Optimierungsfrage

[Gast]

Hai Leute,

ich habe mal eine Frage zur Optimierung. Mein Textclient läuft hier unter RedHat 9 (Athlon 1700+, 512 MB RAM) mit

./foldtrajlite -f protein -n native -rt -qt -dt -it

soweit so gut.
Allerdings wenn ich mir die Auslastung mit top anschaue, verbrät der Prozeß nie mehr als 24,5 MB owohl er durch -rt mehr kriegen sollte. Er faltet auch bedeutend langsamer. Unter Sinnlos 2000 funkt. es mit der Einstellung ok, dort zieht er sich ca. 120 MB.

Irgendeine Idee ?
Grüße
Saint

[Saint2002]

Vergeßt es ich bin zu blöd zum gucken!

Grüße
Saint

[shai-hulud]

erst heiß machen und dann doch nix

[Michael H.W. Weber]

./foldtrajlite -f protein -n native -rt -qt -dt -it

-rt -qt -df -g 0 sollte es heißen. -dt und -it sind mir unbekannt. mit -if kannst Du den Netzzugriff unterbinden.

Michael.

[Bananeweizen]

./foldtrajlite -f protein -n native -rt -qt -dt -it

-rt -qt -df -g 0 sollte es heißen. -dt und -it sind mir unbekannt. mit -if kannst Du den Netzzugriff unterbinden.

Ich dächte, mich zu entsinnen, it, dt seien das Gegenteil von if, df (t=true,f=false).

Ciao, Michael.

[Michael H.W. Weber]

Aber dann könnte man die Schalter doch auch einfach weglassen.

Michael.

[Pascal]

Aber dann könnte man die Schalter doch auch einfach weglassen.

Michael.

-iT ja, bei -dT wäre ich vorsichtig, da beim Weglassen eher -dF angenommen wird, und dann beendet sich der Client eventuell nach 6 Strukturpaketen.

[Michael H.W. Weber]

Aber dann könnte man die Schalter doch auch einfach weglassen.

Michael.

-iT ja, bei -dT wäre ich vorsichtig, da beim Weglassen eher -dF angenommen wird, und dann beendet sich der Client eventuell nach 6 Strukturpaketen.

Ich denke eher so: Beim Weglassen jeglicher Schalter werden die "default"-Einstellungen gewählt. Die sind bei -d eben TRUE, d.h. wenn ich -df NICHT einfüge, läuft der Client gemäß Bananeweizen auf -dt und hat damit eine limitierte Zahl an Datensätzen, die er offline anlegen kann, oder?

Michael.

[vollpreller]

sers

ich checks grad gar nicht mehr!

Pascal schrieb:

-iT ja, bei -dT wäre ich vorsichtig, da beim Weglassen eher -dF angenommen wird, und dann beendet sich der Client eventuell nach 6 Strukturpaketen.

auf der Optimierungsseite hier im forum sagst du:

-df : Verhindert ein Stoppen des Clients nach etwa 5 Strukturblöcken

verschrieben ?

bei mir heisst es:

.\foldtrajlite -f protein -n native -df -g 0 -qf -dt -it -rt -s 1000

ich hab -df und -dt drin!
LOL
funzt aber trotzdem ohne Abbruch (momentan beim 244 Block)
sind die wirklich gegensätzlich ?

salut

[Pascal]

sers

..
auf der Optimierungsseite hier im forum sagst du:

-df : Verhindert ein Stoppen des Clients nach etwa 5 Strukturblöcken

verschrieben ?

Ja. Man wird alt. Es sind fünf.

bei mir heisst es:

.\foldtrajlite -f protein -n native -df -g 0 -qf -dt -it -rt -s 1000

ich hab -df und -dt drin!
LOL
funzt aber trotzdem ohne Abbruch (momentan beim 244 Block)
sind die wirklich gegensätzlich ?

salut

Ja. Weil F=FALSE und T=TRUE, man spricht hier von Boolschen Datentypen, welche nur genau diese beiden Werte annehmen können.

Schau's dir nochmal in Ruhe an.

[vollpreller]

servus

ich meine es müsste so heissen:

-iT ja, bei -df wäre ich vorsichtig, da beim Weglassen eher -dt angenommen wird, und dann beendet sich der Client eventuell nach 6 (5)Strukturpaketen

grüsse

christoph