaged
[08:00:23]
[08:00:23] + Processing work unit
[08:00:23] Core required: FahCore_ca.exe
[08:00:23] Core found.
[08:00:23] Working on Unit 06 [December 11 08:00:23]
[08:00:23] + Working ...
[08:00:23] - Calling 'FahCore_ca.exe -dir work/ -suffix 06 -forceasm -lifeline 14
68
'
[08:00:25] CoreStatus = 63 (99)
[08:00:25] + Error starting core.
[08:00:30]
[08:00:30] + Processing work unit
[08:00:30] Core required: FahCore_ca.exe
[08:00:30] Core found.
[08:00:30] Working on Unit 06 [December 11 08:00:30]
[08:00:30] + Working ...
[08:00:30] - Calling 'FahCore_ca.exe -dir work/ -suffix 06 -forceasm -lifeline 14
68
'
[08:00:33] CoreStatus = 63 (99)
[08:00:33] + Error starting core.
[08:00:38]
[08:00:38] + Processing work unit
[08:00:38] Core required: FahCore_ca.exe
[08:00:38] Core found.
[08:00:38] Working on Unit 06 [December 11 08:00:38]
[08:00:38] + Working ...
[08:00:38] - Calling 'FahCore_ca.exe -dir work/ -suffix 06 -forceasm -lifeline 14
68
'
[08:00:40] CoreStatus = 63 (99)
[08:00:40] + Error starting core.
[08:00:40] - Attempting to download new core...
[08:00:40] + Downloading new core: FahCore_ca.exe
[08:00:40] Downloading core (/~pande/Win32/x86//Core_ca.fah from www.stanford.edu
)
[08:00:44] Initial: AFDE + 10240 bytes downloaded
[08:00:45] Initial: 621E + 20480 bytes downloaded
...
...
[08:00:52] Initial: 1158 + 471040 bytes downloaded
[08:00:52] Initial: 5E46 + 480026 bytes downloaded
[08:00:52] Verifying core Core_ca.fah...
[08:00:52] Signature is VALID
[08:00:52] Created: Wednesday April 10, 2002 00:01:22 UTC
[08:00:52] Signed: Monday March 3, 2003 00:18:15 UTC
[08:00:52]
[08:00:52] Trying to unzip core FahCore_ca.exe
[08:00:52] - Couldn't open file FahCore_ca.exe
[08:00:52] + Error: Could not extract core
[08:00:52] + Core download error (#2), waiting before retry...

[08:01:07] + Downloading new core: FahCore_ca.exe
[08:01:07] Downloading core (/~pande/Win32/x86//Core_ca.fah from www.stanford.edu
)
[08:01:07] - Could not open Core_ca.fah for writing+ Error: Could not download co
re
[08:01:07] + Core download error (#3), waiting before retry...

[08:01:29] + Downloading new core: FahCore_ca.exe
[08:01:29] Downloading core (/~pande/Win32/x86//Core_ca.fah from www.stanford.edu
)
[08:01:29] - Could not open Core_ca.fah for writing+ Error: Could not download core
[08:01:29] + Core download error (#4), waiting before retry...

[08:01:46] ***** Got a SIGTERM signal (2) from OS

Folding@home Client Shutdown.

-------------------------------------------------------------

hab ihn dann beendet u neu gestartet...

und hier der 2 client

[07:53:08] [SPG] 90.0
[07:58:14] [SPG] 100.0
[07:58:14] [SPG] Writing current.xyz
[07:58:16] [SPG] Sequence 9 completed:
[07:58:16] SEKVTYYEPQPIEKSQIYSNSRKVPMQDNSMLPQSESIEPGYALTVVIYV . . .
[07:58:18] Iterations: 180 of 600
[07:58:19] Finished
[07:58:21] [SPG] seed: 157306930
[07:58:21] [SPG] Designing protein sequence 10 of 30
[08:00:01] CoreStatus = 1 (1)
[08:00:01] Client-core communications error: ERROR 0x1
[08:00:01] Deleting current work unit & continuing...
[08:00:05] Trying to send all finished work units
[08:00:05] + Sent 0 completed units to the server
[08:00:05] + Attempting to get work packet
[08:00:05] - Connecting to assignment server
[08:00:06] - Successful: assigned to (171.64.122.125).
[08:00:06] + News From Folding@Home: Welcome to Folding@Home
[08:00:06] Loaded queue successfully.
[08:00:07] - Deadline time not received.
[08:00:07] - Receiving payload (expected size: 40882)
[08:00:08] + Received work.
[08:00:08] + Closed connections
[08:00:13]
[08:00:13] + Processing work unit
[08:00:13] Core required: FahCore_ca.exe
[08:00:13] Core found.
[08:00:13] Working on Unit 03 [December 11 08:00:13]
[08:00:13] + Working ...
[08:00:13] - Calling 'FahCore_ca.exe -dir work/ -suffix 03 -forceasm -lifeline 12
68
'

[08:00:16] CoreStatus = 63 (99)
[08:00:16] + Error starting core.
[08:00:21]
[08:00:21] + Processing work unit
[08:00:21] Core required: FahCore_ca.exe
[08:00:21] Core found.
[08:00:21] Working on Unit 03 [December 11 08:00:21]
[08:00:21] + Working ...
[08:00:21] - Calling 'FahCore_ca.exe -dir work/ -suffix 03 -forceasm -lifeline 12
68
'

[08:00:23] CoreStatus = 63 (99)
[08:00:23] + Error starting core.
[08:00:23] - Attempting to download new core...
[08:00:23] + Downloading new core: FahCore_ca.exe
[08:00:23] Downloading core (/~pande/Win32/x86//Core_ca.fah from www.stanford.edu
)
[08:00:28] + 10240 bytes downloaded
[08:00:28] + 20480 bytes downloaded
...
...
[08:00:35] + 480026 bytes downloaded
[08:00:35] Verifying core Core_ca.fah...
[08:00:35] Error opening compressed core file
[08:00:35] Failed to verify core
[08:00:35] + Error: Could not extract core
[08:00:35] + Core download error (#2), waiting before retry...

[08:00:47] + Downloading new core: FahCore_ca.exe
[08:00:47] Downloading core (/~pande/Win32/x86//Core_ca.fah from www.stanford.edu
)
[08:00:47] Couldn't send HTTP request to server (wininet)
[08:00:47] Couldn't download www.stanford.edu
[08:00:47] + Error: Could not download core
[08:00:47] + Core download error (#3), waiting before retry...

[08:00:58] + Downloading new core: FahCore_ca.exe
[08:00:58] Downloading core (/~pande/Win32/x86//Core_ca.fah from www.stanford.edu
)
[08:00:58] - Could not open Core_ca.fah for writing+ Error: Could not download co
re
[08:00:58] + Core download error (#4), waiting before retry...

[08:01:23] + Downloading new core: FahCore_ca.exe
[08:01:23] Downloading core (/~pande/Win32/x86//Core_ca.fah from www.stanford.edu
)
[08:01:24] + 10240 bytes downloaded
[08:01:25] + 20480 bytes downloaded
...
...
[08:01:32] + 471040 bytes downloaded
[08:01:32] + 480026 bytes downloaded
[08:01:32] Verifying core Core_ca.fah...
[08:01:32] Error opening compressed core file
[08:01:32] Failed to verify core
[08:01:32] + Error: Could not extract core
[08:01:32] + Core download error (#5), waiting before retry...

[08:01:44] ***** Got a SIGTERM signal (2) from OS

Folding@home Client Shutdown.

-------------------------------------------------------------

ich benutze bei beiden die 3.25-beta...!!!

Grüsse
Thorsten

[Patrick Keller]

Sieht sehr sehr seltsam aus !
Ich empfehle mal alle Files zu löschen und von vorne anzufangen !
(Kann es sein, dass noch ein Thread namens Fahcore_ca.exe läuft ? Wäre für mich die einzige Erklärung warum es zu Fehlern gekommen ist bzw. der Core nicht gestartet werden konnte.)

Bitte vergiss nicht: Das ganze ist BETA und das hat auch seine Gründe

[maxamd400]

ich ahtte jetzt nur einen clienten zu laufen und diese brach mit einer windows fehlermeldung ab.

FAH3.25-Console-beta.exe - Abbild fehlerhaft: Die Anwendung oder DLL C:\WINNT\system32\TAPI32.DLL ist keine gültige Windows-Datei. Überprüfen Sie dies mit der Installationsdiskette.

Ich hab jetzt nachdem nochmal in dem verzeichnis alles gelöscht u nur die FAH3.25-Console-beta.exe gestartet u neu configutiert...
Hoffe das war das problem...

Es laufen bei mir eigentlich immer 2 Fahcore_ca.exe. eine für den 1 und für den 2 clienten... nur kann es daran nicht liegen,weil es ja die letzten 5tage gut ging...
ich denke mal,das es win2k war... das letzte mal booten war am 28.11.03...

mal kurz was zur 4 version...
ich habe festgestellt das diese weit aus langsamer ist... habt ihr das auch festgestellt...???

Grüsse
Thorsten

[Patrick Keller]

Hab ich nicht festgestellt weil das eigentlich net möglich ist. DIe eigentlichen Berechnungen werden von dem Core durchgeführt und der ist derselbe wie vorher !
Meine Vermutung ist/war dass du einen "Geister"-Core laufen hast lassen, der also nicht beendet worden ist und so ständig CPU-Leistung gemampft hat ... Als du versucht hast noch nen Core im selben Ordner zu starten, kam der Fehler in der Fahlog ... vermute ich mal

[willmannand]

Die Version 4 kann, so wie ich es verstanden habe, eigentlich nicht langsamer sein, da der Core derselbe wie bei Version 3.xx ist. Der Core beinhaltet den eigentlichen Algorithmus zur Berechnung der WU's, der Rest ist das Steuerprogramm zum Verwalten des Caches, Versenden der Ergebnisse,... . Die Geschwindigkeit dürfte daher nur von der Grösse des Gens abhängen.

[Michael H.W. Weber]

Hast Du BEIDE Clients auch fein mit -local gestartet? Ansonsten verwundert mich dies nämlich eher wenig nicht. Bitte melden.
Der neue Client ist definitiv NICHT langsamer als der alte und die neuste Version ist die von der Betaseite zu beziehende "pre-release 2" FAH/GAH v4.0. Diese Version bitte auch nehmen.

Typischer Parameterstart:

-local -verbosity 9 -forceSSE (oder falls kein SSE vorhanden, bitte UNBEDINGT -forceasm nehmen)

-send all sendet Ergebnisse manuell ein
-queueinfo zeigt den Inhalt des Caches an

Alle Kommandos für FAH & GAH gültig, allerdings nutzt GAH KEIN GROMACS und damit erübrigt sich -forceSSE bzw. -forceasm (stört aber nicht, also drin lassen, falls der Client mal eine FAH WU holt).

Michael.

[maxamd400]

entschuldigt bitte... die 4 version sollte ein FAH protein berechnen... und da ist mir das aufgefallen...

ich kann ja nochmal nen test machen...

und das der gleiche client nochmal lief schliesse i auch aus... weil i ständig über die taskleiste den task-manager aufrufe um zu sehen welcher client nun gerade läuft, um diesen nicht nochmal zu starten...
Und alle haben einen eigenen namen... z.b. läuft jetzt gerade der FAH3.25-console-GAH.
Ein 2 client für GAH sieht dann so aus...
FAH3.25-console-GAH_2.
Alle haben eine verknüpfung im verzeichnis,von wo aus i diesen starte mit den parametern -local -forceasm -verbosity 9

Ich achte peinlich darauf, das das arbeitsverzeichnis stimmt...

Naja... vielleicht mach ich es auch zu kompliziert...aber mich stört halt eben die leerlaufleistung... und da i am WE 12h arbeiten muss,ist es schon passiert,das die internetverbindung futsch war,der client die fertige WU nicht senden konnte u somit die leerlaufleistung bei 10h lag...

alles zeit die kostbar ist...!!!

Grüsse
Thorsten

[Patrick Keller]

Den Namen den du im Task-Manager siehst ist der Name des "Control-Clients",den man, da geb ich dir ja vollkommen Recht, von Hand startet. Allerdings wird die CPU-Leistung von der Core Datei (Fahcore_ca.exe,Fahcore_68.exe oder Fahcore_78.exe) benutz, weil diese auch die Berechnungen durchführt.

Die Dauer der WUs unterscheidet sich bei FAH von WU zu WU. Eine Übersicht über die WU-Größen gibt diese Seite auf der offiziellen FAH-Homepage: http://folding.stanford.edu/psummary.html

[maxamd400]

@Keller
ja weiss ich...
aber ich sortiere immer unter Prozesse nach CPU-Nutzung...

gerade werkelt er mit 99%, das seit 1h2min mit einer speichernutzung von 19.5 MB...

@Michael
die beiden post haben sich fast überschnitten...
ich werde dann so langsam nochmal auf die 4 version wechseln... wenn ich wieder feststelle das er 15min länger braucht, für ein Finished... melde ich mich wieder...

Grüsse
Thorsten