Unterschied DF und F@H ??

Analyse und Vorhersage von Struktur und Faltungsweg (Folding@home, GPUGRID, Rosetta@home, ...)
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Boss
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Unterschied DF und F@H ??

#1 Ungelesener Beitrag von Boss » 04.01.2003 12:19

Moin, moin.
Hab mal ne ganz blöde Frage. Mir ist immer noch nicht klar, was jetzt der Unterschied zwischen DF und F@H ist. Aus den Beschreibungen werd ich nicht ganz schlau :blush:
Für Antworten wäre ich dankbar.

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Zahmekoses
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#2 Ungelesener Beitrag von Zahmekoses » 05.01.2003 11:36

sorry da kann ich dir leider nicht helfen :(

Sind eigentlich ja beide das selbe, aber gleichzeitig sind sie auch verschiedene Sachen...

*zuckt mit den Schultern*

Auf jeden Fall sind wir beim DF ganz oben mitdabei :)

cya
Zahme

P.S. Platz 2 wir kommen :) (Mai 2003 sollen wir nach Zerothelement Platz 2 haben :) )
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#3 Ungelesener Beitrag von S_Garbe » 05.01.2003 11:42

bei DF wird versucht die entgültige Gestalt (räumliche Anordnung der Atome) eines Proteins vorherzusagen

bei FAH wird der Weg untersucht wie das Protein vom entfalteden zum gefalteden Zustand kommt - die entgültige Gestalt ist dabei nur ein Abfallprodukt - allerdings dauert diese Simulation Ewigkeiten

Gruß
Stefan
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#4 Ungelesener Beitrag von Midon » 05.01.2003 12:41

Stefan hat es zwar schon erklärt. Ich will noch ein paar Gründe hinterherschieben.

Die Faltung eines Proteins ist ein sogenanntes quantenmachanisches Mehrkörper- oder Vielkörperproblem :crazyeyes:.
Und damit selbst mit den schnellsten Rechnern der Welt, ab einer gewissen sehr geringen Anzahl von Atomen, nicht mehr lösbar.

Die Funktion von Proteinen hängt vor allem von der Art der Faltung ab. Vereinfacht gesagt muß das sogenannte Aktive Zentrum des Proteins die richtige Form haben damit es funktioniert. Man kann díe Form des Proteins zur Zeit nur durch sehr aufwendige Röntgenstrukturanalysen :silly: bestimmen. Das Ziel von Distributed Folding ist es zu beweisen das man mit mit einem neuen (immer noch aufwendigen) Algorithmus die entgültige Form eines Proteins rechnerisch bestimmen kann.

Nachdem sich ein Protein gefaltet hat befindet es sich in einem Zustand der von der Energie her gesehen in einem Minimum befindet. Wenn nicht, würde es sich solange verändern bis es sich in einem befindet. Das ist dann ein zeitabhängiges quantenmechanisches Vielkörperproblem :gocrazy: :banghead:. Das will Folding@home lösen.

Zum Beispiel wird vermutet das BSE und die ganzen ähnlichen Krankheiten von einem sogenannten Prion erzeugt werden. Das ist nichts anderes als ein Protein das sich umgefaltet hat und dadurch total anders wirkt. Leider wirkt das Prion autokalaytisch, d.h. es bringt Proteine in der Umgebung dazu sich ebenfalls umzufalten. Die Verklumpen und zerstören dann mit der Zeit das Gehirn. Dazu ist es natürlich notwenig zu verstehen wie die Proteine falten.

Ich hoffe ich habe jetzt genug Verwirrung verursacht. :beer:

Servus
Werner

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Achso

#5 Ungelesener Beitrag von Boss » 05.01.2003 17:06

@Midon:
Na dann ist ja alles klar :3d: :zzz:

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#6 Ungelesener Beitrag von Midon » 06.01.2003 09:32

Dann ist der Zweck ja erfüllt. :wink:

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#7 Ungelesener Beitrag von Michael H.W. Weber » 07.01.2003 17:32

Es finden sich hier im Forum auch sehr ausführliche Artikel zu diesem Thema - mußt mal etwas "buddeln". :lol:

Michael.
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