wie kann ich offline falten

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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fw77
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wie kann ich offline falten

#1 Ungelesener Beitrag von fw77 » 02.04.2003 14:20

Hallo,

ich würde euch gerne unterstützen. Ich habe bis jetzt leider kaum Ahnung wie hier alles funktioniert. Da ich Internetanschluß nur hier in der Uni habe, möchte ich bei mir zu Hause falten. Was muß ich mit nach Hause nehmen (bzw. wieder mit in den Computerpool), damit ich meinen Rechner zu Hause auslasten kann? Ich möchte auch nicht nur 5000 oder 10000 Struckturen mit heim nehmen sondern mehr.

Würde mich feruen wenn Ihr mir helfen könntet. Bitte möglichst einfach, daich (noch?) Laie auf dem Gebiet bin.

fw77 :D

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S_Garbe
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#2 Ungelesener Beitrag von S_Garbe » 02.04.2003 17:49

wenn Du den Textclient verwendest dann findest Du hier die benötigten Infos um den Client korrekt zu konfigurieren.

für Deinen heimischen Rechner benötigst Du die distribfold-current-win9x.zip (Textclient) - einfach in ein leeres Verzeichnis entpacken

zum hochladen der Ergebnisse:
wenn Du nicht gerade Disketten für den Transfer der Daten nimmst, ist es am einfachsten, das ganze Verzeichnis mitzunehmen
wenn Du allerdings auf Disketten angewiesen bist, dann brauchst du alle .val.bz2 , alle .log.bz2 und die filelist.txt - das setzt natürlich vorraus, das auf dem Rechner von dem der Transfer stattfinden soll der Client vorhanden ist

Gruß
Stefan
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Bananeweizen
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Re: wie kann ich offline falten

#3 Ungelesener Beitrag von Bananeweizen » 02.04.2003 19:16

fw77 hat geschrieben:Ich möchte auch nicht nur 5000 oder 10000 Struckturen mit heim nehmen sondern mehr.
Der Client erzeugt seine Daten zufällig. D.h. du kannst ihn beliebig lange (bis zum nächsten Proteinwechsel) daheim laufen lassen und brauchst dann nur die Ergebnisse zurückschaffen.

Ciao, Michael.

mozart
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mit 'nem packer

#4 Ungelesener Beitrag von mozart » 02.04.2003 19:22

Hi

Ich muss das mit einer maschine leider auch so machen, die geht nrigends an's netz. Ich habe mir mit winrar ein profil erstellt wo er alle nötigen sachen in diskettengrösse presst, allerdings so 2-3 disk's sind das immer.
Das ganze als selbstentpackung und dann fluppts halbwegs.
cu mozart

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Norman
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aha

#5 Ungelesener Beitrag von Norman » 02.04.2003 19:23

@Bananeweizen

Was passiert denn, wenn man zu lange bunkert ?
Werden die Ergebnisse dann verworfen, nicht angerechnet, verfallen die oder wie funzt das ?

thx

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#6 Ungelesener Beitrag von Bananeweizen » 02.04.2003 19:25

Alle paar Wochen gibt es einen neuen Client, der ein anderes Protein berechnet. Von diesem Zeitpunkt an werden die alten Daten 24 Stunden mit voller, weitere 24 Stunden mit halber Punktzahl gewertet.

Ciao, Michael.

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zu dem falten ?!

#7 Ungelesener Beitrag von Norman » 03.04.2003 05:55

Hi !
Wenn der client die proteine nach einem zufälligem Schema falltet,
dann kommt es doch sehr häufig zu mehrfachen Ergebnissen bei DF oder nicht ?

Pascal

Re: zu dem falten ?!

#8 Ungelesener Beitrag von Pascal » 03.04.2003 06:01

Norman hat geschrieben:Hi !
Wenn der client die proteine nach einem zufälligem Schema falltet,
dann kommt es doch sehr häufig zu mehrfachen Ergebnissen bei DF oder nicht ?
Neulich sagte BrianTheFist, dass (mit dem bisherigen Client) der Anteil der doppelten Strukturen etwa 5 bis 10 Prozent beträgt.

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fw77
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#9 Ungelesener Beitrag von fw77 » 03.04.2003 09:24

Danke für die hilfreichen Antworten. Ich bin zum Glück mit einem Zip gesegnet und brauche nicht auf Disketten zurückzugreifen. Dann werde ich das mal übers Wochenende testen und melde mich Montag wieder.

Schönes WE
fw77

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#10 Ungelesener Beitrag von GooRoo » 03.04.2003 11:28

:shocked!: Schönes Wochenende?!?!?

Tztztz....Studenten :wink: Jaja...das waren noch Zeiten als man nur mit dem Kopf geschüttelt hat wenn einer Freitags Veranstaltungen hatte, bzw. hingegangen ist. *schwelg*

Schönes WE und lass es krachen 8)

Es grüßt der neidische
GooRoo

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#11 Ungelesener Beitrag von fw77 » 03.04.2003 11:59

Ich hab schon ein paar Semester mehr oder weniger fleißig studiert. Jetzt ist erst mal ein paar Wochen Ruhe angesagt. Schließlich muß man ja Kräfte sammeln für die Diplomarbeit.

Noch eine Frage zu dem upload. meine Rechner daheim faltet schon. Wenn ich den client beende kann natürlich keine Verbindung zum Netz hergestellt werden und ich bekomme eine entsprechende Fehlermeldung. Die Daten gehen werden aber gespeichert. Wenn ich das ganze jetzt uploaden will, muß ich dann einfach auf einem Rechner mit Internetzugang das Verzeichnis von Daheim bringen und die folding.bat starten? Die buffered Sets werden dann sofort übertragen? Oder erst nach dem Beenden des Clienten?

Ich habe festgestellt, dass auf dem Rechner zuhause nur ca. 25% der CPU Leistung ausgenutzt werden. Wie kann ich das erhöhen?
Ich habe einen PIII 866, mit 128 MB (ich weiß viel zu wenig) RAM.

Wenn heute der Wechsel kommt, wird mein Rechner daheim wohl umsonst rechnen, da ich heute nicht mehr ins netz komme. :cry2:

fw77

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#12 Ungelesener Beitrag von S_Garbe » 03.04.2003 12:20

in der foldit.bat gibt es irgendwo die Zeile
\foldtrajlite -f protein -n native -df -rt
wenn Du da noch -if dahinterschreibst versucht er gar nicht erst eine Internetverbindung aufzubauen
wenn Du statt dessen -ut dahinterschreibst startet er nur den Upload
wenn du nur 128 MB hast solltest Du das -rt weglassen - sonst swappt er nur wild auf der Platte rum

die Daten von heute kannst Du morgen immer noch hochladen (werden noch voll angerechnet) nur morgen bringt es nicht gar so viel für DF zu rechnen- das Update wird wohl erst gegen 23 Uhr ankommen und Du wirst dann ja vor Montag nicht wieder hochladen

Gruß
Stefan
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