Wechsel?

[Athlonkaempfer]

Da es Sengent nicht hinbekommt einen lauffähigen Klienten zu stellen, überlege ich das Projekt zu wechseln.
Zur Zeit schmiert der alle 10 Berechnungen ab.
Wieviele Strukturen schafft man den durchschnittlich mit einem 1800+
Hätte zwei davon, einen 700 Athlon und einen 700 P3

Der DF Klient läuft doch rockstable oder?

[Pascal]

Stable as a rock - das ist wohl wahr.

Der Client skaliert im prinzip mit dem CPU-Takt. Auf meinem Athlon TB-C 1.2 GHz schaffe ich so 100k in 24 h.

Dann kannst du dirs ja ausrechnen, also der 700er etwa 50 bis 55k /Tag.

[Michael H.W. Weber]

Da es Sengent nicht hinbekommt einen lauffähigen Klienten zu stellen, überlege ich das Projekt zu wechseln.
Zur Zeit schmiert der alle 10 Berechnungen ab.
Wieviele Strukturen schafft man den durchschnittlich mit einem 1800+
Hätte zwei davon, einen 700 Athlon und einen 700 P3

Der DF Klient läuft doch rockstable oder?

Also, daß nenne ich signifikante Rechenpower! Meine Schätzung für das aktuelle Protein:

XP1800+: 120.000 pro Tag
700er: 50.000 pro Tag

Also ca. 2.3 Millionen Strukturen pro Woche. Wir können jede Hilfe brauchen!

Michael.

[Athlonkaempfer]

Habe gerade den Textclienten in Betrieb genommen.
Mal schauen wie es läuft.
Der dfgui als Zusatztool macht einen guten Eindruck

[Athlonkaempfer]

Habe gerade die Optimierungshinweise gelesen.
Wenn ich das gerade richtig verstanden habe berechnet der Klient unter -g0 Blind.
Mann kann ihn gar nicht überwachen?

[S_Garbe]

@Athlonkaempfer - wenn Du sowohl -qt als auch -g0 angibst, dann siehst Du nur die fertigen Strukturen die er bunkert wenn Du nicht dauernd online bist (mir persönlich reicht das)

Gruß
Stefan

[GooRoo]

Die 120.000 Strukturen für das derzeitige Protein pro 1800XP Box kann ich bestätigen.

Hab noch nen P3 866 im Rennen der irgendwas um die 65.000 Strukturen macht.

@Athlonkaempfer

Herzlich Willkommen und Happy Folding

Grüße
GooRoo

[Athlonkaempfer]

Habe meinen Hauptrechner heute für DF abgestellt.
Ein 1800XP@2000
Wie läuft DF eigendlich ab?
Da steht immer Protein Size 129.
Wann wechselt das Protein?

[Pascal]

Habe meinen Hauptrechner heute für DF abgestellt.
Ein 1800XP@2000
Wie läuft DF eigendlich ab?
Da steht immer Protein Size 129.
Wann wechselt das Protein?

Aktuell sind knapp über 6 Mrd des aktuellen Proteins abgearbeitet. Pro Protein werden es 10 Mrd sein, von diesen Proteinen werden weitere sieben noch kommen.

Das nächste Protein kommt in etwa drei Wochen. Oder schätzt jemand anders?

[Athlonkaempfer]

Aktuell sind knapp über 6 Mrd des aktuellen Proteins abgearbeitet. Pro Protein werden es 10 Mrd sein, von diesen Proteinen werden weitere sieben noch kommen.

Ist DF danach beendet?

[Pascal]

Ist DF danach beendet?

Nein, dann ist erst Phase Ib beendet. Dann folgen noch Phasen II mit Quasi-Blindtest und III mit echtem Bindtest von Proteinen.
Die aktuelle Phase ist nach wie vor genaugenommen nur zum Test des Clients bezüglich der Optimierung der Proteine.
Genaueres könnte dir aber MHWW berichten. Lies dich durchs Forum und die Projektbeschreibungen, dann wird dir einiges klar.

Faltet ran!

[Michael H.W. Weber]

Ich gehe auf der Grundlage der aktuellen Teilnehmerzahlen sowie der anvisierten Projektvorhaben (vgl. Ankündigungen auf der DF-Website) davon aus, daß DF noch mindestens zwei Jahre laufen wird. Danach - denke ich - wird der DF-Algorithmus auf Basis unserer Berechnungen verändert worden sein und es dürfte anstehen, daß erneut an CASP teilgenommen wird (Nr. 6), um den Verbesserungen auf den Zahn zu fühlen.

Michael.