GAH loescht WU ohne zu senden

[ltd]

Hi,
ich habe für den TF Einsatz einen Rechner auf GAH gesetzt. Alles sah auch gut aus bis der Client die erste WU beendet hat. Dabei wurde ausgegeben:

[11:55:36] [SPG] Designing protein sequence 30 of 30
[11:55:43] CoreStatus = 1 (1)
[11:55:43] Client-core communications error: ERROR 0x1
[11:55:43] Deleting current work unit & continuing...

Hurra damit hat der Client die Arbeit von 10 Stunden in die Tonne getreten und sich neue Arbeit geholt. Was läuft da falsch bei mir ?

Lars

[Dennis Kautz]

Poste das am besten mal bei Stanford ins Forum, ich hab von diesem Fehler noch nie was gehört... Die Jungs da müssten eher Bescheid wissen... und Antworten kriegst du da in der Regel viele und gute

[[TDR]Isobuster]

Aber wahrscheinlich nur wenn er auch auf Englisch schreibt, oder gibts da so viele deutsche Postings?

[Dennis Kautz]

Aber wahrscheinlich nur wenn er auch auf Englisch schreibt, oder gibts da so viele deutsche Postings?

Bei Stanford wird generell englisch geschrieben. Allerdings gibt es dort auch genügend Mitglieder deutscher Teams, die gut informiert und ihrer Sprache mächtig sind (einer davon ist MHWW )

Fragen schadet nicht...

[ltd]

Tja eine Suche im Forum hat ergeben das es sich entweder um Folgen
von Overclocking ( bei mir nicht der Fall) oder unbekannten Gründen handelt. ( System ist ansonsten stabil).

Ich werde noch mal eine WU testen, sollte die wieder den Bach runter gehen kann ich leider bei der TF nicht mitmachen.

Lars

[Michael H.W. Weber]

Lars - probier es einfach nochmal. Natürlich ist es frustrierend, aber das ist eine korrupte WU. Ein Problem, das sehr selten auftritt. Beachte unbedingt, den Client korrekt zu beenden, wenn Du z.B. das System runterfährst. Also bei der Konsole CTRL+C gleichzeitig drücken.

Michael.

[René]

Hallo!

Es ist zwar schon spät, aber als ich den Rechner ausmachen wollte, musste ich leider feststellen,
dass der GAH-Client (Version 3.25) einen Fehler verursacht hat und nun wieder von vorn anfängt zu
rechnen. Ich glaube, dies ist vielleicht ein ähnlicher
Fehler wie hier bereits beschrieben.

[21:34:11] [SPG] Sequence 24 completed:
[21:34:11] AWFVAKWYWPASGRATLTVTPGEVLYVVTYTSNAIWVYIVIPQGQGWLPS . . .
[21:34:11] - Error: Couldn't get info for file work/rotamers.tmp
[21:34:11] - Error: Could not calculate checksums
[21:34:11] [SPG] Error: checksum error
[21:34:15] CoreStatus = 63 (99)
[21:34:15] + Error starting core.
[21:34:20]
[21:34:20] + Processing work unit
[21:34:20] Core required: FahCore_ca.exe
[21:34:20] Core found.
[21:34:20] Working on Unit 01 [October 19 21:34:20]
[21:34:20] + Working ...
[21:34:20] Folding@home Protein Design Core Version 2.06 (Feb 25, 2003)
[21:34:20]
[21:34:20] Proj: work/wudata_01
[21:34:20] Finding work files
[21:34:20] sizeof(CORE_PACKET_HDR) = 512
[21:34:21] Checking frame files
[21:34:21] - Error: Couldn't get info for file work/rotamers.tmp
[21:34:21] - Error: Could not calculate checksums
[21:34:21] Starting from initial work packet
[21:34:21]
[21:34:21] Updating shared core-client information
[21:34:21] - Writing "work/wudata_01.key": (overwrite)successful.
[21:34:21] Key file to update shared file: work/wudata_01.key
[21:34:21] keyfile: 0 68 200 15 2 1 0
[21:34:21] Protein: SH3ligGH2/pdb1abo.1.spa
[21:34:21] - Frames Completed: 0, Remaining: 600
[21:34:21] - Dynamic steps required: 120000
[21:34:21]
[21:34:22] Printed current.prm
[21:34:22] Writing local files:
[21:34:22] - Writing "work/wudata_01.key": (overwrite)successful.
[21:34:22] - Writing "work/wudata_01.xyz": (overwrite)successful.
[21:34:22] - Writing "work/wudata_01.prm": (overwrite)successful.
[21:34:23] Starting design engine
[21:34:23] [SPG] project name: work/wudata_01.
[21:34:23] [SPG] 1 0
[21:34:23] [SPG] Unrecognized atom
[21:34:23] [SPG] Unrecognized atom
[21:34:23] [SPG] Initializing protein design engine
[21:34:23] [SPG] seed = 0
[21:34:23] [SPG] Initialization complete
[21:34:23] [SPG] Writing current.pdb, chainlength = 68
[21:34:23] [SPG] Writing current.xyz
[21:34:23] [SPG] Preprocessing . . .
[21:34:23] [SPG] 68 positions in protein
[21:35:07] [SPG] Preprocessing complete
[21:35:07] Iterations: 0 of 600
[21:35:08] Finished
[21:35:08] [SPG] Native chi angles stored
[21:35:09] [SPG] Rotamers read
[21:35:09] [SPG] Unrecognized atom
[21:35:09] [SPG] Unrecognized atom
[21:35:09] [SPG] Starting genetic algorithm
[21:36:08] [SPG] seed: 9254897
[21:36:08] [SPG] Designing protein sequence 1 of 30

Meine Frage: Lohnt es sich diese WU nochmals arbeiten zulassen oder kommt der Fehler an der
gleichen Stelle wieder?

Vielen Dank im voraus

René.

[Michael H.W. Weber]

Ich hatte das Problem noch nie, kann daher keinen getesteten Tipp geben. Aber ich würde die WU löschen. Was noch anzumerken wäre: Version 3.25 ist eine Betaversion. Sie soll ja angeblich stabil laufen - aber evt. ist gerade dieser GAH-spezifische Fehler auf diese Version zurückzuführen? Wenn noch jemand das Problem hat, würde mich interessieren, ob der Version 3.25 benutzt.

Michael.

[René]

Hallo Michael!

Ich habe die WU gelöscht, nachdem das Problem beim zweiten Durchlauf auch auftrat. Die neue WU für GAH lief dann ohne Probleme.

René

[LadySilver]

Gelöscht wurden sie scheinbar nicht, defekt waren sie auch nicht, aber zwischenzeitlich fehlen in meiner Statistik 2 WU's die ich abgeschickt habe. Das erste Mal passierte dies vor zwei Tagen. Und eine WU von gestern vormittag fehlt auch noch.
Laut Log-Datei wurden aber alle ordnungsgemäß gesendet und neue geholt. Ich habe immer nach Abschluß einer WU am PC aufgepasst, und nachgesehen, wenn er abgeschickt hat. Da waren keine Unregelmäßigkeiten.

[ltd]

Nur nicht ungeduldig werden. Eine WU die ich vorgestern Abend übertragen hatte ist irgendwann heute angerechnet worden.

Gruß,

Lars

[Michael H.W. Weber]

Das ist bei GAH nicht ungewöhnlich.

Michael.