keine CPU Auslastung mehr

Nachricht

Shelcon · #1 Ungelesener Beitrag von **Shelcon** » 20.10.2003 14:15

Der GAH TextClient steht bei folgender Ausgabe und arbeitet nicht weiter:

[12:51:24] Hashes matched on file work/wudata_09.dyn
[12:51:24] ARC file integrity verified
[12:51:24] Restarting from checkpointed files.
[12:51:24]
[12:51:24] Protein: p638_L939_K12M_ext
[12:51:24] - Run: 35 (Clone 9, Gen 16)
[12:51:24] - Frames Completed: 5, Remaining: 395
[12:51:24] - Dynamic steps required: 4937500
[12:51:24]
[12:51:25] Writing local files:
[12:51:26]
[12:51:26] parameters          work/wudata_09.prm
[12:51:27] - Writing "work/wudata_09.key": (overwrite) successful.
[12:51:27] - Writing "work/wudata_09.xyz": (overwrite) successful.
[12:51:48] - Writing "work/wudata_09.prm": (overwrite) successful.
[12:53:06] - Writing "work/wudata_09.key": (append) successful.
[12:53:13]
[12:53:13] PROJECT="work/wudata_09", NSTEPS=4937500, DT=2.0000, DTDUMP=25.000000
, TEMP=298.00
[12:53:13] TINKER: Software Tools for Molecular Design
[12:53:13] Version 3.8  October 2000
[12:53:13] Copyright (c)  Jay William Ponder 1990-2000
[12:53:13] portions Copyright (c)  Michael Shirts 2001
[12:53:13] portions Copyright (c)  Vijay S Pande 2001

Was ist zu tun - wann werden die von mir verarbeteten Daten in der Statistik angezeigt? Danke, Conny...

Pascal · #2 Ungelesener Beitrag von **Pascal** » 20.10.2003 14:18

Das sieht nach einer FAH-WU (wegen der Frames) aus. Lösch den Ordner komplett und installier den Konsolenclient neu.

VadderSchlumpf · #3 Ungelesener Beitrag von **VadderSchlumpf** » 20.10.2003 14:18

du hast z.zt nicht genome@home am laufen, sondern folding@home. prüfe noch mal nach, ob du als bevorzugtes projekt gah ausgewählt hast. du solltest dann auch den core mit der endung _ca haben.
aus dem log ist zu erkennen, dass gerade mit dem tinker core gerechnet wurde und der wird nur für f@h eingesetzt

Shelcon · #4 Ungelesener Beitrag von **Shelcon** » 20.10.2003 14:28

Danke für die schnelle Aufklärung!

Shelcon · #5 Ungelesener Beitrag von **Shelcon** » 20.10.2003 14:45

Gut, jetzt bomb ich leider nochmal mit Fragen voll, falls es irgendwo steht - der Verweis ist auch ok!

Ich habe alles bezüglich FAH gelöscht. Neu heruntergeladen die nur die TextClientdatei bei GAH, mit "-config" gestartet, Usernamen wie vor dem GAH Download eingegeben, Germany Team Number und nun das:

Code: Alles auswählen

[13:41:05] Decompressed FahCore_65.exe (1732608 bytes) successfully
[13:41:05] + Core successfully engaged
[13:41:10]
[13:41:10] + Processing work unit
[13:41:10] Core required: FahCore_65.exe
[13:41:10] Core found.
[13:41:10] Working on Unit 01 [October 20 13:41:10]
[13:41:10] + Working ...
[13:41:25] Folding@Home Client Core Version 2.47 (June 14, 2002)
[13:41:25]
[13:41:25] Proj: work/wudata_01
[13:41:30] Done: 22897 -> 142974 (decompressed 624.4 percent)
[13:41:30] nsteps: 5000000 dt: 2.000000 dt_dump: 250.000000 temperature: 532.000
000
[13:41:30] xyzfile:
[13:41:30] "   393  p690_L939_K12M_532K
[13:41:30]      1  N     24.642563  -34.467295  -15.216683    2..."
[13:41:30] keyfile:
[13:41:30] "parameters  ./proj690.prm
[13:41:30] NOVERSION
[13:41:30] ARCHIVE
[13:41:30]
[13:41:30] cutoff        16.0
[13:41:35] taper         12...."
[13:41:35]
[13:41:35] - Couldn't get size info for dyn file: work/wudata_01.dyn
[13:41:35] Starting from initial work packet
[13:41:35]
[13:41:35] Protein: p690_L939_K12M_532K
[13:41:35] - Run: 8 (Clone 15, Gen 5)
[13:41:35] - Frames Completed: 0, Remaining: 400
[13:41:35] - Dynamic steps required: 5000000
[13:41:35]
[13:41:37] Writing local files:
[13:41:37]
[13:41:37] parameters          work/wudata_01.prm
[13:41:37] - Writing "work/wudata_01.key": (overwrite) successful.
[13:41:37] - Writing "work/wudata_01.xyz": (overwrite) successful.
[13:41:55] - Writing "work/wudata_01.prm": (overwrite) successful.
[13:43:26] - Writing "work/wudata_01.key": (append) successful.
[13:43:27]
[13:43:27] PROJECT="work/wudata_01", NSTEPS=5000000, DT=2.0000, DTDUMP=25.000000
, TEMP=532.00
[13:43:32] TINKER: Software Tools for Molecular Design
[13:43:32] Version 3.8  October 2000
[13:43:32] Copyright (c)  Jay William Ponder 1990-2000
[13:43:32] portions Copyright (c)  Michael Shirts 2001
[13:43:32] portions Copyright (c)  Vijay S Pande 2001

Was mach ich falsch?

Pascal · #6 Ungelesener Beitrag von **Pascal** » 20.10.2003 15:02

1. Erstmal nochmal den Ordner löschen, dann:
2. Den Client ohne Option starten.
3. Als MachineID 2 und als Core Pref gah für G@H angeben.

nico · #7 Ungelesener Beitrag von **nico** » 20.10.2003 15:12

Hier ist ein Bild wie die Konfiguration/Installation gemacht werden sollte.

Shelcon · #8 Ungelesener Beitrag von **Shelcon** » 20.10.2003 15:40

Aha, ok, verstanden.

Jetzt siehts so aus und "wartet":

Code: Alles auswählen

[14:29:31] Updating shared core-client information
[14:29:31] - Writing "work/wudata_01.key": (overwrite)successful.
[14:29:35] Key file to update shared file: work/wudata_01.key
[14:29:35]  keyfile: 0 68 200 15 2 1 0
[14:29:35] Protein: SH3ligGH2/pdb1abo.1.spa
[14:29:35] - Frames Completed: 0, Remaining: 600
[14:29:35] - Dynamic steps required: 120000
[14:29:35]
[14:30:20] Printed current.prm
[14:30:22] Writing local files:
[14:30:22] - Writing "work/wudata_01.key": (overwrite)successful.
[14:30:25] - Writing "work/wudata_01.xyz": (overwrite)successful.
[14:30:35] - Writing "work/wudata_01.prm": (overwrite)successful.
[14:30:36] Starting design engine
[14:30:36] [SPG] project name: work/wudata_01.
[14:30:36] [SPG]   1  0
[14:30:37] [SPG] Unrecognized atom
[14:30:37] [SPG] Unrecognized atom
[14:30:37] [SPG] Initializing protein design engine
[14:30:37] [SPG] seed =            0
[14:30:37] [SPG] Initialization complete
[14:30:37] [SPG] Writing current.pdb, chainlength =  68
[14:30:37] [SPG] Writing current.xyz
[14:30:42] [SPG] Preprocessing . . .
[14:30:42] [SPG]    68 positions in protein

Pascal · #9 Ungelesener Beitrag von **Pascal** » 20.10.2003 15:47

Das sieht gut aus!

Shelcon · #10 Ungelesener Beitrag von **Shelcon** » 20.10.2003 16:03

Auch wenn es jetzt seit 20 Minuten nicht weiterging und die CPU Zeit für den Kern nicht mehr als 19 Sekunden beträgt?

Pascal · #11 Ungelesener Beitrag von **Pascal** » 20.10.2003 16:08

Hrm. Das ist verdächtig, da is was faul. Hast du ein Antiviren-Prog laufen - oder wohin geht die CPU-Last?

#12 Ungelesener Beitrag von **Michael H.W. Weber** » 20.10.2003 16:09

Was für eine Maschine ist das? Die WU, die Du da hast, gehört mit 68 Aminosäuren zu den kleineren. Beachte bitte im Taskmanager folgendes. Du findest dort zwei Prozesse, die zu GAH gehören. Einmal "FAH3Console.exe" und einmal "FahCore_ca.exe". Letztere ist die auf die es ankommt. Erstere ist bloss das Steuerprogramm, welches die Starteinstellungen übernimmt sowie den Netzwerkdatentransfer. Am besten Du postet den letzten Abschnitt Deines aktuellen "logs" nochmal um sicher zu gehen.

Michael.