Russisches Projekt - MD@Home - Übersetzer gesucht

[Michael H.W. Weber]

The biggest problem is, that we do not have that many people who know the Russian language well enough for a good translation.

Eben mal Putin anmailen.

@Konstantin & Eduard:
To me this project seems to represent a very valuable addition to what is done by Vijay's Folding@home project in Stanford.
One question: Since your project is not financially funded externally, how much would it cost IN RUSSIA for your workgroup to:

1. buy the equipment for a DSL-like internet connection
2. maintain it on a monthly base

Curious & all the best,
Michael.

P.S.: Ob wir sowas sponsern könnten? Ich finde das Projekt sehr vielversprechend! Ich wäre bereit, dort etwas zu investieren, damit der Ärger mit der iNet-Connection ein Ende hat.

[Ticker]

Hi Michael

Ich halte es für eine sehr gute Idee! Ich bin auf alle fälle dabei. Kostet ja auch nicht die Welt...!!!


Gruß, Peter

[Michael H.W. Weber]

Hi Michael

Ich halte es für eine sehr gute Idee! Ich bin auf alle fälle dabei. Kostet ja auch nicht die Welt...!!!


Gruß, Peter

Eben! Die sollen mal mit Preisen überkommen. Ansonsten könnte man natürlich auch hier eine Website für die einrichten... auch eine Möglichkeit. Mir wäre es aber lieber, sie hätten etwas eigenes in Rußland, damit sie die nötige Kontrolle haben schnell Änderungen vorzunehmen.

Michael.

[exec]

Ich denke, dass wir vielleicht einen Mirror für die Stats hosten könnten?

Kann mir mal jemand überhaupt erklären worum es sich hier um eine Ergänzung zum F@H handeln soll?

Was sind Aminosäuren?

[Michael H.W. Weber]

Ohne bislang die allermeisten Infos zu haben, sieht es so aus, als wenn die Kombination aller möglichen Aminosäuren mittels "molecular dynamics" untersucht werden soll. Dabei geht es zunächst wohl bis maximal 5 Aminosäuren Peptidlänge. Das sind dann immerhin 20 hoch 5 - also 3,2 Millionen verschiedene Pentapeptide.

Aminosäuren sind Moleküle. Es gibt 20 verschiedene Aminosäuren, aus denen in Zellen Proteine (=große Peptide) hergestellt werden. Proteine bestehen aus einer Kette von Aminosäuren. Peptide sind ebenfalls verknüpfte Aminosäuren und Peptide und Proteine unterscheiden sich durch ihre Größe. Ein Protein ist definiert als eine Verknüpfung von mehr als 50 Aminosäuren während ein Peptid weniger als 50 besitzt. Abgespeichert?

Michael.

[Pascal]

Aktuell ist K. Leontiev im Chat.
Wir haben einige Infos erhalten, müssen diese noch übersetzen und zusammenfassen.

[Gast]

...Ein Protein ist definiert als eine Verknüpfung von mehr als 50 Aminosäuren während ein Peptid weniger als 50 besitzt. Abgespeichert?...

Und wie nennt man das Ding mit genau 50 Aminosäuren - Protid oder Peptein?

[Konstantin Leontiev]

1. buy the equipment for a DSL-like internet connection
2. maintain it on a monthly base

1. We don't buy DSL-like internet connections. Our University (MSU) provide all our laboratories by high speed internet that is shortly connected to Biggest Moscow Internet Traffic Exchange Node (M9-IX). So as i know this internet connection is sponsored by different organisation.

2. We maintane our internet connection and servers by ourself. We build and support all of our workstations and servers. So i am an administrator of the MD@home key-server where are Web-Server, SQL server, PHP engine and Mail server. I'm a leader programmer of the client programm and serverside software.
Alexander Belyakov is a leader constructorer of the molecules.
Eduard Teresshkin is a leader webmaster and disigner.

Mainly only three people work on the project (Belyakov, Tereshkin and I), but many volantires from Russia help us to expand the project. They families and names are listed on the contributions (credits) page.

[Michael H.W. Weber]

I understand and I think even more details have been discussed in yesterday's chat session.

Michael.

[Michael H.W. Weber]

1) I would like to know a few more more details about the "approximation method" you use for compression of the results data. My AMD XP2600+ requires around 30 minutes to complete this process. All this simply for saving bandwidth? Couldn't this calculation time be used better for dealing with the next WU? Why not send the data as standard .zip? With high-precision floating point quantum mechanical data - how is an accurate approximation (!) possible in this case? Is there absolutely no data loss? I would prefer to send big chunks of data containing the full data set instead of supplying data possibly holding only a fraction of the original information.

2) What effect does the selection of the approximation method during setup of the client have? I left it to "slow" as recommended. What happens if I set it to the other three options?

3) MD@home is really an excellent client as far as I can tell at this stage. I like it a lot.

Michael.

[Konstantin Leontiev]

1) The approximation is provided by Gaussians for three-dimensional probability distributions and one-dimensional correlation functions. The Main author of the approximation utility is Gennady Ionov - russian scientist from Kissegatch. He write this approximation utility (gapprox.exe) specially for MD@home project. This Utility is based on the Sheila framework. Sheila is a software development project of the Gennady Ionov's science team. If compression use only ZIP the results takes about 300-400Kb but approximation reduce it up to 25-30Kb and help some analysis to be performed. So we calculate Newton mechanics not quantum mechanics trajectories and trajectories is very unstable. This is a dynamical chaos because of R^-6 and R^-2 energy cores are present. So realy important only average values or time correlation functions.

We also use approximation because many users in Russia have only timed dial-up connections and pay for online time or outgoing traffic.

2) Huge=Fast, Slow=Tiny. Slow is recommended because gapprox.exe use in this mode only 5-6Mb of RAM. Fast or Huge is more (about 2 times) faster than Slow(Tiny) but need to work about 50-60Mb of RAM. The main idea of the DC projects is use least resources so Slow is Recommended.

3) Nice to read this... We try to make a good programm.

[Michael H.W. Weber]

We also use approximation because many users in Russia have only timed dial-up connections and pay for online time or outgoing traffic.

I understand this very well, however, if you want to compete on an international basis, then this is no argument. Therefore, in the first place - with such a project - you have to make sure that you get ALL the data at MAXIMUM precision. NO data loss allowed.

Michael.