Phase II beginnt..

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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rustymax

#13 Ungelesener Beitrag von rustymax » 17.06.2003 11:39

Hat jemand eine Idee wielange Phase II dauern wird?
Ich denke Phase III, der echte Blindtest ist bestimmt interessanter
ist ja auch das Ziel dieses Projektes.

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fw77
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#14 Ungelesener Beitrag von fw77 » 17.06.2003 13:47

Der Server ist noch erreichbar. Zur Zeit lade ich ca. stündlich hoch. Der Wechsel soll wohl aber heute noch stattfinden. Was soll an Phase III interessanter werden? Für die Wissenschaftler vielleicht, aber für uns? Also ich weiß nicht was der Client eigentlich genau macht. Proteinfaltung simulieren ist doch arg wässrig ausgedrückt.

:-?

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Michael H.W. Weber
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#15 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 17.06.2003 16:27

fw77 hat geschrieben:Also ich weiß nicht was der Client eigentlich genau macht. Proteinfaltung simulieren ist doch arg wässrig ausgedrückt.
Also hier im Forum sind eine Reihe von Erläuterungen dazu zu finden. Nochmals ganz kurz. DF simuliert KEINE Proteinfaltung. Dies ist der Fall bei Folding@home. DF versucht die Raumstruktur, also die Anordnung aller Atome eines Proteins im dreidimensionalen Raum, vorherzusagen. Und zwar allein auf der Basis der Aminosäureabfolge. Merke: Proteine sind nichts anderes als eine Aneinanderkettung von Aminosäuren. In Zellen werden 20 verschiedene Aminosäuren verwendet, um zu Proteinen aneinandergekettet zu werden. Beispiele sind Alanin, Glycin, Methionin, usw. Diese Moleküle werden der Vereinfachung halber abgekürzt mit Ala-Gly-Met (3-Buchstabencode) oder A-G-M (1-Buchstabencode). Durch eine Buchstabenfolge kann man also genau die Aminsoäuresequenz eines Proteins beschreiben. Aufgabe von DF ist es nun, die genaue Anordnung dieser Kette im Raum vorherzusagen. :attention:

Jetzt eine Vorstellung davon, was hier das "dreiste Ansinnen" ist? :lol:

Wozu der Spaß? Stell' Dir vor Du könntest akkurat vorhersagen, wie sich eine flugs mal eben ausgedachte Aminosäurefolge räumlich anordnet, sprich - Du wüßtest, wie das Protein später aussehen wird. Dann könntest Du Dir beliebige zelluläre Funktionen designen, denn in Zellen dreht sich alles um Proteine. Du könntest Proteinpolymere basteln, nützlich beim Bau von Nanomaschinen (Proteine sind meines Erachtens ohnehin nichts anderes als Nanomaschinen). Also wenn das nichts ist...

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MaFi

#16 Ungelesener Beitrag von MaFi » 17.06.2003 20:25

hi
ich habe schon erfolgreich das Update gemacht! ist ein 96 AS Protein.

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#17 Ungelesener Beitrag von exec » 17.06.2003 23:01

Ich bleibe noch ne Weile bei MD@Home und dann werde ich zu DF wechseln.
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GooRoo
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#18 Ungelesener Beitrag von GooRoo » 18.06.2003 07:04

Und schon haben wir einen krassen dritten Platz in der "BestRMS Top-Ten" geholt.
:multi: Der Ruhm geht an unseren Teamleiter Michael mit RMS 6.42 in Gen. 30! :party:

Glückwunsch, Alder... :blush: GooRoo

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Michael H.W. Weber
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#19 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 18.06.2003 08:18

GooRoo hat geschrieben:Und schon haben wir einen krassen dritten Platz in der "BestRMS Top-Ten" geholt.
:multi: Der Ruhm geht an unseren Teamleiter Michael mit RMS 6.42 in Gen. 30! :party:

Glückwunsch, Alder... :blush: GooRoo
Jawoll - ich war doch fein überrascht heute morgen. Guter Start in den Tag! :P

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#20 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 18.06.2003 12:06

Konnte soeben auf Platz #2 mit RMSD 6.06 verkürzen. :evil2:

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#21 Ungelesener Beitrag von Independence » 18.06.2003 14:04

Gibt es schon übersichtliche Teamstats?

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#22 Ungelesener Beitrag von exec » 18.06.2003 20:34

Glückwunsch MW
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#23 Ungelesener Beitrag von Patrick Keller » 18.06.2003 20:37

exec hat geschrieben:Glückwunsch MW
Mittlerweile ist er ja wieder auf Nummer 8 gerutscht ...
Ich denke mal da wird sich in der nächsten Zeit, wenn auch so "Low-Falter",die net so viel am Tag machen in die höheren gens kommen, noch einiges tun ...
Da heißt es nur: Schön die Stats beobachten :) :popcorn:
Zuletzt geändert von Patrick Keller am 18.06.2003 20:39, insgesamt 2-mal geändert.

Arnim Weber

#24 Ungelesener Beitrag von Arnim Weber » 18.06.2003 20:38

Wiess jemand, ob diese Statistik-Seite demnächst auf den neuen Client portiert wird?
http://www.statsman.org/distfoldingstats/42.html

:o

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