Files??

[Velociraptor]

was is mit den *.val.biz-datein oder so ??? warum werden die nicht auch versendet??

[Zeuge]

Die *.log.bz2 und die *.val.bz2 Dateien werden immer gemeinsam verschickt!

Momentan ist wegen eines Proteinwechsels der Server nicht erreichbar.
Deshalb sollten bei Dir immer Dateipärchen vorhanden sein.
Am besten stoppst Du den Clienten NICHT bevor der Server wieder erreichbar ist.

Falls dann nach dem Beenden / Upload der Daten immer noch *.bz2 Dateien im Verzeichnis rumliegen melde Dich nochmal.

[Velociraptor]

na ich mein nur weil die liegen schon länger da (einzeln) und das find ich blöd denn das sind sicher mehr als 20000 "Rechnungen"

[Velociraptor]

also die files sind noch immer nicht weg obwohl ich alle strukts weggeschickt hab ?? was mach ich jetzt mit dem ? muss ich die löschen?

[S_Garbe]

wenn da .val.bz2 ohne zugehörige .log.bz2 rumliegen, dann stammen die im allgemeinen von Abstürzen - die .val.bz2 enthalten nur die Struktur einer Faltungsvorhersage (d.h. die beste Struktur die Für das aktuelle Strukturset zum Zeitpunkt des Absturzes gefunden wurde)- keinerlei Angaben wieviel Strukturen berechnet wurden - die kannst Du also löschen, da sie vom Server nicht akzeptiert werden

Gruß
Stefan

[Athlonkaempfer]

Hätte da auch eine Frage.
Mein Klient rechnet sauber vor sich hin, läd neue Daten herunter, aber keine Strukturen hoch.
Habe einen Error Text gefunden wo meine Upload versuche dokomentiert sind.
Will einfach nicht gehen.
Auszug:

• ERROR: [000.000] {foldtrajlite.c, line 4739} Error during upload: STATUS 907 FOLD LOG PARSE ERROR/UNKNOWN HANDLE

Beim herunterladen neuer Dateien erkennt er mein HANDLE an.
Weis da jemand was zu tun ist?[/list]

[Michael H.W. Weber]

Mein Klient rechnet sauber vor sich hin, läd neue Daten herunter, aber keine Strukturen hoch.
Habe einen Error Text gefunden wo meine Upload versuche dokomentiert sind.
Will einfach nicht gehen.
Auszug:

• ERROR: [000.000] {foldtrajlite.c, line 4739} Error during upload: STATUS 907 FOLD LOG PARSE ERROR/UNKNOWN HANDLE

Beim herunterladen neuer Dateien erkennt er mein HANDLE an.
Weis da jemand was zu tun ist?

Zunächst einmal lädt DF im Augenblick überhaupt nichts herunter - das passiert NUR bei einem Proteinwechsel. Du holst Dir den komprimierten Client, entpackst und startest. Dann wirst Du nach Deinem "handle" gefragt. Das gibst Du ein und dann läuft der Client an. Soweit ich weiß, gibt es keinerlei Überprüfung Deines "handles" während dieses Prozesses. Fehlemeldungen, die sich auf das "handle" beziehen sind oft mit Serverproblemen verbunden ODER zeigen tatsächlich an, daß Dein "handle" nicht korrekt ist. Um das zu prüfen, gehst Du auf die DF Website und loggst Dich unter "high-flyers" ÜBER DEIN "HANDLE" (!) ein. Wenn das klappt, dann sollte mit dem "handle" alles in Ordnung sein. Probier das bitte mal aus und melde Dich dann hier nochmal.

Michael.

[Athlonkaempfer]

Gesagt getan, konnte mich über mein HANDLE einloggen.

Mein eigendliches Problem ist, ausser am ersten Tag keine Strukturen hochladen konnte.
Steht immer noch auf 31.000
Im oberen Teil des Threads, laß ich nun as es sich bei den .val.bz2 & .log.bz2
um fertige Berechnungen handelt.
Davon habe ich eine menge in meinem DF Verzeichnis.
Wie bewege ich nun den Klienten dazu sie auch abzuschicken?
Neue Strukturen läd er nach.

[GooRoo]

Tja...irgenjemand hat deinem Client erzählt, er habe keine pemanente Internetverbindung. D.h. dein Client lädt nicht hoch, weil er glaubt nicht online zu sein.

Wenn du über die Konsole startest musst du die foldit.bat so anpassen, dass der Programmaufruf folgendermaßen lautet:

.\foldtrajlite -f protein -n native -df -rt

Der Aufruf kann natürlich leicht varriieren, je nach Konfiguration. Wichtig ist, dass die Schalter -if und -u nicht gesetzt sind. Näheres dazu hier.

Wenn du mit DistFold GUI arbeitest muss das Häkchen bei Disable Net Access weg. Dann sollte er deine Strukturen hochladen.

Viel Erfolg
GooRoo

[Michael H.W. Weber]

Neue Strukturen läd er nach.

Noch einmal: DF lädt nichts nach. Du erzeugst die ganze Zeit für eine einzige Vorgabeaminosäuresequenz Strukturmodelle.

Was das "upload"-Problem betrifft, so nehme ich inzwischen - nachdem Dein "handle" ja ganz klar funktioniert - wie GooRoo an, daß Du irgendwie den Client so eingestellt hast, daß er denkt, keinen Internetzugriff zu haben. Dazu gibt es in der Tat Kommandozeilenparameter. Wie die sich allerdings bei Dir eingeschlichen haben, ist mir unklar. Besorge Dir doch am bequemsten dfGUI - ein Monitorprogramm für DF, wo man alle nötigen Optionen durch simples Häkchensetzen einstellen kann.

Michael.

[Athlonkaempfer]

Als Befehlszeile habe ich gestern:
.\foldtrajlite -f protein -n native -df -g 0 -rt -qt
gesetzt.
Wollte damit auch nicht.

Nutze dfGUI dort befindet sich kein Hacken an Disable Net Access.

Leider trifft beides nicht zu.

[Bananeweizen]

Dann wird es an deiner files.txt liegen, der Fehler heißt ja auch

STATUS 907 FOLD LOG PARSE ERROR...

Beende mal den Client, sicher die filelist.txt irgendwohin, lösche sie im DF-Verzeichnis und erzeuge nach folgender Anleitung eine neue filelist.txt:

dir *.bz2 /od /b >filelist.txt

anschließend den Eintrag rotlib.bin.bz2 aus der Filelist rauslöschen und CurrentStruc 999999 drunterscheiben (falls weniger als 1Mio. Strukturen)
irgendwo hab ich für sowas ein VB-Script rumfliegen

Starte jetzt mal neu und schau, ob er was hochlädt. Nimm aber vorher "-qt" aus deiner Batch raus, damit du siehst, was er dir zu sagen hat.

Ciao, Michael.