filelist.txt corrupt ...!

[Norman]

Hi!

Nun nach upgrade auf die "neue" GUI und gemachten Einstellung lief es den ganzen Tag prima.

Doch nach einem Systemfreeze und Neustart startete ich die GUI und schon sprang mir die Fehlermeldung ins Auge das meine Filelist.txt beschädigt sei und so war es, nämlich LEER !
Beim alten client konnte man die Liste noch von Hand zu Fuß editieren, was auch bei mir fast immer geklappt hat, aber nu will er die nicht mehr fressen !

Gibt es keine andere Möglichkeit die Resultate noch wegzuschicken, so daß sie auch dem Team angerechnet werden können ?




so long...

[Pascal]

Du müsstest die filelist.txt von Hand editieren:

Code: Alles auswählen

.\fold_0_handle_15_handle_protein_22.log.bz2
.\handle_0_handle_protein_22_0000017.val
..

in etwa diesem Stil für alle paarweise vorhandenen Dateien in deinem DF-Verzeichnis.

Danach in der foldit.bat die Optionen -s xxxx und -g xx rausnehmen und -ut eintragen. Dann die foldit.bat starten.

Danach kannst du den client weiterlaufen lassen - Neustart immer über die foldit.bat, falls gewünscht. Weitere Optionen unter "Optimierung des Clients" hier im Forum.[/code]

[Norman]

Hi !

jepp, hab ich gemacht aber er machts nett, weil das in der letzen Zeile (Checksum = so ne Gemeinheit ) nicht mehr stimmt und dess weis ich ja nimmer, weil in der filelist ja garnix mehr drinne war !

Mist! Hab ich wohl den Rechentag und die Resultate verschenkt!

Trotzdem THX !



so long...

[Zeuge]

Hallo Norman

Deine Filelist.txt muß ungefähr so aussehen :

Code: Alles auswählen

oqect6ef_0_protein_0000038.val
fold_0_oqect6ef_35_protein.log.bz2
CurrentStruc 9999000 

Also zuerst die .val Datei und danach die zugehörige .bz2 Datei.

Leider hast Du Dich nicht zu Deinem verwendeten Betriebsystem geäußert.
Falls Du W2k oder XP verwendest kannst Du Dir eine Batchdatei mit folgendem Inhalt erstellen:

Code: Alles auswählen

@echo off
if exist foldtrajlite.lock del foldtrajlite.lock
if exist filelist.txt del filelist.txt
dir *protein*.* /b /O-d >filelist.txt
echo CurrentStruc 9999000 >>filelist.txt
echo Entferne alle falschen Einträge aus der Fodit.bat und speichere sie wieder
pause
.\foldtrajlite -f protein -n native -u t -df -p 5 -rt
if exist filelist.txt del filelist.txt

Also Textdatei mit obigem Inhalt erstellen, im DF Verzeichnis speichern und dann z.B in _makefilelist.bat umbenennen.
Die Datei _makefilelist.bat dann doppelklicken.
Nach Aufforderung, die falschen Einträge zu entfernen, öffnest Du die Filelist.txt und löscht dann z.B die komplette Zeile mit dem Eintrag protein.trj raus.
Datei speichern und schliessen.
Danach einfach im zuvor gestartetet Dosfenster den Befehl: Drücken Sie eine beliebige Taste . . .
befolgen.

Viel Erfolg beim Upload und Wettcrunchen

[Norman]

Hi Zeuge !

Hat leider auch nicht gefunzt!

Hab das an einer korrekten filelist.txt ausprobiert und anschließend protein.trj gelöscht....anschließend war die ebenfalls defekt !

Er schreibt mir ja nicht hin wo der fehler ist wie beim debuggen sondern nur das da irgendwo was nicht stimmt.. ich weis nicht was ich da löschen soll und die Reihenfolge ist bei mir so:

Code: Alles auswählen

fold_0_xxxxxxxx_5704_protein.log.bz2
xxxxxxxx_0_protein_0005705.val
.\fold_0_xxxxxxxx_47_xxxxxxxx_protein_1.log.bz2
.\xxxxxxxx_0_xxxxxxxx_protein_1_0000048.val
fold_0_xxxxxxxx_30_xxxxxxxx_protein_2.log.bz2
xxxxxxxx_0_xxxxxxxx_protein_2_0000031.val
.\fold_0_xxxxxxxx_1_xxxxxxxx_protein_3.log.bz2
.\xxxxxxxx_0_xxxxxxxx_protein_3_0000002.val
.\fold_0_xxxxxxxx_36_xxxxxxxx_protein_4.log.bz2
.\xxxxxxxx_0_xxxxxxxx_protein_4_0000037.val
.\fold_0_xxxxxxxx_7_xxxxxxxx_protein_5.log.bz2
.\xxxxxxxx_0_xxxxxxxx_protein_5_0000008.val
.\fold_0_xxxxxxxx_9_xxxxxxxx_protein_6.log.bz2
.\xxxxxxxx_0_xxxxxxxx_protein_6_0000010.val
.\fold_0_xxxxxxxx_5_xxxxxxxx_protein_7.log.bz2
.\xxxxxxxx_0_xxxxxxxx_protein_7_0000006.val

Also genau umgekehrt - zuerst die bz2 und dann die val !!!
Das Ende der Datei sieht folgendermassen aus:

Code: Alles auswählen

CurrentStruc 0 47 126 37 0 42 10.996 -1974.414 -222.965 -841.371 44591184.000 1.050 1.900 437.252 --HHHH---------------HHHHHHHHHH------------------------HHHHHHHH----------------HHHHH------------
5cec3b71e64f13ee8d9295b62dabbaf6

die letzte zeile ist die checksum und die meckert er an auch wenn die Dateien in der richtigen Reihenfolge stehen....checksum failure etc...

Ich weis nicht wie ich den Mist in die richtige Reihenfolge bekomme und er NICHT die Checksum anmeckert ! Eines tut er immer ! Lösche ich die Checksum geht nicht....ändere ich die Dateireihenfolge geht nicht...lösche ich CurrentStruc geht nicht.....


trotzdem THX Zeuge !

[Midon]

Hi Norman,

kann ich leider auch nur bestätigen. Bei mir waren noch Files drin, obwohl Sie schon übertragen waren. Es gab ja gestern ein kleine Auszeit des Servers und da hatten sich einige Files angesammelt. Während der Übertragung wurde das Programm dann gestoppt (Per dfgui nicht per kill denke ich, war leider nicht dabei ).

Bein starten Heute morgen hat er dann gemault und jeden Dienst eingestellt. Also Leute während einer Übertragung nie das Programm stoppen.

Ich mußte dann am Schluß alles wegwerfen da er nach jeder versuchten Manipulation auch wieder nur gemault hat (Da war mein bestes Ergebnis drin ). Es ist keinerlei Manipulation an filelist.txt mehr möglich.

Werner

[Zeuge]

Wenn die letzte Zeile (Currentstruc) so aussieht wie beim alten Clienten
also z.B Currentstruc 1234567 (wobei ja die Zahl immer größer sein muß als alle anderen der .bz2 Dateien)
dann meckert er nicht mehr und scheint die Dateien wegzuschicken - oder er schiebt sie ins Nirwanna.

Habs grade nochmal mit mehreren Dateien ausprobiert.
Leider wird alles kommentarlos ins Nirwanna geschoben!

Anscheinen sind in der neuen Currentstruc Zeile die zuletzt berechnete Position usw. mit angegeben (an 7. Stelle steht der best RMS)

Midon hat leider Recht
Warum die Projektbetreiber kein Tool zur Verfügung stellen um die verwertbaren Reste einzusammeln verstehe ich nicht.

Naja momentan wird eh an Md@Home gerechnet