Preview: Next Generation

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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GooRoo
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Preview: Next Generation

#1 Ungelesener Beitrag von GooRoo » 16.01.2003 18:36

Namd zusammen!

Howard hat im Free-DC Forum eine Diskussion gestartet, wie der Client und Stats modifiziert werden müssen um der neue Algorithmus-Generation zu genügen. Weiterhin kann man Vorschläge machen, die in den neuen Client eingearbeitet werden können. Wenn also jemand ne richtig gute Idee hat ist nun die Zeit um Sie umsetzen zu lassen!

Grob gesagt ist geplant:

- Ein Resuming des Client. Der Client rechnet dort weiter wo er aufgehört hat. Also keine verlorenen Strukturen mehr nach Absturz, Stromausfall. Der Bunker kann also in Ruhe voll gemacht werden
- Das Statistik System muss umgebaut werden, da der neue Algo nicht vergleichbar mit dem jetzigen sein wird. Wahrscheinlich ist, dass es einen Reset der Statistiken geben wird (was natürlich keinen freut, schon gar nicht die Statistik-Huren unter uns, aber was dem Projekt nützt ist richtig, hmm?!) Uns kann es nur recht sein, da es unseren Aufstieg auf Platz 2 beschleunigt, da wir (soweit ich das im Kopf habe) die 2. höchste Tagesproduktion haben :smoking: :smoking: :smoking: Leute das ist SEHR cool!
- Strukturen werden nicht mehr linear berechnet. Die Komplexität der Strukturen und des Algorithmus steigt mit Laufzeit des Client
- ...

Aber seht selbst

Das Topic ist etwas arg Konfus, hoffe ich hab alles richtig wiedergegeben :roll:

Schöne Grüße
GooRoo
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Zahmekoses
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#2 Ungelesener Beitrag von Zahmekoses » 16.01.2003 21:06

juhu :)

ich kriege Pascal schneller als geplant *gg*

cya
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Velociraptor
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#3 Ungelesener Beitrag von Velociraptor » 16.01.2003 23:54

heisst das vielleicht das der neue client ne evolutionäre software hat ?? :-?
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M. Franckenstein
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#4 Ungelesener Beitrag von M. Franckenstein » 17.01.2003 00:45

hört sich alles sehr gut an .... bei meinem 24/7 run des clienten wird das sicherlich was bringen *g*

JE1SUS

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Michael H.W. Weber
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#5 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 17.01.2003 10:22

Velociraptor hat geschrieben:heisst das vielleicht das der neue client ne evolutionäre software hat ?? :-?
Das hatte Howard in der Tat mal erwähnt. :P

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mwannema

#6 Ungelesener Beitrag von mwannema » 17.01.2003 11:48

und was heist das dann ?

gruss
wanne

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#7 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 18.01.2003 11:24

Das heißt, daß sich der Algorithmus im Verlaufe der Proteinstrukturgenerierung selbst optimiert. :P

Michael.
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mwannema

#8 Ungelesener Beitrag von mwannema » 18.01.2003 12:01

auf gut deutsch =>

heist also dann das die RMSD werte bei jedem besser werden müssten oder ?

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#9 Ungelesener Beitrag von Velociraptor » 18.01.2003 15:43

mwannema hat geschrieben:auf gut deutsch =>

heist also dann das die RMSD werte bei jedem besser werden müssten oder ?
ja denke schon :) aber was ich mich frag da wird doch der ornder grösser mit der zeit oder ? und gelten dann die ermittelten werte auch für das nächste protein (?) oder halt für den nächsten clienten? :-?
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Pascal

#10 Ungelesener Beitrag von Pascal » 18.01.2003 15:55

Velociraptor hat geschrieben:
mwannema hat geschrieben:auf gut deutsch =>

heist also dann das die RMSD werte bei jedem besser werden müssten oder ?
ja denke schon :) aber was ich mich frag da wird doch der ornder grösser mit der zeit oder ? und gelten dann die ermittelten werte auch für das nächste protein (?) oder halt für den nächsten clienten? :-?
Den RMSD zu minimieren - ergo, die originale Proteinstruktur möglichst genau künstlich zu reproduzieren - ist das Ziel des Projekts.
Der übliche Gang war immer der, dass es den gleichen Client mit einem neuen Protein gab (Updates wegen Fehler im Client gabs natürlich auch - waren aber nicht planmässig)
Wenn der Client sich nun optimiert - d.h. einen genetischen Algorithmus (eines meiner Lieblingswörter inzwischen *g*) hat, stellt sich nun die Frage, ob dieser auf das Protein bezogen ist oder nicht.

Wäre er vom Protein abhängig - wäre es sehr schade für die weitere Forschung - wäre er das nicht - umso besser!

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#11 Ungelesener Beitrag von Velociraptor » 18.01.2003 16:09

wie siehts mit den zukünftlichen updates der clients aus muss ich mir wieder jeden (hausnummer) monat 10 mb runter zappen oder wird updates mit "nur" sagen wir 10kb geben wo die neu zu berechnende strucktur drin steht ? so hats jemand verstanden ? :worry: falls nicht formulier ichs noch um :D
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#12 Ungelesener Beitrag von M. Franckenstein » 18.01.2003 16:56

schöner wirds mit 10 KB wobei ich denke das sich größere downloads nicht verhindern lassen werden .... wenn die dinger aber größer werden so wird die berechnung sicherlich auch länger, d.h. das sich doch dann die download-intervalle veringern müssten, oder?

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