Wie lange dauert eine WU?

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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Roff
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#37 Ungelesener Beitrag von Roff » 09.11.2003 17:51

Also ich habe auch den Eindruck, dass meine letzte WU nicht voll gezählt worden ist. Leider kann ich es aber nicht beweisen.
Jetzt schaue ich aber mal, wieviel für die nächste dann irgendwann angerechnet wird. Dauert aber noch eine Weile, die hat 146 Positionen und ich bin erst bei 17 von 30 Schritten...
Ich halte mal die Augen offen und den Rechner rattern... :o :crazyeyes: :shocked!:

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Roff
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#38 Ungelesener Beitrag von Roff » 11.11.2003 06:51

So, Rechner hat fertig gerechnet.
Meine WU mit 146 Aminosäuren hat mir bei Genome 58.04 Units eingebracht. Nach dem Tool GAHPointcalculator.exe hätte ich aber 109.062 Punkte bekommen sollen...

Soviel mal dazu.... :(
Gehe jetzt mal Kaffee holen... :)

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henna
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#39 Ungelesener Beitrag von henna » 11.11.2003 09:01

Also bei mir ist es ähnlich: 147 Aminosäuren = 58.03

henna

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Michael H.W. Weber
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#40 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 11.11.2003 13:21

Ich werde nichts unternehmen können, bevor ich von euch keine akkuraten "logs" hier gepostet bekomme, da ich folgende Informationen benötige:

WU-Bezeichnung
WU-Länge (in Aminosäuren)
bekommene Punkte
erwartete Punkte

Am besten hier die inkorrekt bepunkteten WUs sammeln und dann ZUSAMMEN in Stanford melden.

Danke,
Michael.
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Roff
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#41 Ungelesener Beitrag von Roff » 11.11.2003 14:19

Aaaaaaaaalso dann will ich mal ein paar Infos herausrücken. Hoffentlich kannst Du damit 'was anfangen.
Protein: Des2/pdb1ch4.39.spa
chainlength = 146
bekommen: 58.04
erwartet: 109.062

Logfile-Auszug:
19:43:33] [SPG] seed: 249726600
[19:43:33] [SPG] Designing protein sequence 30 of 30
[19:54:50] [SPG] 10.0
[20:05:33] [SPG] 20.0
[20:16:07] [SPG] 30.0
[20:26:25] [SPG] 40.0
[20:36:28] [SPG] 50.0
[20:46:22] [SPG] 60.0
[20:56:10] [SPG] 70.0
[21:05:40] [SPG] 80.0
[21:15:00] [SPG] 90.0
[21:24:07] [SPG] 100.0
[21:24:07] [SPG] Writing current.xyz
[21:24:07] [SPG] Sequence 30 completed:
[21:24:07] VSLENSEKASLJQIFKRMRPEVIGMEALALLLVRYRNTMDFLTSLGDJKQ . . .
[21:24:08] Iterations: 600 of 600
[21:24:09] Finished
[21:24:11] [SPG] Design complete
[21:24:12] [SPG] completed successfully
[21:24:13]
[21:24:13] Finished Work Unit
[21:24:13] work_hdr.len_arcfile: 240900
[21:24:14] Leaving Run
[21:24:17] - Writing 241412 bytes of core data to disk.
[21:24:17] end (WriteWorkResults)
[21:24:17] - Shutting down core
[21:24:17]
[21:24:17] Folding@Home2 Protein Design Core Shutdown: FINISHED_UNIT
[21:24:20] CoreStatus = 64 (100)
[21:24:20] Sending work to server


[21:24:20] + Attempting to send results
[21:38:50] - Unknown packet returned from server, expected ACK for results
[21:38:50] - Error: Could not transmit unit 02 (completed November 10). Keeping unit in queue.


[21:38:50] + Attempting to send results
[21:47:28] + Results successfully sent
[21:47:28] Thank you for your contribution to Folding@home.
[21:47:28] + Number of Units Completed: 12
[21:47:28] + Attempting to get work packet
[21:47:28] - Connecting to assignment server
[21:48:04] - Successful: assigned to (171.64.122.125).
[21:48:04] + News From Folding@Home: Welcome to Folding@Home
[21:48:04] Loaded queue successfully.
[21:48:31] - Deadline time not received.
[21:50:00] + Closed connections

Problem trat auch auf bei:
Protein: Des2/pdb1qto.28.spa
chainlength = 122
bekommen: 51.79
erwartet: 77.958
Beim 2. Protein mit Länge 122 bin ich nur zu 99% sicher, da ich es nicht überwacht habe und nur im Nachhinein analysiert.

Pascal

#42 Ungelesener Beitrag von Pascal » 16.11.2003 18:42

Roff hat geschrieben:So, Rechner hat fertig gerechnet.
Meine WU mit 146 Aminosäuren hat mir bei Genome 58.04 Units eingebracht.
Habe soeben auch eine mit 146 AS erhalten. Mal gucken, wie lange die brauchen wird.

Dennis Kautz
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#43 Ungelesener Beitrag von Dennis Kautz » 17.11.2003 16:20

Hab gerade für eine WU mit 146 AS ganze 27(!!) punkte erhalten. Hoffe mal, da kommt noch was nach :-?

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#44 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 18.11.2003 11:55

frost hat geschrieben:Hab gerade für eine WU mit 146 AS ganze 27(!!) punkte erhalten. Hoffe mal, da kommt noch was nach :-?
Wenn ihr nicht - wie von mir angefragt - die nötige Aufstellung von WU Name, erwarteten Punkten und erhaltenen Punkten vorlegt, kann ich nicht helfen und dann wird auch gewiß nichts nachkommen. :roll:

Michael.
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Dennis Kautz
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#45 Ungelesener Beitrag von Dennis Kautz » 18.11.2003 18:33

Aaaalso: da isses:
Protein: Des2/pdb1ch4.36.spa
Erwartete Punkte: 109,062
Erhaltene Punkte: 27
reicht das, oder brauchst du noch was? 8)

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Michael H.W. Weber
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#46 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 18.11.2003 19:44

Ok. Werde es mal in Stanford melden.

Michael.
[edit]: http://forum.folding-community.org/view ... 9388#49388
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#47 Ungelesener Beitrag von Dennis Kautz » 18.11.2003 20:32

Vielen Dank für deine schnelle Reaktion :)
Mal schauen, ob Stanford das hinkriegt, sonst muss ich mich da doch mal im Forum anmelden :devil:

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#48 Ungelesener Beitrag von Roff » 19.11.2003 07:30

Besten Dank Michael für Deinen Einsatz! :)

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