Wieviele Proteine noch ?

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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Norman
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Wieviele Proteine noch ?

#1 Ungelesener Beitrag von Norman » 04.04.2003 17:04

hi !

Wieviele Proteine werden in der Phase 1b noch berechnet bzw. wieviele sind schon berechnet worden ?

Wird das Projekt nach erreichen ihres Zieles beendet oder werden die Forscher weitermachen und sich gegebenfalls anderen Projekten anschliessen ?

thx

so long... :wink:

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Patrick Keller
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#2 Ungelesener Beitrag von Patrick Keller » 04.04.2003 17:13

sagen wir mal so ... Proteine gibt es genug . und ich denke mal, dass die auch noch genügend Proteine haben ,di sie verwenden können ...
Brauchst bestimmt keine Angst haben, dass du wegen Proteinmangel nicht mehr falten kannst gg

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Michael H.W. Weber
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#3 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 04.04.2003 17:17

Eine genaue Beschreibung der einzelnen Projektphasen kannst Du der DF-Mainpage entnehmen. Mehr weiß ich jedenfalls auch nicht.

Wenn das Projekt erfolgreich abgeschlossen werden würde, so hieße das, daß man alle Proteinstrukturen berechnen könnte. Nun - und da hoffe ich doch, daß das dann auch getan wird. :smoking:

Michael.
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Pascal

#4 Ungelesener Beitrag von Pascal » 04.04.2003 17:22

Nach meiner Schätzung dürften wir etwa beim fünften Protein sein. Es gab aber erheblich mehr Updates, da schon mindestens dreimal der Algorithmus überarbeitet wurde und mindestens zwei Bugfixes kamen.

Dass die Proteine immer grösser, komplexer und damit schwieriger zu berechnen werden, ist bei DF so gewollt, um anfangs mehr Mitstreiber zu bekommen.

Ergo: Vielleicht werden wir bis Ende des Jahres die Phase Ib abschliessen und so langsam in Richtung des echten Blindtests gehen.

In diesem Sinne:

Happy Crunching!

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Norman
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thx !

#5 Ungelesener Beitrag von Norman » 04.04.2003 17:53

achso ...

irgendwann wird die rechenzeit für das protein so lange dauern wie bei UD, die ja bekanntlich llllaaaaaaaanngge dauert !



so long... :wink:

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fw77
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#6 Ungelesener Beitrag von fw77 » 15.04.2003 10:26

Gerade in einer der letzten BdW gelesen: Es gibt Millionen von Proteinen. Unsere Rechner werden also in unserem Leben sicher nicht mehr "arbeitslos".

:-?

fw77

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#7 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 15.04.2003 13:05

Korrekt. Ein Bakterium (Bacillus subtilis) hat z.B. ca. 4100 Proteine. :o

Michael.
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MaFi

#8 Ungelesener Beitrag von MaFi » 15.04.2003 16:28

fw77 hat geschrieben: Es gibt Millionen von Proteinen...
ich glaub es gibt viiiieeeeel mehr!
kurze rechnung:
es gibt 20 aminosäuren, die am bau von "handelsüblichen" proteinen beteiligt sind (wenn ich mich richtig an den bio-LK erinnere...). wenn man nun proteine von 100AS länge betrachtet mach das
20^100 = 1.6e130 :o
verschiedene ASsequenzen !!!
klar, das sind nicht alles gleich proteine, da fallen noch ein paar raus, wegen symmetrieen und so und weil viele davon evtl nicht stabil sind, aber immernoch erstaunlich

markus

NovaTec

#9 Ungelesener Beitrag von NovaTec » 15.04.2003 17:01

Meeeensch....*schnief*

ich komm mir hier vor wie im falschen film...
alles so megahirne hier....*schnief* und ich mit meinem armseeeeligeeen
real-abschluss...

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#10 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 15.04.2003 17:31

NovaTec hat geschrieben:ich mit meinem armseeeeligeeen real-abschluss...
Ach was - soll wohl reichen... :smoking:

Michael.
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#11 Ungelesener Beitrag von exec » 15.04.2003 23:30

@Novatech
Der Schulabschluß sagt nichts, über welchen Bildungsstand der Mensch verfügt.
Ich gehe zwar auf Gymnasium, dennoch habe ich Freunde aus der Realschule, die sich mit den selben Interessen beschäftigen.
Einen Nachteil hat, jedoch das Gymnasium, es wird alles intensiv und nur in der Planungsphase besprochen. Da hat man in der Realschule mehr Kontakt zum Real Life.
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Aktive Projekte: Seventeen or Bust
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#12 Ungelesener Beitrag von fw77 » 16.04.2003 11:21

Hm, also laut diesem Artikel in der BdW gibt es "nur" 500000 Proteine. Nur 8500 sind näher bekannt. Habe den Artikel jetzt nicht da, aber werde bald mal was genaueres schreiben. Mich wundert das dieser Artikel hier scheinbar noch keine Thema war. Die Ausgabe ist vom Februar. Auch Folding@home wurde erwähnt, leider jedoch ohne mal eine Inet-adresse zu nennen.
:-?

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