Frage zu: mehr Daten bunkern...

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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NovaTec

Frage zu: mehr Daten bunkern...

#1 Ungelesener Beitrag von NovaTec » 28.01.2003 09:56

Hi,

es gibt ja eine Funktion das man mehr daten bunkern kann (für modem-Nutzer)
Jetzt meine Frage: wie schicke ich diese denn dann ab? Er tut ja nach dieser einstellung nicht mehr automatisch den Server suchen.
Ich habe auf diese weise schon an die 600.000 Strukturen gemacht, un als ich dann sie irgendwie loswerden wollte und das Buffer more data wieder deaktiviert hab sind alle meine Strukturen wieder auf null gewesen ohne das es sie abgeschickt hat...

Wie oder Was soll ich nun machen?
Ich habe nämlich 1. Keine lust jede 6 Cashes wieder online zu gehen...
dauert ja gerademal ein paar std..
Gruß
NovaTec

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Michael H.W. Weber
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#2 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 28.01.2003 10:00

Besorge Dir mal flugs dfGUI. Und bitte beachten: Heute soll laut "news"-Sektion der DF-Mainpage das Protein gewechselt werden - also den alten Plunder bitte hochladen...

Michael.
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Moy
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#3 Ungelesener Beitrag von Moy » 28.01.2003 12:51

Huch ! Heute schonwieder Proteinwechsel ? Vielleicht sollte ich mir ja doch mal die original-Seiten durchlesen !
Eine Frage dazu: Wäre es eigentlich nicht sinnvoller, ein Protein solange zu falten, bis man den RMS-Wert deutlich gesenkt hat ? Ein Wert von 7,ungerade nützt doch eigentlich keinem was... Oder verstehe ich da was falsch ?

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Michael H.W. Weber
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#4 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 28.01.2003 13:58

Wichtig ist, daß die Zahl der generierten Strukturen INSGESAMT hoch genug ist, da erst dann die Wahrscheinlichkeit gegeben ist, eine gute Struktur gefunden zu haben. Was beim Einzelnen dabei herauskommt ist eher nebensächlich. Mal hat der eine die beste gefunden, mal jemand anderes.

Michael.
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Pascal

#5 Ungelesener Beitrag von Pascal » 28.01.2003 14:01

@NovaTec: Schau dich doch einfach mal auf der Webseite oder hier im Forum um, da gibt es z.B, einen Thread Optimierung des Clients, welcher viele Informationen hergibt :wink:

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Drakhon
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#6 Ungelesener Beitrag von Drakhon » 28.01.2003 15:31

Moy : Derzeit liegt der beste RMS bei 6.53, das ist eigentlich ganz ok. Einen besseren RMSD zu bekommen würde wahrscheinlich seeehr viel mehr Strukturen erfordern, da die Funktion
Anzahl an Strukturen -> RMSD soweit ich das noch richtig in Erinnerung hab logarithmisch steigt. Das bedeutet also das das eine deutliche erhöhung der Strukturen nur zu einer geringen Verbesserung ees RMSD führen würde.

Soweit ich weiss stand das mal irgendwo im FreeDC Forum, aber mich darf hier gern jemand korregieren falls ich hier Blödsinn erzähle.
Aktuelles Projekt: Distributed Folding

NovaTec

#7 Ungelesener Beitrag von NovaTec » 28.01.2003 18:46

Sorry Pascal aber ich hab von dem Grafik-Clienten gesprochen!!!
Schei... drauf, hab mir gerade den Text-Clienten gezogen und dieses Gui-fiech dazu. Hab die "tuning-Schritte" gemacht. Mal schauen was passiert.
...naja, 3000 Struktures/Std. ich glaub das ist ok...odä?
(AMD Athlon XP 1800+/256MB DDR 333Mhz)

Gruß
NovaTec

PS: Danke...an alle

Pascal

#8 Ungelesener Beitrag von Pascal » 28.01.2003 18:53

@Novatec: mit dem Textclient machst du etwa 10000/Stunde. Nur so als Anmerkung. :wink:

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#9 Ungelesener Beitrag von GooRoo » 28.01.2003 19:12

3000/Stunde ist definitiv zu wenig!

Das Benchmark hier ist von meinem leicht übertakteten XP1800+

------------------------------------------------------------
Distributed Folding Windows dfGUI v1.91 Benchmark

Sample Size : 5500 structures over 1658 seconds.
Protein Size: 108AA

Structures Per Second: 3.33
Structures Per Minute: 200.0
Structures Per Hour : 12000
Structures Per Day : 288000

OS : Windows 2000 MHz: 1650
CPU: AMD Athlon(tm) XP 2000+
Client Switches: -df -rt -g 100 -s 5000
------------------------------------------------------------

'n bischen mehr wär sicher noch drin, da die Box nie Idle ist

Grüße
GooRoo
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NovaTec

#10 Ungelesener Beitrag von NovaTec » 29.01.2003 08:47

hab auch gerade gemerkt, das das zu langsam ist... ich hab ja selbst beim grafik-clienten mehr als 200.000/Tag geschaft... nun schaffe ich gerademal 75.000/Tag.
mhhh... woran kann das liegen?
ich hab schließlich die -rt -q 5 etc drangesetzt.

Gruß
NovaTec

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#11 Ungelesener Beitrag von GooRoo » 29.01.2003 10:13

Hmm...das sollte eigentlich deutlich schneller gehen, wenn dein Client tatsächlich in Realtime (-rt) läuft.

Hast du mal den Taskmanager aufgemacht und geschaut wieviel CPU-Nutzung in % der foldtrajlite Prozess hat? Hast du genug freien Speicher für -rt? Zockst du nebenher oder hast sonst einen Speicher-, CPU-Intensiven Prozess im Hintergrund laufen?

GooRoo
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#12 Ungelesener Beitrag von S_Garbe » 29.01.2003 13:27

was hast Du für ein Betriebssystem? - bei den letzten DF-Versionen ist mir unter Win98 aufgefallen, das der Client freiwillig nicht mehr 100% Leistung abfordert, sondern der Idle-Task immer noch zwischen 50 und 80 % hatte - Abhilfe hat bei mir der Parameter -p -15 (von -5 bis -20 ) gebracht - da muß man etwas rumprobieren, denn bei -p -20 reagiert der Rechner nicht mehr so besonders schnell

Gruß
Stefan
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