letzes Protein der Phase II bald komplett !

Nachricht

Norman · #1 Ungelesener Beitrag von **Norman** » 21.10.2003 08:16

hi !

es scheint als ob wir heute das letzte protein fertigstellen werden

!
es kann auch sein, daß heute noch das neue Protein und ein neuer client released werden.

außerdem nimmt das team ProCooling anlauf uns zu überholen.
das kann nicht angehen

Pascal · #2 Ungelesener Beitrag von **Pascal** » 21.10.2003 08:22

tpdooley hat geschrieben: The next protein update (and possibly a program update) will still be Phase II.

Langsam - Phase II ist noch nicht durch, und die Umstellung auf Phase III wird wieder ne grössere Aktion. Mit dem nächsten Update wird wohl auch am Client was geupdatet - aber es kommt definitiv noch ein Protein für Phase II.
In deren News steht noch nichts.

Norman · #3 Ungelesener Beitrag von **Norman** » 21.10.2003 08:28

oh menno

.

ich hab nur in den news vom 07.10 was gelesen und wollt mal nachfragen, ob denn jetzt wirklich nur "energy" berechnet wird und nicht auf RMSD hingerechnet wird ?!

10/07/2003

- We are now on the last protein of our folding 'mini-experiment', protein L with a 14-residue floppy tail removed. Both this protein and protein G (two proteins back) have been folded essentially to completion (well under 3A RMSD) and so the folding pathways we have obtained can be compared to experimental observations of folding pathways, as well as simulated unfolding pathways, to learn a bit more about how proteins fold. As we analyze the data over the next few months we will post results here. For the next protein, we will switch back to an energy-only scoring function (not RMSD-based), so that we will be doing true blind prediction. Thus expect higher RMSDs to native than we have been seeing recently. Our hope, of course, is that we are still able to completely fold proteins using the current approach without using the explicit knowledge of the native structure that we have been using for the last few proteins.

das hört sich doch interessant an und ist auch ne abwechselung

Pascal · #4 Ungelesener Beitrag von **Pascal** » 21.10.2003 08:40

Norman hat geschrieben:oh menno .

ich hab nur in den news vom 07.10 was gelesen und wollt mal nachfragen, ob denn jetzt wirklich nur "energy" berechnet wird und nicht auf RMSD hingerechnet wird ?!

Laut diesem Thread wird noch ein weiteres Protein in Phase II zu berechnen sein - aber schon mit Ausgabe der Energie. Da kommen sicher bald noch etwas offiziellere News, die etwas klarer sein werden.

Norman · #5 Ungelesener Beitrag von **Norman** » 21.10.2003 08:46

Danke Pascal !

dann hilft nur: abwarten und stubbie...emm tee trinken.