Wieder Platz 5

[Pascal]

Mir kommt es so vor, als ob es fast um die Hälfte langsamer ist als das alte...

Ist es etwa. Werde morgen mal etwas genauer benchen.

[Michael H.W. Weber]

Hab's schon berichtet - halb so schnell wie das alte...

Michael.

[dentist]

Yo, hab es dann auch an anderer Stelle gelesen

[Falke]

Tja, und wieder mal auf den 5. Platz zurückgefallen. Gerade wo der Vorsprung wieder einigermaßen komfortabel war...

Ist aber auch zu dumm, dass wechselnde Mitglieder alle Strukturen mitnehmen.

[Michael H.W. Weber]

Wer ist denn diesmal abgesprungen?

Michael.

[trickfinger]

Wenn ich das richtig interpretiere, ist bei uns keiner abgesprungen.
AnandTech hat nur mit Alien einen neuen Mitstreiter bekommen, der 89 Mio Strukturen mitgebracht hat

Torsten

[Norman]

Hi!
Ich hab das mal ganz grob überschlagen und schätze dass wir die in 2 - 3 Wochen (trotz Alien) wieder verputzt haben !
schon werbung fürs team machen und alle Rechner einspannen



so long...

[Falke]

Ich hoffe nur, dass das nächste Protein nicht noch größer wird. Der Speicherverbrauch ist schon jetzt am Limit des Erträglichen (>120 MB). Noch mehr und ich müsste die Extra-RAM-Nutzung deaktivieren. Die meisten der Kisten haben ja leider nur 256 MB.

Mir war vor der Umstellung auch gar nicht klar, dass es so drastische Unterschiede in der Geschwindigkeit der einzelnen Proteine gibt. Es ist auf jeden Fall nicht gerade schlau, für die Ranglisten die Gesamtzahl der gefalteten Proteine zu nehmen. Wenn jemand erst jetzt einsteigt, wird er doch niemals diejenigen einholen können, die schon bei den schnellen Proteinen dabei waren...

[Norman]

Aber leider ist es so !
Ich denke auch daß die proteine nicht sonderlich kleiner werden, sondern eher noch größer werden. So im jetzigen Rahmen (Proteinsize> 120)! Das jetzige hat ja ne größe von 157 und ist fast doppelt so groß wie das vorgängerprotein (89).
Hoffe natürlich daß die dinger kleiner werden, dann wird natürlich schneller gerechnet werden können !



so long...

[Michael H.W. Weber]

1. Ich stimme Falke völlig zu, was die Mangelhaftigkeit des Statistiksystems betrifft. Leider haben wir darauf aber keinen Einfluß und haben uns ja auch in der Vergangenheit bemüht, besonders bei kleinen Proteinen wieder richtig aktiv zu werden - das Ganze also auch für unseren Vorteil ausgenutzt.
2. Wie gesagt ist das neue Protein doppelt so groß, wie das vorhergehende, daher verwundert es nicht, daß seine Berechnung auch doppelt so lange benötigt. Allerdings muß man dazu sagen, daß die Rechengeschwindigkeit nicht notwendigerweise mit der Proteingröße korrelieren muß. Wir hatten mehrmals den Fall, daß größere Proteine sogar schneller berechnet wurden, als kleinere. Das hängt vermutlich mit der Sekundärstrukturkomplexität zusammen.
3. Es war bislang davon auszugehen, daß in Zukunft eher größere Proteine ausgegeben werden - das hängt mit den einzelnen DF-Projektphasen zusammen. Allerdings sah ich diese heute noch einmal an und mußte feststellen, daß das DF-Projekt offensichtlich seine "roadmap" geändert hat. Details könnt ihr aber der DF-Mainpage entnehmen. Das CASP5-Projekt hat offensichtlich zu der Erkenntnis geführt, daß ein zufälliges "sampling" nicht ausreicht. Daher wurde der neue Algorithmus entwickelt. Ich VERMUTE, daß nun das Testen des neuen Algorithmus im Vordergrund steht. Um diesen testen zu können, muß man allerdings auch etwas zum Vergleichen haben, daher werkeln wir momentan noch mit dem alten Algorithmus herum - nehme ich an. In diesem Zusammenhang sei erwähnt, daß es ein 6. Betarelease gibt. Also scheint im Augenblick erst einmal wieder alles offen zu sein.

Meine Kisten glühen wieder,
Michael.

[fw77]

Auch ich bin erst seit 3 Wochen dabei und rechne erst seit dem 157er Protein mit. Habe s dadurch ziemlich schwer mich hochzurechnen. Aber was solls. Dafür stehn wir wieder auf Platz 4.

schönes WE

[fw77]

So wieder mal knapp 300.000 Strukturen auf den Weg gebracht. Wenn ich mir die Statistik der letzten Woche anschaue. Sieht es so aus das wir wohl bald wieder Platz 5 haben, da wir ca. 1 Mio pro Woche weniger machen. Es ist aber auch zu erkennen das man "The Knights Who Say Ni!" (falls die weiter nur 9 Mio pro Woche machen) in 12 Wochen überholen könnte. Da ich noch nicht so lange dabei bin kann ich natürlich nicht auf den ihre wirkliche Leistungskraft schließen. Rechnen die vielleicht in den Bunker?